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HIV-1整合酶鏈轉(zhuǎn)移抑制劑的3D-QSAR、分子對(duì)接和分子動(dòng)力學(xué)模擬研究

發(fā)布時(shí)間:2020-04-10 21:46
【摘要】:為了獲得高活性、結(jié)構(gòu)新穎的整合酶鏈轉(zhuǎn)移(INST)抑制劑,本文采用Co MFA和Co MSIA兩種方法對(duì)32個(gè)萘啶類INST抑制劑進(jìn)行了三維定量構(gòu)效關(guān)系研究,并建立了相關(guān)模型,其交叉驗(yàn)證系數(shù)分別為q~2=0. 809和q~2=0. 816,擬合驗(yàn)證系數(shù)分別為r~2=0. 998和r~2=0. 981,表明所建立的模型是可靠的且具有一定的預(yù)測(cè)能力。利用分子對(duì)接探討小分子化合物與INST蛋白的相互作用模式,結(jié)果表明,萘啶類化合物主要通過疏水作用和氫鍵作用與INSTIs蛋白結(jié)合。最后通過分子動(dòng)力學(xué)模擬進(jìn)一步驗(yàn)證對(duì)接結(jié)果發(fā)現(xiàn),對(duì)接的結(jié)合模式與分子動(dòng)力學(xué)模擬得到的結(jié)果是一致的。本研究獲得的綜合模型和推論可以為開發(fā)有效的HIV INSTIs提供重要的理論信息。

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本文編號(hào):2622745

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