兩種方法分離免疫細(xì)胞用于高通量測序TCR組庫分析的比較
本文關(guān)鍵詞:兩種方法分離免疫細(xì)胞用于高通量測序TCR組庫分析的比較,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的探討兩種方法分離免疫細(xì)胞進(jìn)行高通量T細(xì)胞表面的T細(xì)胞變體(TCR),組庫分析的區(qū)別及可行性。方法分別采用免疫磁珠分選純化CD3陽性T細(xì)胞和Ficoll-Paque梯度離心法分離外周血淋巴細(xì)胞的方法制備TCR測序所需樣品各1例,提取DNA后多重聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增CDR3區(qū)域,將擴(kuò)增得到的PCR產(chǎn)物純化后構(gòu)建免疫組庫,進(jìn)行高通量測序及生物信息學(xué)分析。結(jié)果兩種方法獲得的免疫細(xì)胞提取DNA后均能夠滿足TCR免疫組庫建庫需要,高通量測序結(jié)果顯示互補(bǔ)決定簇3(CDR3)區(qū)域長度呈高斯分布,來自健康志愿者的TCR具有豐富多樣性,腫瘤患者TCR多樣性呈寡克隆分布。結(jié)論純化的T細(xì)胞或者直接分離得到的淋巴細(xì)胞均可用于免疫組庫構(gòu)建及后續(xù)TCR CDR3受體庫高通量測序分析,TCR CDR3多樣性可能直接反應(yīng)機(jī)體免疫狀態(tài)。
【作者單位】: 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院腫瘤內(nèi)科;
【關(guān)鍵詞】: T細(xì)胞受體 高通量測序 互補(bǔ)決定簇
【基金】:國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(C81172534)
【分類號】:R392
【正文快照】: T細(xì)胞表面的T細(xì)胞受體(T cell receptor,TCR)是識別抗原的關(guān)鍵分子,具有龐大的多樣性,以適應(yīng)對于不同抗原的識別。TCR最大量多樣性的產(chǎn)生主要來自于連接時(shí),在V(D)J連接區(qū)核苷酸的插入和刪除,體現(xiàn)為互補(bǔ)決定區(qū)簇3(complementarydetermining region 3,CDR3)序列多樣性,因此,TCR
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本文編號:412454
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