隨著大數(shù)據(jù)技術(shù)的發(fā)展,現(xiàn)實中應用到的數(shù)據(jù)量越來越龐大,數(shù)據(jù)種類也日漸豐富,多種數(shù)據(jù)所構(gòu)成的異構(gòu)網(wǎng)絡的應用更加廣泛,比如文獻數(shù)據(jù)庫、社交網(wǎng)絡、商品推薦系統(tǒng)、生物信息等,這些數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)都是由不同種類的數(shù)據(jù)所構(gòu)成的異構(gòu)信息網(wǎng)絡。在這些異構(gòu)數(shù)據(jù)中,我們要有效地篩選出可用數(shù)據(jù),并且從中挖掘出有意義的信息,才能充分實現(xiàn)數(shù)據(jù)的價值。因此,在異構(gòu)信息網(wǎng)絡上進行數(shù)據(jù)挖掘任務就具有極其重要的研究價值。其中,生物信息異構(gòu)網(wǎng)絡的應用意義尤其突出,由藥物和人類基因構(gòu)成的異構(gòu)網(wǎng)絡揭露了藥物與基因之間的相互作用關(guān)系,研究該網(wǎng)絡中節(jié)點之間的相關(guān)性并對未知的作用關(guān)系進行預測不僅可以有效地解釋藥物如何影響人類基因的表達,也可以通過檢測人類基因表達的擾動水平來對藥物性能進行評估。出于這樣的目的,本文著重研究了針對藥物和基因組成的生物信息異構(gòu)網(wǎng)絡的預測算法,并對新提出的方法和傳統(tǒng)預測方法進行了性能對比。具體地,我們做了如下三項工作和創(chuàng)新:（1）在藥物-基因網(wǎng)絡的基礎上加入副作用數(shù)據(jù),擴展藥物-副作用之間的關(guān)系。并創(chuàng)新性地在藥物-基因生物異構(gòu)信息網(wǎng)絡上運用表示學習的方法提取網(wǎng)絡中的結(jié)構(gòu)特征,運用兩種表示學習算法,把網(wǎng)絡中的結(jié)構(gòu)... 

【文章來源】：廈門大學福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．３藥物－基因－副作用異構(gòu)信息網(wǎng)絡實例??

詼嗖鬩旃股?锿?緄囊┪錚??蜆叵翟げ夥椒ㄑ繡常崳?２．１．２數(shù)據(jù)介紹??在本文實驗中，我們所使用的生物異構(gòu)信息網(wǎng)絡可以用圖２．１所示的簡單圖??例概括。其中，藍色節(jié)點表示藥物，紅色節(jié)點表示基因，綠色節(jié)點則表示副作用。??而在這樣的網(wǎng)絡中，還包含了多個小的子網(wǎng)絡，比如由藍色實線相連接的藍色節(jié)??點，表示藥物之間的相似性網(wǎng)絡；而由粉紅色實線連接的紅色節(jié)點組成了基因相??似性網(wǎng)絡。此外，我們的實驗數(shù)據(jù)中還包含了藥物影響基因表達、藥物引發(fā)副作??用兩種作用關(guān)系，在圖２．１所示的圖例中分別由橙色虛線和綠色虛線表示。這些??數(shù)據(jù)我們可以分別來進行分析：??德４??Ａ??會?參??參１?Ａ??令會＾丨?＾??？修??一Ａ?Ｇ？２??？一臀?？??圖２．１藥物－基

詼嗖鬩旃股?锿?緄囊┪錚??蜆叵翟げ夥椒ㄑ繡常崳?２．１．２數(shù)據(jù)介紹??在本文實驗中，我們所使用的生物異構(gòu)信息網(wǎng)絡可以用圖２．１所示的簡單圖??例概括。其中，藍色節(jié)點表示藥物，紅色節(jié)點表示基因，綠色節(jié)點則表示副作用。??而在這樣的網(wǎng)絡中，還包含了多個小的子網(wǎng)絡，比如由藍色實線相連接的藍色節(jié)??點，表示藥物之間的相似性網(wǎng)絡；而由粉紅色實線連接的紅色節(jié)點組成了基因相??似性網(wǎng)絡。此外，我們的實驗數(shù)據(jù)中還包含了藥物影響基因表達、藥物引發(fā)副作??用兩種作用關(guān)系，在圖２．１所示的圖例中分別由橙色虛線和綠色虛線表示。這些??數(shù)據(jù)我們可以分別來進行分析：??德４??Ａ??會?參??參１?Ａ??令會＾丨?＾??？修??一Ａ?Ｇ？２??？一臀?？??圖２．１藥物－基

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Meta-Path-Based Search and Mining in Heterogeneous Information Networks[J]. Yizhou Sun,Jiawei Han.  Tsinghua Science and Technology. 2013(04)



本文編號：3106404