【摘要】：目的:明確中藥提取物人參皂苷Rh1對乳腺癌SKBR3細胞活性的影響,確定中藥提取物人參皂苷Rh1對乳腺癌SKBR3細胞干預的最佳藥物劑量;篩查在中藥提取物人參皂苷Rh1干預下乳腺癌SKBR3細胞中差異表達的基因,并運用生物信息學對差異表達基因的功能及相關信號通路進行分析。材料與方法:應用MTS方法培養(yǎng)乳腺癌SKBR3細胞,明確中藥提取物人參皂苷Rh1對乳腺癌SKBR3細胞活性的影響,確定中藥提取物人參皂苷Rh1對乳腺癌SKBR3細胞干預的最佳藥物劑量;應用高通量測序技術篩查在中藥提取物人參皂苷Rh1的干預下乳腺癌SKBR3細胞中差異表達的基因,并應用生物信息學對差異表達基因的功能及相關信號通路進行分析。結果:1.MTS結果發(fā)現:500μM中藥提取物人參皂苷Rh1在24小時、48小時對乳腺癌SKBR3細胞的活性有明顯抑制作用,且差異具有統(tǒng)計學意義。2.高通量測序結果發(fā)現:在中藥提取物人參皂苷Rh1的干預下,乳腺癌SKBR3細胞中差異表達的基因6580個,包括上調的差異表達基因3403個。下調的差異表達基因3177個。經NCBI數據庫注釋后,篩查出的差異表達基因中m RNA和lnc RNA分別為5967個和451個;KEGG生物通路富集分析發(fā)現:差異表達基因在人類乳頭瘤病毒感染、剪接體、細胞凋亡、p53信號通路、TNF信號通路等信號通路中結果顯著;GO生物通路富集分析發(fā)現:差異表達基因在調節(jié)細胞外基質的組成、輔因子結合、內質網內腔、核糖核蛋白復合物的生物合成、GDP結合、染色體區(qū)域等基因功能中結果顯著。結論:1.500μM中藥提取物人參皂苷Rh1在24小時和48小時對乳腺癌SKBR3細胞的活性具有顯著的抑制作用。2.中藥提取物人參皂苷Rh1可能通過干預人類乳頭瘤病毒感染、剪接體、細胞凋亡、p53信號通路、TNF信號通路等信號通路對SKBR3細胞的活性進行抑制。3.中藥提取物人參皂苷Rh1可能通過調節(jié)細胞外基質的組成、輔因子結合、內質網內腔、核糖核蛋白復合物的生物合成、GDP結合、染色體區(qū)域等基因功能對SKBR3細胞活性進行抑制。
【圖文】：

圖 2 毛細管電泳法檢測 RNA 完整性樣品編號 樣品名稱 RIN 28S/18S S17101003 SKBR1-1 9.0 1.26 S17101004 SKBR1-2 9.8 1.6 S17101005 SKBR1-3 9.6 1.57 S17101006 SKBR1-RH1-1 8.8 0.79 S17101007 SKBR1-RH1-2 9.1 1.39 S17101008 SKBR1-RH1-3 8.6 1.09 表 2 Qiaxcel 檢測結果檢結果樣品 RNA 檢測結果進行匯總分析（表 3），結果顯示六組樣品的合實驗要求，樣品合格，滿足構建 2 次文庫的要求。

圖 3 R1 堿基組成分布圖（1） 圖 4 R1 堿基組成分布圖（2）3.4 堿基質量分布根據質控條件統(tǒng)計對每個測序循環(huán)的堿基質量進行統(tǒng)計，并繪制堿基質量分布圖，以便從整體水平上評估測序質量，我們將堿基位置設置為橫坐標，將對應的 Q 值設置為縱坐標，紅線代表中位數，藍線表示平均值，黃色表示 25%-75%的區(qū)間，觸須是 10%-90%。由于測序采用的是 2X150 堿基的測序模式，所以測序包含 6 個樣本，每個樣本相對應兩個堿基質量分布圖，，圖 5、圖 6 為樣本 R1 堿基質量分布圖。
【學位授予單位】：遼寧中醫(yī)藥大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：R285.5

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本文編號：2618541