本文關(guān)鍵詞：腸道病原菌gyrB基因系統(tǒng)發(fā)育分析

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【摘要】：[目的]探討gyrB基因區(qū)分鑒別腸道病原菌的能力,為臨床快速鑒定病原菌提供依據(jù)。[方法]通過(guò)PCR擴(kuò)增及測(cè)序方法,獲得腸桿菌科和弧菌科的14種臨床常見腸道病原菌gyrB基因序列,合并采集來(lái)自GenBank的標(biāo)準(zhǔn)菌株序列,采用距離法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。[結(jié)果]在系統(tǒng)發(fā)育樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)中,除志賀氏菌、大腸桿菌、嗜水氣單胞菌外,同一菌種的不同菌株均聚類形成具有較高的自舉支持率單系類群。大腸桿菌演化支內(nèi)混雜有志賀氏菌分支;嗜水氣單胞菌的臨床分離株與標(biāo)準(zhǔn)菌株相距較遠(yuǎn),未能聚類成單系類群。另外,除乙型副傷寒沙門氏菌外,其余沙門氏菌gyrB序列在血清型水平呈現(xiàn)高度同源性,使得5種血清型各自聚類區(qū)分。[結(jié)論]采用gyrB基因作為腸道病原菌系統(tǒng)發(fā)育分析靶基因是合適的,其可以在菌種水平區(qū)分包含腸桿菌與弧菌科的腸道病原菌。
【作者單位】： 浙江中醫(yī)藥大學(xué)分析測(cè)試中心;
【關(guān)鍵詞】： 腸桿菌科 弧菌科 gyrB基因 系統(tǒng)發(fā)育分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81102580) 浙江省教育廳科研項(xiàng)目(Y200805821,Y201017092)~~
【分類號(hào)】：R378
【正文快照】： gyr B基因,一種蛋白質(zhì)編碼基因,編碼DNA促旋酶(DNA gyrase)B亞單位[1]。該分子與DNA復(fù)制及超螺旋結(jié)構(gòu)的維持密切相關(guān)。近年來(lái),在細(xì)菌分型鑒別研究中,蛋白質(zhì)編碼基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的優(yōu)點(diǎn)逐漸顯現(xiàn)[2-3]。主要是因?yàn)樵擃惢蛟诒３制渚幋a的氨基酸序列相對(duì)保守的同時(shí),依據(jù)遺傳密

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 毛欣茹;尹小毛;鄭磊;王前;;建立基于gyrB基因檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌復(fù)合物的熒光定量PCR法[J];臨床檢驗(yàn)雜志;2013年12期

2 侯曉麗,陳智;分類及鑒別細(xì)菌的新靶標(biāo)——gyrB基因[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).流行病學(xué)傳染病學(xué)分冊(cè);2005年01期

3 張?jiān)娒?尹小毛;劉非;鄭磊;王前;;基于gyrB序列Taqman實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)在MTC鑒定中的應(yīng)用[J];實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志;2014年03期

4 ;[J];;年期

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 梁倩華;8株微囊藻gyrB和rpoC1基因序列分析及其系統(tǒng)發(fā)育研究[D];暨南大學(xué);2006年

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本文編號(hào)：579388