本文關(guān)鍵詞：抗菌肽LL-37序列分析與結(jié)構(gòu)研究

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【摘要】：目的分析抗菌肽LL-37的序列和結(jié)構(gòu)特征,模擬其與棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶PagP三維結(jié)構(gòu)的結(jié)合,為后續(xù)研究抗菌機制提供理論和實驗基礎(chǔ)。方法從PDB數(shù)據(jù)庫獲得抗菌肽LL-37、棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶PagP的序列和結(jié)構(gòu)信息,使用SWISS-MODEL、NCBI在線工具和ANTHEPROT6.6.6、AutoDock4.2等軟件對抗菌肽LL-37進行序列和結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果抗菌肽LL-37序列全長為37個氨基酸,含有75.7%α螺旋和24.3%無規(guī)則卷曲,抗菌肽LL-37片段與棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶PagP形成8種對接模式,其配體效率在-2.2389~-1.6100Kcal/mol之間。結(jié)論對抗菌肽LL-37的序列和結(jié)構(gòu)研究,為后續(xù)針對特異靶點設(shè)計多肽藥物,開展結(jié)構(gòu)與活性的研究提供了新的方向。
【作者單位】： 鄂東醫(yī)療集團黃石市中心醫(yī)院湖北理工學(xué)院附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗科腎臟疾病發(fā)生與干預(yù)湖北省重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 抗菌肽LL- 生物信息學(xué) 棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶PagP
【基金】：湖北省自然科學(xué)基金項目(2015CFB627) 黃石市科技計劃項目(2013A077-4)
【分類號】：R915
【正文快照】： 抗菌肽LL-37廣泛分布于人體上皮細(xì)胞和血液細(xì)胞中,其具有廣譜抗菌活性,可以抗多種革蘭陽性菌、革蘭陰性菌和真菌,而且還可通過免疫調(diào)節(jié)、促進創(chuàng)傷修復(fù)、誘導(dǎo)血管生成等,是機體固有免疫防御系統(tǒng)的重要組成部分[1-2]。有報道指出革蘭陰性菌細(xì)胞外膜的棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶PagP可以從磷脂

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 具英花;于愛鳴;解智慧;孫秀華;;葡萄糖胺抑制LL-37誘導(dǎo)的人臍帶血管內(nèi)皮細(xì)胞活化[J];解剖科學(xué)進展;2010年03期

2 張，

本文編號：711914