來源于多形擬桿菌的乙酰酯酶BT4096晶體結(jié)構(gòu)解析
發(fā)布時間:2021-01-06 03:07
地爾硫卓是一種非二氫吡啶類鈣離子拮抗劑,作為臨床藥物具有高選擇性、高耐受性、廣適用性等特點,目前已廣泛用于治療高血壓、心絞痛以及心律失常等心血管疾病。地爾硫卓在體內(nèi)代謝可生成多種代謝產(chǎn)物,這些代謝產(chǎn)物多具有藥物活性,對鈣離子通道有著不同的抑制作用。地爾硫卓及其代謝物在體內(nèi)的脫乙酰作用依賴于一種來源于腸道微生物多形擬桿菌的乙酰酯酶BT4096(GenBank,NP813007.1)。本實驗以BT4096蛋白為研究對象,對其進行表達、純化及晶體結(jié)構(gòu)解析。BT4096截去其N端信號肽后有440個氨基酸,分子量為51 kDa,全基因合成并構(gòu)建在pET32a載體上,后轉(zhuǎn)入工程菌株BL21(DE3)中進行表達。通過兩次鎳親和層析純化,獲得了符合結(jié)晶純度的BT4096蛋白溶液。晶體條件的初篩通過微量蒸汽擴散-坐滴法,使用商業(yè)化結(jié)晶試劑盒對晶體條件進行篩選。晶體衍射數(shù)據(jù)的收集在同步輻射中心進行。利用單波長反常散射的方法解析了BT4096的相位,通過PHENIX搭建初始結(jié)構(gòu)模型,使用COOT進行結(jié)構(gòu)修正,最終獲得分辨率為2.33 A的結(jié)構(gòu)。BT4096的結(jié)構(gòu)可分為兩個部分,N端結(jié)構(gòu)...
【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
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本文編號:2959817
【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.2?SGNH家族水解薄(GDSL家族)催化機制??注:催化三聯(lián)體和水分子用黑色表示,氧陰離子洞為藍色,底物為紅色??
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圖3.2?TMHMM跨膜預(yù)測??
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