本文關(guān)鍵詞：埃博拉病毒2014年毒株的基因組變異特征分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的通過對埃博拉病毒2014年毒株基因組共102株序列的分析,研究其變異特征,探討病毒基因組變異與其流行病學(xué)特征改變之間的關(guān)系。方法選取NCBI公共數(shù)據(jù)庫中埃博拉病毒全基因組序列,應(yīng)用Mummer3.0軟件分析病毒基因組變異特征;使用MEGA5軟件進(jìn)行蛋白進(jìn)化分析;應(yīng)用CPHmodels和PyMOL軟件,根據(jù)蛋白同源性模擬蛋白的三維構(gòu)型。結(jié)果埃博拉病毒2014年毒株(扎伊爾型)基因組中,共有606個(gè)位點(diǎn)發(fā)生變異,其中有49個(gè)變異位點(diǎn)是2014年毒株特有的、并導(dǎo)致所編碼的氨基酸發(fā)生非同義突變。特別是NP蛋白第128位、GP蛋白第82位和L蛋白第1 951位氨基酸,不僅在2014年之前所有的扎伊爾型毒株中是保守不變的,而且在其余埃博拉病毒亞型之間也是高度保守的,但在2014年毒株中卻發(fā)生了特異性的變異。結(jié)論埃博拉病毒2014年毒株基因組具有獨(dú)特的變異特征,使得NP、GP和L蛋白發(fā)生變異,特別是GP蛋白第82位氨基酸由丙氨酸突變?yōu)槔i氨酸,將影響其所在的α螺旋的穩(wěn)定性,這可能是2014年毒株致死能力減弱和傳播能力增強(qiáng)的原因之一�；蚪M變異是否直接導(dǎo)致此次疫情中病毒流行病學(xué)特征改變,還需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)研究證實(shí)。
【作者單位】： 上海人類基因組研究中心上海市疾病與健康基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;第二軍醫(yī)大學(xué)熱帶醫(yī)學(xué)和公共衛(wèi)生學(xué)系生物防御(微生物)教研室;
【關(guān)鍵詞】： 埃博拉病毒 病毒基因組 變異(遺傳學(xué)) 計(jì)算生物學(xué)
【基金】：“艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治”科技重大專項(xiàng)“十二五”課題(2013ZX10004104) 國家自然科學(xué)基金(91331107) 上海市科委基礎(chǔ)研究課題(12ZR1421200)~~
【分類號】：R373
【正文快照】： 埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)是能夠在人類和靈長類動(dòng)物中引起高死亡率的病毒,被WHO列為對人類危害最嚴(yán)重的病毒之一,位居第四級致病生物[1]。EBOV屬于絲狀病毒科(Filoviridae)、絲狀病毒屬(Filovirus),其基因組為不分節(jié)段的單股負(fù)鏈RNA,全長約19kb,共有7個(gè)基因、9個(gè)開放閱讀

【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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