蛋白質(zhì)作為一種重要的有機(jī)大分子,在生命活動(dòng)中承擔(dān)著重要作用。隨著生命科學(xué)領(lǐng)域研究的不斷深入,越來(lái)越多的蛋白基因序列被解析出來(lái),以此為基礎(chǔ)發(fā)展的以探究蛋白質(zhì)組和功能基因組為主的生命科學(xué)進(jìn)入了新的篇章。隨著計(jì)算機(jī)計(jì)算能力的提升以及模擬方法理論逐漸完善,以物理、數(shù)學(xué)和化學(xué)等學(xué)科綜合發(fā)展而來(lái)的分子動(dòng)力學(xué)作為一種新型的理論指導(dǎo)工具,在蛋白-底物的相互作用、底物傳遞與釋放等過(guò)程的機(jī)制研究中發(fā)揮著越來(lái)越重要的作用,它能夠從動(dòng)態(tài)角度探究蛋白質(zhì)瞬時(shí)構(gòu)象變化,對(duì)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行解釋及預(yù)測(cè)。同時(shí),在以構(gòu)象契合理念為基礎(chǔ)的藥物設(shè)計(jì)中,動(dòng)力學(xué)模擬可以在微觀層面探究分子的生物作用機(jī)制,結(jié)合同源建模,分子對(duì)接等計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)工具,可以驗(yàn)證藥物分子的藥效模型,并指導(dǎo)藥物的改造設(shè)計(jì)。本論文主要采用分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法,結(jié)合傘形采樣等多種技術(shù),對(duì)熱點(diǎn)蛋白的底物釋放及作用機(jī)制進(jìn)行研究,并結(jié)合3D-QSAR,對(duì)相關(guān)抑制劑進(jìn)行設(shè)計(jì),主要研究?jī)?nèi)容如下:1:組蛋白賴氨酸特異性去甲基化酶1（Lysine-specific demethylase 1,LSD1）是一種典型的組蛋白特異性去甲基化酶,對(duì)于探究組蛋白甲基化修飾有著重要意義。以苯... 

【文章來(lái)源】：河南大學(xué)河南省

【文章頁(yè)數(shù)】：109 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

LSD1蛋白不同結(jié)構(gòu)域部位cartoon示意圖

簡(jiǎn)化前后的動(dòng)力學(xué)模擬熵變模型示意圖

圖 3-3 3D-QSAR 分子疊合圖及疊合骨架示意圖 3-1 苯環(huán)丙胺類(lèi) LSD1 抑制劑 Training Set 結(jié)構(gòu)，實(shí)驗(yàn)活性數(shù)據(jù)及 3D-QSAR 結(jié)The structures，actual and predicted pIC50values of the Training SetibitorstructBioactivity (pIC50)RRRRActual Predicted


本文編號(hào)：3515945