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高血壓患者血漿中circRNAs表達譜研究

發(fā)布時間:2019-08-15 16:17
【摘要】:目的:采用環(huán)狀RNA(circRNA)芯片技術(shù)篩選高血壓患者與正常對照人群血漿中差異表達的circRNA,分析circRNA表達譜特征。并應(yīng)用q RT-PCR技術(shù)對差異表達的circRNA進行驗證,最后通過生物信息學分析預測其可能的發(fā)病機制,為進一步探索circRNA作為高血壓診斷的生物標志物以及治療靶點奠定基礎(chǔ)。方法:將5例高血壓患者和5例健康對照者作為實驗對象,分別收集各研究對象的外周靜脈血,分離出血漿后取總RNA,用circRNA芯片技術(shù)檢測各組circRNAs表達情況,進行數(shù)據(jù)分析,篩選出差異表達的circRNAs。應(yīng)用實時熒光定量PCR,對部分上述差異表達的circRNAs在49例高血壓患者及49例正常對照者血漿樣本中進行驗證,明確其表達情況。最后我們預測了circRNAs相關(guān)的miRNAs和靶基因,通過GO分析和KEGG通路分析明確mRNA富集情況。結(jié)果:circRNA芯片結(jié)果顯示,與健康對照組相比,高血壓患者血漿中差異表達的circRNAs有59種,其中表達上調(diào)的有46種,表達下調(diào)的13種。應(yīng)用實時定量PCR驗證2種表達上調(diào)的circRNAs(hsa-circ-0000437、hsa-circ-0008139)以及2種表達下調(diào)的circRNAs(hsa-circ-0005870、hsa-circ-0040809),結(jié)果顯示,hsa-circ-0005870在高血壓組表達下調(diào),和芯片結(jié)果一致。而hsa-circ-0000437、hsa-circ-0008139及hsa-circ-0040809表達在兩組之間沒有統(tǒng)計學差異。生物信息學分析結(jié)果示,與hsa-circ-0005870相結(jié)合的miRNAs有5個,預測到849個靶基因,GO分析結(jié)果示靶基因參與細胞應(yīng)激反應(yīng)等過程,KEGG通路分析表明靶基因的主要通路包括TGF-β信號通路等。結(jié)論:獲得了高血壓患者血漿中circRNAs表達譜特征,并驗證了高血壓患者血漿中hsa-circ-0005870表達下調(diào),生物信息學分析示hsa-circ-0005870可能通過TGF-β信號通路調(diào)控高血壓的發(fā)生。本研究為circRNAs作為高血壓的診斷標志物和治療靶點奠定了基礎(chǔ),為高血壓發(fā)病機制的研究供了新方向。
【圖文】:

表達水平


Hsa-circ-0005870在兩組間的表達水平(P=0.008)

表達水平,生物信息學分析,數(shù)據(jù)庫


圖 2. Hsa-circ-0000437、hsa-circ-0008139 及 hsa-circ-0040809 在兩組間表達水平3.生物信息學分析結(jié)果結(jié)合 TargetScan 和 miRanda 數(shù)據(jù)庫,,我們預測到 hsa-circ-0005870 具有的
【學位授予單位】:首都醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R544.1

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本文編號:2527098

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