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基于構(gòu)效關(guān)系的CCR5受體抑制劑的虛擬篩選及體外活性評價

發(fā)布時間:2021-04-08 18:21
  一、目的本文旨在探討CCR5受體抑制劑的構(gòu)效關(guān)系,并在其基礎(chǔ)上進行計算機虛擬篩選,將篩選出的化合物進行體外活性驗證,以期得到新的具有抗HIV活性的先導化合物。二、方法(1)3D-QSAR模型構(gòu)建從文獻中收集了48個CCR5受體抑制劑,采用基于公共骨架的疊合,構(gòu)建CoMFA和CoMSIA模型,評估模型的預測和擬合能力,并分析三維等勢圖。(2)藥效模型構(gòu)建構(gòu)建HipHop和HypoGen藥效團模型,并根據(jù)藥效團的統(tǒng)計學指標和篩選能力選出最優(yōu)藥效團模型,用于虛擬篩選。(3)分子對接模型構(gòu)建構(gòu)建Surflex-Dock和CDOCKER分子對接模型,分析CCR5受體抑制劑與受體之間的關(guān)鍵相互作用和關(guān)鍵氨基酸殘基,為虛擬篩選奠定基礎(chǔ)。(4)虛擬篩選采用多級篩選的策略,運用“類藥五原則”、藥效團模型和分子對接模型進行逐級篩選。(5)化合物體外活性評價通過檢測HIV-1克隆病毒感染的TZM-b1細胞中熒光素酶報告基因的表達情況來判斷化合物的抗HIV-1活性。MTT實驗考查化合物的細胞毒性。采用流式細胞術(shù)分析化合物對CCR5受體內(nèi)在化的影響。三、結(jié)果(1)3D-QSAR模型CoMFA模型的交叉驗證系數(shù)值... 

【文章來源】:南方醫(yī)科大學廣東省

【文章頁數(shù)】:90 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于構(gòu)效關(guān)系的CCR5受體抑制劑的虛擬篩選及體外活性評價


圖1?HIV-l病毒入侵細胞的過程[13]??Fi.?1?Therocess?of?HIV-1?virus?invadincells?[丨■’】??

三維結(jié)構(gòu)圖,受體,記憶型


項士學位論文???2個氨基酸,具有七次跨膜結(jié)構(gòu),其三維結(jié)構(gòu)如Hg.?2所示,是細胞內(nèi)P趨??因子(RANTES、MIP-la和MIP-lp)的受體[17],可在多種細胞的表面表達,??NK細胞、小膠質(zhì)細胞、樹突狀細胞,但主要表達于記憶型T細胞表面,并??與炎癥反應(yīng)。??

靶細胞,病毒,記憶型,學位論文


項士學位論文???2個氨基酸,具有七次跨膜結(jié)構(gòu),其三維結(jié)構(gòu)如Hg.?2所示,是細胞內(nèi)P趨??因子(RANTES、MIP-la和MIP-lp)的受體[17],可在多種細胞的表面表達,??NK細胞、小膠質(zhì)細胞、樹突狀細胞,但主要表達于記憶型T細胞表面,并??與炎癥反應(yīng)。??

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3126027

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