硫氧還蛋白還原酶小分子抑制劑的設(shè)計(jì)、合成與活性評價(jià)
發(fā)布時(shí)間:2022-02-24 18:11
研究表明硫氧還蛋白系統(tǒng)和許多疾病密切相關(guān)。硫氧還蛋白還原酶(TrxR)是硫氧還蛋白系統(tǒng)的的關(guān)鍵酶,哺乳動(dòng)物硫氧還蛋白還原酶主要有三種存在形式,TrxR1、TrxR2和TrxR3;而硫氧還蛋白系統(tǒng)是維持生物體內(nèi)氧化還原平衡和調(diào)控氧化還原相關(guān)的信號(hào)通路的關(guān)鍵系統(tǒng)。TrxR通過還原硫氧還蛋白(Trx)和其他底物來對下游得多種氧化還原相關(guān)的生化過程進(jìn)行調(diào)控,例如ROS水平、細(xì)胞增殖、分化與細(xì)胞凋亡。由于其在腫瘤中的特殊作用,TrxR1已被作為一個(gè)抗癌靶點(diǎn)進(jìn)行了大量的研究。已有的金諾芬、順鉑等藥物可以特異性的抑制TrxR1,誘導(dǎo)活性氧水平的上升進(jìn)而誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡,并在臨床應(yīng)用中取得獲得較好的預(yù)后效果。本文旨在利用虛擬篩選技術(shù)設(shè)計(jì)、合成靶向TrxR1的新型小分子抑制劑。虛擬篩選是一種利用計(jì)算機(jī)軟件從化學(xué)數(shù)據(jù)庫中篩選出目標(biāo)化合物,主要優(yōu)勢在于可以顯著降低顯著降低研發(fā)成本和時(shí)間,提高藥物發(fā)現(xiàn)的效率;诮Y(jié)構(gòu)的虛擬篩選(SBVS)是指在抑制靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)的情況下,先將化合物與靶點(diǎn)的活性位點(diǎn)對接,預(yù)測其相互作用模式,并對對接分子進(jìn)行排序,根據(jù)排序或者綜合其他手段篩選出目標(biāo)分子。本文基于TrxR1的三維結(jié)構(gòu)對Z...
【文章來源】:電子科技大學(xué)四川省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要符號(hào)表
第一章 緒論
1.1 硫氧還蛋白系統(tǒng)
1.1.1 硫氧還蛋白(Trx)
1.1.2 硫氧還蛋白還原酶(TrxR)
1.2 硫氧還蛋白系統(tǒng)與腫瘤
1.2.1 硫氧還蛋白系統(tǒng)與活性氧(ROS)
1.2.2 活性氧簇(ROS)與腫瘤
1.2.3 硫氧還蛋白系統(tǒng)與腫瘤
1.3 硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.3.1 金屬配合物類硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.3.2 有機(jī)硒類硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.3.3 天然產(chǎn)物及其類似物類硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.3.4 其他硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.4 本文的主要研究內(nèi)容
第二章 基于TRXR1 晶體結(jié)構(gòu)的小分子抑制劑的設(shè)計(jì)
2.1 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)
2.1.1 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)概述
2.1.2 RBDD的主要過程
2.2 分子對接
2.2.1 分子對接概述
2.2.2 分子對接軟件
2.2.3 重對接
2.3 虛擬篩選
2.3.1 虛擬篩選概述
2.3.2 虛擬篩選小分子庫
2.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.4.1 受體結(jié)構(gòu)準(zhǔn)備
2.4.2 配體準(zhǔn)備
2.4.3 運(yùn)行虛擬篩選
2.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.6 小分子抑制劑的設(shè)計(jì)
2.7 本章小結(jié)
第三章 小分子抑制劑的合成及表征
3.1 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
3.2 合成原理
3.2.1 反應(yīng)原理
3.2.2 化合物純化
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.4 本章小結(jié)
第四章 TRXR1 小分子抑制劑的活性評價(jià)
4.1 實(shí)驗(yàn)材料與儀器
4.2 實(shí)驗(yàn)原理
4.3 實(shí)驗(yàn)方法與結(jié)果
4.4 分子對接預(yù)測相互作用模型
4.5 本章小結(jié)
第五章 分子動(dòng)力學(xué)模擬
5.1 概述
5.2 分子動(dòng)力學(xué)模擬過程
5.3 模擬結(jié)果分析
5.4 本章小結(jié)
第六章 全文總結(jié)與展望
6.1 全文總結(jié)
6.2 后續(xù)工作展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀碩士學(xué)位期間取得的成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]藥物高通量篩選技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 孫黎. 廈門科技. 2004(05)
博士論文
[1]以硫氧還蛋白還原酶為靶點(diǎn)的天然化合物抗腫瘤機(jī)制研究[D]. 段東柱.蘭州大學(xué) 2014
本文編號(hào):3643259
【文章來源】:電子科技大學(xué)四川省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要符號(hào)表
第一章 緒論
1.1 硫氧還蛋白系統(tǒng)
1.1.1 硫氧還蛋白(Trx)
1.1.2 硫氧還蛋白還原酶(TrxR)
1.2 硫氧還蛋白系統(tǒng)與腫瘤
1.2.1 硫氧還蛋白系統(tǒng)與活性氧(ROS)
1.2.2 活性氧簇(ROS)與腫瘤
1.2.3 硫氧還蛋白系統(tǒng)與腫瘤
1.3 硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.3.1 金屬配合物類硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.3.2 有機(jī)硒類硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.3.3 天然產(chǎn)物及其類似物類硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.3.4 其他硫氧還蛋白還原酶抑制劑
1.4 本文的主要研究內(nèi)容
第二章 基于TRXR1 晶體結(jié)構(gòu)的小分子抑制劑的設(shè)計(jì)
2.1 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)
2.1.1 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)概述
2.1.2 RBDD的主要過程
2.2 分子對接
2.2.1 分子對接概述
2.2.2 分子對接軟件
2.2.3 重對接
2.3 虛擬篩選
2.3.1 虛擬篩選概述
2.3.2 虛擬篩選小分子庫
2.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.4.1 受體結(jié)構(gòu)準(zhǔn)備
2.4.2 配體準(zhǔn)備
2.4.3 運(yùn)行虛擬篩選
2.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.6 小分子抑制劑的設(shè)計(jì)
2.7 本章小結(jié)
第三章 小分子抑制劑的合成及表征
3.1 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
3.2 合成原理
3.2.1 反應(yīng)原理
3.2.2 化合物純化
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.4 本章小結(jié)
第四章 TRXR1 小分子抑制劑的活性評價(jià)
4.1 實(shí)驗(yàn)材料與儀器
4.2 實(shí)驗(yàn)原理
4.3 實(shí)驗(yàn)方法與結(jié)果
4.4 分子對接預(yù)測相互作用模型
4.5 本章小結(jié)
第五章 分子動(dòng)力學(xué)模擬
5.1 概述
5.2 分子動(dòng)力學(xué)模擬過程
5.3 模擬結(jié)果分析
5.4 本章小結(jié)
第六章 全文總結(jié)與展望
6.1 全文總結(jié)
6.2 后續(xù)工作展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀碩士學(xué)位期間取得的成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]藥物高通量篩選技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 孫黎. 廈門科技. 2004(05)
博士論文
[1]以硫氧還蛋白還原酶為靶點(diǎn)的天然化合物抗腫瘤機(jī)制研究[D]. 段東柱.蘭州大學(xué) 2014
本文編號(hào):3643259
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