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光譜法和分子模擬研究替尼類藥物與生物大分子的相互作用

發(fā)布時間:2017-05-17 07:05

  本文關鍵詞:光譜法和分子模擬研究替尼類藥物與生物大分子的相互作用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:本文通過多種光譜法結合分子模擬研究了吉非替尼與脫氧核糖核酸(DNA)的相互作用以及吉非替尼、拉帕替尼、蘇尼替尼與BSA的相互作用,通過宏觀光譜實驗和微觀分子模擬相結合研究替尼類藥物與生物大分子的結合模式、結合作用力以及結合前后藥物對生物大分子二級結構的影響。在模擬生理環(huán)境下通過紫外光譜法、熒光光譜法和粘度法等探討吉非替尼與小牛胸腺DNA的相互作用。實驗結果表明在298 K時吉非替尼易結合在DNA的小溝區(qū),且結合常數(shù)為6.44×103 mol/L;結合作用過程中焓變(ΔH0)和熵變(ΔS0)的符號和大小表明二者主要作用力為范德華力和氫鍵作用力;圓二色譜結果表明吉非替尼與DNA作用后不會改變B型DNA的二級結構;分子模擬結果表明吉非替尼在與DNA結合前后分子結構有明顯的改變,改變后的分子結構能更好的進入DNA分子中,吉非替尼分子結構的靈活可變性在與DNA的相互作用起到了很大的作用。在研究吉非替尼、拉帕替尼及蘇尼替尼與牛血清白蛋白(BSA)的相互作用過程中,主要采用了熒光光譜法、同步熒光光譜法、圓二色光譜法和分子模擬法等實驗方法。實驗結果表明吉非替尼、拉帕替尼和蘇尼替尼的加入會導致BSA熒光發(fā)生猝滅;并且三種替尼類藥物與BSA的結合位點數(shù)均為1;藥物與BSA作用過程中的焓變(ΔH0)和熵變(ΔS0)表明三種藥物與BSA作用過程中的主要作用力均為范德華力和氫鍵作用力;圓二色譜和同步熒光結果表明三種替尼類藥物與BSA結合后不會引起B(yǎng)SA二級結構的改變;熒光競爭結果表明吉非替尼和蘇尼替尼結合與保泰松競爭結合BSA的site I位點,拉帕替尼與布洛芬競爭結合BSA的site II位點;分子對接的結果從微觀水平印證了光譜法得到的結果。
【關鍵詞】:脫氧核糖核酸 牛血清白蛋白 吉非替尼 拉帕替尼 蘇尼替尼 光譜法 分子模擬
【學位授予單位】:浙江工業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R914
【目錄】:
  • 摘要4-5
  • ABSTRACT5-10
  • 符號說明10-11
  • 第一章 緒論11-22
  • 1.1 兩種生物大分子的結構和組成11-13
  • 1.1.1 脫氧核糖核酸(DNA)11
  • 1.1.2 血清白蛋白(ALB)11-13
  • 1.2 替尼類藥物的結構和特征13-15
  • 1.3 藥物小分子與生物大分子相互作用的方式15-17
  • 1.3.1 藥物小分子與DNA的相互作用方式15-16
  • 1.3.2 藥物小分子與BSA的相互作用方式16-17
  • 1.4 研究方法17-20
  • 1.4.1 紫外-可見吸收光譜法17-18
  • 1.4.2 熒光光譜法18-19
  • 1.4.3 同步熒光光譜法19
  • 1.4.4 圓二色光譜法19
  • 1.4.5 分子模擬法19-20
  • 1.5 課題的研究意義及現(xiàn)狀20-22
  • 第二章 光譜法結合分子模擬研究吉非替尼與ct-DNA的相互作用22-37
  • 2.1 引言22
  • 2.2 實驗部分22-25
  • 2.2.1 儀器及試劑22-23
  • 2.2.2 儲備液的配置23
  • 2.2.3 紫外可見分光光度法23-24
  • 2.2.4 粘度實驗24
  • 2.2.5 熒光光譜法24
  • 2.2.6 圓二光譜法24
  • 2.2.7 分子模擬法24-25
  • 2.3 結果與討論25-36
  • 2.3.1 紫外光譜法25-26
  • 2.3.2 結合常數(shù)和作用力26-28
  • 2.3.3 離子強度的影響28-29
  • 2.3.4 粘度測定29-30
  • 2.3.5 競爭結合作用30-32
  • 2.3.6 圓二色譜32-33
  • 2.3.7 分子模擬33-36
  • 2.4 本章小結36-37
  • 第三章 光譜法結合分子模擬研究替尼類藥物與BSA的相互作用37-64
  • 3.1 引言37
  • 3.2 實驗部分37-40
  • 3.2.1 儀器及試劑37-38
  • 3.2.2 儲備液的配制38
  • 3.2.3 熒光光譜測定38-39
  • 3.2.4 同步熒光光譜測定39
  • 3.2.5 圓二色譜測定39
  • 3.2.6 分子模擬法39-40
  • 3.3 結果與討論40-58
  • 3.3.1 藥物對BSA的熒光猝滅及其機理40-44
  • 3.3.2 表觀結合常數(shù)、結合位點數(shù)及主要作用力44-49
  • 3.3.3 結合位點49-52
  • 3.3.4 BSA構象表征52-56
  • 3.3.5 藥物分子與BSA之間的能量轉移56-58
  • 3.4 分子模擬法58-62
  • 3.5 本章小結62-64
  • 第四章 結論與展望64-66
  • 4.1 結論64
  • 4.2 展望64-66
  • 參考文獻66-72
  • 致謝72-73
  • 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文目錄73

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本文編號:372740

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