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風(fēng)濕性心臟病腸道菌群宏基因組學(xué)分析

發(fā)布時間:2021-11-25 11:56
  [背景與目的]風(fēng)濕性心臟病是一類嚴(yán)重危及人類健康和生命的自身免疫性心臟疾病,云南省處于我國的西南高海拔地區(qū),衛(wèi)生條件落后,其發(fā)病率仍較高,且交通不方便,給予就診造成了巨大的困難。而腸道菌群的變化已經(jīng)被證實與人體許多自身免疫性疾病有關(guān),基于此,我們通過采用宏基因組學(xué)高通量測序技術(shù)對風(fēng)濕性心臟病患者的腸道菌群進(jìn)行分析,尋找其中起關(guān)鍵作用的細(xì)菌成分,找到腸道菌群參與風(fēng)濕性心臟病病理變化過程的證據(jù),鑒定出抗生素的耐藥基因,以便更全面地了解風(fēng)濕性心臟病患病期間腸道微生物的變化,為臨床選藥和治療提供幫助。[方法]我們收集了 10例風(fēng)濕性心臟病患者和5例健康對照組的糞便樣本作為研究對象,對15例糞便樣本進(jìn)行高通量測序,對測序結(jié)果進(jìn)行高級生物信息學(xué)分析,包括腸道菌群結(jié)構(gòu)和豐度的分析、KEGG數(shù)據(jù)庫注釋分析、COG數(shù)據(jù)庫注釋分析、CAZy數(shù)據(jù)庫和ARDB注釋。[結(jié)果]1.風(fēng)濕性心臟病患者和健康對照人群的腸道菌群在門水平上主要集中于擬桿菌門(Bacteroidetes)、硬壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria);2.風(fēng)濕性心臟病患者腸道中擬桿菌科(Bacteroidace... 

【文章來源】:昆明醫(yī)科大學(xué)云南省

【文章頁數(shù)】:75 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

風(fēng)濕性心臟病腸道菌群宏基因組學(xué)分析


圖1-3瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果??1.?10質(zhì)控結(jié)果??

柱狀圖,細(xì)菌,豐度,平均豐度


圖1-7門水平物種平均豐度柱狀圖??在種水平上注釋到71種細(xì)菌,取平均豐度較高的前9種細(xì)菌進(jìn)行繪圖比較,??其他合并為others,如圖1-8。與對照組相比,??實驗組中?Bacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes?等細(xì)菌的豐度下降,??Bamesiella、Odoribacter、Parabacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes、??Clostridium、Eubacterium、Roseburia、Faecalibacterium、Ruminococcus、Dialister、??Megamonas、Escherichia等細(xì)菌的豐度上升。??25??

柱狀圖,物種,平均豐度,柱狀圖


——.??圖1-7門水平物種平均豐度柱狀圖??在種水平上注釋到71種細(xì)菌,取平均豐度較高的前9種細(xì)菌進(jìn)行繪圖比較,??其他合并為others,如圖1-8。與對照組相比,??實驗組中?Bacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes?等細(xì)菌的豐度下降,??Bamesiella、Odoribacter、Parabacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes、??Clostridium、Eubacterium、Roseburia、Faecalibacterium、Ruminococcus、Dialister、??Megamonas、Escherichia等細(xì)菌的豐度上升。??25??


本文編號:3518090

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