本文關(guān)鍵詞：加氏乳桿菌JDM511安全性分析

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【摘要】：隨著人們生活水平的提高,食品安全問題成為了熱點(diǎn)民生話題,也有越來越多的科學(xué)研究涉足相關(guān)領(lǐng)域。食品安全是一個(gè)跨越多學(xué)科的科學(xué)問題,是保證人類生存質(zhì)量和健康的重要議題。目前不管是國(guó)內(nèi)還是國(guó)外,都有許多相關(guān)的保障政策或法律法規(guī)。本文第一部分中,首先采用了454高通量焦磷酸測(cè)序技術(shù)對(duì)加氏乳桿菌(Lactobacillus gasseri)JDM511進(jìn)行了全基因組測(cè)序。加氏乳桿菌JDM511的基因組包括一個(gè)大小為1,788,466bp的環(huán)狀染色體,一個(gè)大小為39,184bp的小質(zhì)粒和一個(gè)大小為93,309bp的大質(zhì)粒。染色體的GC含量為35.06%,共有1705個(gè)蛋白編碼基因,66個(gè)t RNA和3套r RNA操縱子。與已完成測(cè)序的加氏乳桿菌ATCC33323相比較,JDM511的基因組略小,編碼的蛋白量也少。JDM511中總預(yù)測(cè)蛋白的12%的蛋白被歸類為碳水化合物代謝和轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)蛋白。通過研究發(fā)現(xiàn)基因組上存在18個(gè)編碼糖苷水解酶的基因,包括葡萄糖苷酶、淀粉酶、半乳糖酶和麥芽糖酶。其次,本研究采用已經(jīng)得到的全基因組測(cè)序信息,結(jié)合傳統(tǒng)的表型實(shí)驗(yàn),對(duì)菌株進(jìn)行了安全性評(píng)估。表型實(shí)驗(yàn)中,首先利用E-test的方法檢測(cè)了16種常見抗生素對(duì)JDM511的最小抑菌濃度(MIC)。結(jié)果顯示:阿米卡星、桿菌肽、環(huán)丙沙星、鏈霉素和萬古霉素的MIC都超過了試紙的最大檢測(cè)范圍,表明JDM511對(duì)其有較高程度的耐藥性;JDM511對(duì)四環(huán)素、慶大霉素和利福平有中等程度的耐藥性;對(duì)其余抗生素:頭孢噻肟、阿莫西林、氨芐西林、甲基芐胺嘧啶、頭孢噻吩、亞胺培南、紅霉素和氯霉素則表現(xiàn)敏感。JDM511的抗生素表型結(jié)果符合乳桿菌的耐藥譜。其次,利用添加前體氨基酸的平板觀察JDM511對(duì)生物胺的合成能力。結(jié)果表明JDM511不具有產(chǎn)生組胺、腐胺、尸胺、精胺、色胺和酪胺的能力。通過對(duì)基因組的搜索后發(fā)現(xiàn),其基因組中也不含有除乙酰輔酶A脫羧酶以外的氨基酸脫羧酶編碼基因,再一次驗(yàn)證了其不含有產(chǎn)生生物胺的能力。將JDM511的全基因組信息與抗生素耐藥基因數(shù)據(jù)庫(ARDB)、致病因子數(shù)據(jù)庫(VFDB)和已知的有害代謝產(chǎn)物相關(guān)基因進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)了43個(gè)抗生素耐藥相關(guān)基因,152個(gè)潛在致病因子和11個(gè)與有害代謝產(chǎn)物相關(guān)的基因。JDM511的全基因組不含有完整的前噬菌體,僅存在1個(gè)可能的噬菌體相關(guān)片段、1個(gè)可能的CRISPR重復(fù)序列和9個(gè)插入序列。雖然在JDM511的基因組上發(fā)現(xiàn)了多種抗生素耐藥性基因、致病因子和有害代謝產(chǎn)物相關(guān)基因,但其并不含有侵襲性致病因子和高毒性蛋白編碼基因,這些安全性相關(guān)基因也不存在于可移動(dòng)元件上。本研究采取了將傳統(tǒng)表型試驗(yàn)與基因組學(xué)相結(jié)合的方法對(duì)一株加氏乳桿菌進(jìn)行了安全性評(píng)估。相較于傳統(tǒng)方法,這種結(jié)合的方法更為全面,可以最大程度地揭示菌株的潛在安全性和相關(guān)的分子機(jī)制,為菌株的安全應(yīng)用、功能研究和后續(xù)研究提供了基礎(chǔ)和證據(jù)。本文的第二部分驗(yàn)證了Clp蛋白酶可降解抗毒素蛋白812,表明其參與長(zhǎng)雙歧桿菌JDM301Ⅱ型毒素-抗毒素系統(tǒng)的激活,毒素-抗毒素系統(tǒng)對(duì)調(diào)節(jié)細(xì)菌的生長(zhǎng)具有重要作用。本文的第三部分對(duì)上海市區(qū)內(nèi)出售的大米樣本進(jìn)行黃曲霉素B1含量的測(cè)定,并分析不同樣本黃曲霉素B1含量的差別。黃曲霉素是黃曲霉、寄生曲霉、黑曲霉等真菌所產(chǎn)生的具有生物活性的次級(jí)代謝產(chǎn)物。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明市場(chǎng)上大米黃曲霉素含量總體較低,情況良好。東北地區(qū)的大米黃曲霉素含量高于蘇北大米。散裝糧食店來源的大米與大型超市來源大米含量存在差異。且散裝店和中型超市中購買的樣品中出現(xiàn)黃曲霉素含量不合格樣品。
【關(guān)鍵詞】：乳桿菌 益生菌 基因組 焦磷酸測(cè)序 黃曲霉素 毒素抗毒素系統(tǒng)
【學(xué)位授予單位】：上海交通大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號(hào)】：R155
【目錄】：

• 摘要5-7
• ABSTRACT7-10
• 符號(hào)說明10-11
• 第一部分 加氏乳桿菌JDM511安全性分析11-65
• 第一章 加氏乳桿菌JDM511的基因組學(xué)研究11-35
• 第一節(jié) 乳桿菌的基因組學(xué)研究進(jìn)展11-18
• 1.1.1 益生菌的研究歷史和市場(chǎng)發(fā)展11-12
• 1.1.2 乳桿菌的基因組學(xué)研究12-18
• 第二節(jié) 加氏乳桿菌JDM511全基因組測(cè)序18-35
• 引言18
• 1.2.1 實(shí)驗(yàn)材料18-20
• 1.2.2 實(shí)驗(yàn)方法20-24
• 1.2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果24-28
• 1.2.4 討論28-35
• 第二章 基于基因組學(xué)的加氏乳桿菌JDM511安全性研究35-65
• 第一節(jié) 益生菌的安全性研究進(jìn)展35-44
• 2.1.1 益生菌的潛在安全威脅36-40
• 2.1.2 益生菌安全性評(píng)估相關(guān)的法律法規(guī)40-44
• 第二節(jié) 基于基因組學(xué)的加氏乳桿菌JDM511安全性分析44-65
• 引言44
• 2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料44-46
• 2.2.2 實(shí)驗(yàn)方法46-48
• 2.2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果48-59
• 2.2.4 討論59-65
• 第二部分 CLP蛋白酶對(duì)長(zhǎng)雙歧桿菌JDM301毒素抗毒素系統(tǒng)的作用研究65-71
• 引言65
• 1 實(shí)驗(yàn)材料65-66
• 2 實(shí)驗(yàn)方法66-67
• 3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果67-69
• 4 討論69-71
• 第三部分 上海地區(qū)大米樣品黃曲霉素B1含量檢測(cè)71-77
• 引言71-72
• 1 實(shí)驗(yàn)材料72
• 2 實(shí)驗(yàn)方法72-73
• 3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果73-74
• 4 討論74-77
• 全文總結(jié)77-78
• 參考文獻(xiàn)78-87
• 致謝87-89
• 碩士期間主要業(yè)績(jī)89

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 葉露;加氏乳桿菌JDM511安全性分析[D];上海交通大學(xué);2014年

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本文編號(hào)：1023999