MAGUKs-GK結(jié)構(gòu)域的分子模擬及靶向小分子抑制劑的發(fā)現(xiàn)
發(fā)布時間:2021-05-20 12:01
膜結(jié)合鳥苷酸激酶(membrane-associated guanylate kinases,MAGUKs)是一種支架蛋白質(zhì)家族,富集在細(xì)胞連接處,在細(xì)胞極性建立和維持、細(xì)胞粘附以及細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方面具有重要作用。該家族蛋白含有多個蛋白相互作用的結(jié)構(gòu)域,其中,GK結(jié)構(gòu)域以磷酸化和非磷酸化依賴兩種方式與多種蛋白質(zhì)結(jié)合,但是,GK結(jié)構(gòu)域的生理功能及其結(jié)合模式的分子機制并不清楚;诖,本論文研究了不同GK結(jié)構(gòu)域的結(jié)構(gòu)特征并發(fā)現(xiàn)靶向分子,對研究其功能及發(fā)現(xiàn)新型的干預(yù)藥物具有重要意義。大同源物蛋白(DLG)是MAGUK家族重要的一員。DLGs的GK結(jié)構(gòu)域通過與磷酸化肽和非磷酸化肽結(jié)合,調(diào)節(jié)多種細(xì)胞功能。本文中,我們通過分子動力學(xué)模擬,研究了DLG1和DLG4與不同多肽的相互作用,結(jié)果表明,DLGs-GK蛋白與磷酸化或者非磷酸化配體具有相同的結(jié)合模式,其結(jié)合位點主要分為磷酸化位點和β5折疊處的疏水位點。此外,基于MM-GBSA結(jié)合自由能計算,我們預(yù)測DLG1-GK能夠與靶向DLG4-GK的抑制性多肽GKI-QSF結(jié)合,并具有相似的結(jié)合親和力,隨后通過ITC實驗測試,DLG1-GK/GKI-QSF結(jié)...
【文章來源】:中國人民解放軍陸軍軍醫(yī)大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:108 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略語表
英文摘要
中文摘要
第一章 前言
1. MAGUK 蛋白家族介紹
2. DLG4 的結(jié)構(gòu)與功能研究
3. MAGI2 的結(jié)構(gòu)與功能研究
4. DLG4 和 MAGI2 蛋白在 PSD 中的研究現(xiàn)狀
5. 研究思路
第二章 DLGs-GK和 MAGI2-GK結(jié)構(gòu)域的分子動力學(xué)模擬研究
第一節(jié) 引言
第二節(jié) DLGs-GK結(jié)構(gòu)域的分子動力學(xué)模擬研究
第三節(jié) MAGI2-GK結(jié)構(gòu)域的分子動力學(xué)模擬研究
第三章 靶向MAGI2-GK的小分子抑制劑的發(fā)現(xiàn)優(yōu)化與評價
第一節(jié) 引言
第二節(jié) 先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)
第三節(jié) MAGI2-GK先導(dǎo)化合物的結(jié)構(gòu)優(yōu)化
第四節(jié) MAGI2-GK先導(dǎo)物結(jié)合方式的分子模擬
第五節(jié) MAGI2-GK抑制劑的生物活性初步評價
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述 小分子先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)策略
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士期間發(fā)表的論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HPV16/18 E6蛋白與小分子抑制劑RITA和姜黃素的結(jié)合模式研究[J]. 張?zhí)煲?徐苗,丁歡,田菲菲. 生命科學(xué)研究. 2019(05)
[2]MAGI家族在腫瘤中的研究進(jìn)展[J]. 盧佳佳,屈婷婷,劉彩霞,賈淑芹. 中國腫瘤. 2017(04)
[3]分子動力學(xué)模擬方法及其應(yīng)用[J]. 楊萍,孫益民. 安徽師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2009(01)
本文編號:3197718
【文章來源】:中國人民解放軍陸軍軍醫(yī)大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:108 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略語表
英文摘要
中文摘要
第一章 前言
1. MAGUK 蛋白家族介紹
2. DLG4 的結(jié)構(gòu)與功能研究
3. MAGI2 的結(jié)構(gòu)與功能研究
4. DLG4 和 MAGI2 蛋白在 PSD 中的研究現(xiàn)狀
5. 研究思路
第二章 DLGs-GK和 MAGI2-GK結(jié)構(gòu)域的分子動力學(xué)模擬研究
第一節(jié) 引言
第二節(jié) DLGs-GK結(jié)構(gòu)域的分子動力學(xué)模擬研究
第三節(jié) MAGI2-GK結(jié)構(gòu)域的分子動力學(xué)模擬研究
第三章 靶向MAGI2-GK的小分子抑制劑的發(fā)現(xiàn)優(yōu)化與評價
第一節(jié) 引言
第二節(jié) 先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)
第三節(jié) MAGI2-GK先導(dǎo)化合物的結(jié)構(gòu)優(yōu)化
第四節(jié) MAGI2-GK先導(dǎo)物結(jié)合方式的分子模擬
第五節(jié) MAGI2-GK抑制劑的生物活性初步評價
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述 小分子先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)策略
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士期間發(fā)表的論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HPV16/18 E6蛋白與小分子抑制劑RITA和姜黃素的結(jié)合模式研究[J]. 張?zhí)煲?徐苗,丁歡,田菲菲. 生命科學(xué)研究. 2019(05)
[2]MAGI家族在腫瘤中的研究進(jìn)展[J]. 盧佳佳,屈婷婷,劉彩霞,賈淑芹. 中國腫瘤. 2017(04)
[3]分子動力學(xué)模擬方法及其應(yīng)用[J]. 楊萍,孫益民. 安徽師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2009(01)
本文編號:3197718
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