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冠狀動脈立體分割算法研究

發(fā)布時間:2020-04-09 15:19
【摘要】:隨著冠心病診斷需求的不斷增加,基于醫(yī)學圖像的輔助診斷已成為提高診斷效率的重要手段;贑TA數(shù)據(jù)的冠狀動脈立體分割是冠心病輔助診斷的關鍵技術,已成為研究的熱點。受不同設備、不同病人和造影劑分布不均勻等因素的影響,冠狀動脈在CTA數(shù)據(jù)中的清晰度不同,冠狀動脈立體分割成為一項具有挑戰(zhàn)的任務。本文針對冠狀動脈CTA數(shù)據(jù),從準確性、自動性和運行速度三個方面,展開了對冠狀動脈分割算法的研究,具體工作如下:(1)提出一種基于多特征約束的區(qū)域生長分割算法。該算法考慮到冠狀動脈粗細不同的管狀特性,使用管狀濾波器提取不同尺度下的血管相似性特征,同時結合冠狀動脈在CTA數(shù)據(jù)中的密度特征共同作為區(qū)域生長的約束條件。本算法很好的解決了單特征區(qū)域生長算法容易出現(xiàn)的欠分割現(xiàn)象,提高分割算法的精度。在有先驗閾值的情況下,其測試Dice系數(shù)為0.88,比單特征方法提高0.2;在沒有先驗閾值情況下,其測試Dice系數(shù)為0.6(同樣比單特征方法高),算法運行時間為460秒左右。(2)提出一種結合3D全卷積網(wǎng)絡和生長思想的自動分割算法。該分割算法主要有起始種子點定位、局部數(shù)據(jù)塊的分割和種子點搜索策略三個部分:●起始點定位:根據(jù)升主動脈和冠狀動脈的連通性質,通過分割升主動脈來自動定位冠狀動脈根節(jié)點,為實現(xiàn)冠狀動脈自動分割提供條件;●局部數(shù)據(jù)塊的分割:提出一種多感受野融合的3D分割網(wǎng)絡。該部分用尺寸為64×64×64的局部數(shù)據(jù)塊和Dice損失函數(shù)解決冠狀動脈立體分割中出現(xiàn)的標簽分布極不平衡的問題。在網(wǎng)絡結構設計上,該網(wǎng)絡在編碼器末端加入金字塔池化,多感受野融合的結構更好的結合了數(shù)據(jù)塊中的全局信息和局部信息,很好的抑制了其他組織的干擾;此外,在編-解碼的全卷積網(wǎng)絡結構中加入殘差模塊、批歸一化、Dropout等操作,抑制網(wǎng)絡過擬合的同時保證網(wǎng)絡的快速收斂;●種子點搜索策略:提出一種基于生長思想的種子點搜索策略,通過分析上一次數(shù)據(jù)塊的分割結果確定下一次選擇數(shù)據(jù)塊的中心,提取冠狀動脈附近的數(shù)據(jù)塊,實現(xiàn)了高效使用訓練好的分割網(wǎng)絡;該分割算法在測試集上平均Dice系數(shù)為0.76,運行時間在40秒左右。(3)根據(jù)本文分割算法實現(xiàn)了冠狀動脈的狹窄測量。通過對血管拉直、細化、分段、計算橫截面積等操作后,初步可以實現(xiàn)冠狀動脈狹窄測量,為冠狀動脈狹窄檢測和量化分級等應用提供可行性分析。綜上所述,本文提出的兩種冠狀動脈分割算法在測試集上的Dice系數(shù)從60%提升到了76%,運行時間從460秒減少到40秒,同時實現(xiàn)了冠狀動脈的自動分割;诒疚姆指钏惴ǖ姆指罱Y果初步實現(xiàn)了血管狹窄測量,證明了算法的有效性。
【圖文】:

數(shù)據(jù),冠狀動脈,樣本,血管成像


的信號經(jīng)過重建后形成CT圖像。當需要研究血管成像時,因為血液的密度和水逡逑很接近不容易在普通CT圖像上顯示,所以需要注射造影劑對血管進行增強,然逡逑后利用計算機重建算法恢復血管的立體影像。不同視角下的CTA如圖2-1所示。逡逑(d)樣本二橫斷位邐(e)樣本二矢狀位邐(f)樣本二冠狀位逡逑圖2-1不同視角下的CTA數(shù)據(jù)逡逑冠狀動脈分為左冠狀動脈和右冠狀動脈兩個大的分支;目前大部分研究人員逡逑采用美國心臟病協(xié)會(AHA)提出的冠狀動脈劃分標準,該標準將直徑大于1.5mm逡逑7逡逑

分布圖,冠狀動脈,分布圖,數(shù)據(jù)


第二章冠狀動脈數(shù)據(jù)介紹逡逑的冠狀動脈分成了邋17段,如圖2-2所示。逡逑OM?逡逑圖2-2冠狀動脈劃分解剖圖逡逑左冠狀動脈分支共丨2段,主要包括左循環(huán)支(1丨,13),左對角支(16),逡逑左前降支(6,邋7,,邋8)等大的分支;右冠狀動脈分支共5段,主要包括后降支(4)、逡逑右冠(1,2,3)等大的分支。冠狀動脈各個分支在CTA圖像橫斷位中如圖2-3逡逑所示。逡逑000逡逑圖2-3冠狀動脈在CTA數(shù)據(jù)橫斷位中的分布圖逡逑為了存儲CTA數(shù)據(jù),通常使用固定的編碼方式將重建的圖像存儲在計算機逡逑中。醫(yī)學圖像常用的編碼格式有6種,分別為:ANALYZE(Mayo醫(yī)學成像)、NRRD逡逑(近原始柵格數(shù)據(jù))、DICOM(醫(yī)學數(shù)字成像核通訊)、NIFTI(神經(jīng)影像信息技術)、逡逑PAR/REC(Philips磁共振掃描格式)和MNIC。下面對本文中常使用的兩種格式進逡逑行介紹。逡逑NRRI):邋“國家醫(yī)學圖像計算聯(lián)盟”(NA-MIC)開發(fā)的一種存儲編碼方式,逡逑8逡逑
【學位授予單位】:北方工業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R816.2;TP391.41

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本文編號:2620928

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