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基于矩陣填充算法對抗癌藥物敏感性缺失數(shù)據(jù)的預測

發(fā)布時間:2020-06-29 13:11
【摘要】:數(shù)據(jù)缺失為大數(shù)據(jù)的分析帶來諸多不便,矩陣填充作為處理缺失數(shù)據(jù)的重要手段已成為大數(shù)據(jù)分析的一個重要研究課題,F(xiàn)今,腫瘤已經(jīng)嚴重威脅人類健康,是致死的重要元兇之一。由于腫瘤的異質(zhì)性,在患者用藥前進行臨床試驗,測量腫瘤細胞系對于抗腫瘤藥物的敏感性試驗是選擇適合癌癥患者藥物的常規(guī)手段。然而,由于藥物敏感性試驗經(jīng)常受到實驗條件、實驗設(shè)備、實驗材料等的干擾與限制,使得獲取的藥物敏感性數(shù)據(jù)經(jīng)常存在缺失。本文根據(jù)生物學數(shù)據(jù)的特性,首先構(gòu)造計算模型挖掘生物學數(shù)據(jù)中癌細胞系的相似性以及抗腫瘤藥物的相似性等關(guān)聯(lián)信息;然后將這些信息融合到已有的矩陣填充模型提出了一個新的低秩矩陣填充模型;根據(jù)模型給出了相關(guān)的數(shù)學的證明和模型實現(xiàn)的具體算法;應用該模型到抗腫瘤藥物敏感性數(shù)據(jù)庫的兩組具體數(shù)據(jù),預測它們的缺失數(shù)據(jù)。最后利用10倍交叉驗證法和均方根誤差評估該模型的填充效果。本文所得結(jié)果與已有模型填充效果比較顯示本文的模型能有效的提高預測的效果。
【學位授予單位】:浙江理工大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:TP311.13;R979.1

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