本文關(guān)鍵詞：河南省柯薩奇病毒A組16型VP4基因特征分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的分析河南省手足口病標本分離柯薩奇病毒A組16型(coxsachievirus A 16,CVA16)VP4的基因特征,并比較VP4與VP1遺傳進化分析的差異。方法對分離自河南省手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)患兒的8株CVA16,采用反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(RT-PCR)方法進行VP4區(qū)域擴增并對擴增產(chǎn)物進行測序,用分子生物學軟件ATGC進行序列拼接,Bioedit比對剪齊,用MEGA 4.0軟件進行同源性分析,并與已報道的CVA16標準株序列構(gòu)建基因進化樹。結(jié)果河南省8株毒株VP4核苷酸同源性為91.3%~98.1%、氨基酸同源性為100.0%,與國際原型株CA16/G10/RSA/1951(A型)比對,VP4核苷酸同源性為79.7%~82.6%,氨基酸同源性為100.0%;與B1a、B1b和B2型代表株核苷酸同源性分別為92.3%~95.7%、92.8%~98.6%、88.9%~91.8%,氨基酸同源性均為100.0%。河南省分離的CVA16毒株均屬于B1亞型,有B1a和B1b兩個進化支共同存在和循環(huán),但VP4與VP1的進化樹分型不完全一致。結(jié)論 VP4基因不能作為CVA16病毒基因亞型分型的依據(jù)。
【作者單位】： 河南省疾病預防控制中心傳染病預防控制所;
【關(guān)鍵詞】： 柯薩奇病毒A組型 VP 進化樹
【基金】：河南省醫(yī)學科技攻關(guān)計劃重大項目(201001015) 河南省醫(yī)學科技攻關(guān)計劃普通項目(2011020175)
【分類號】：R373
【正文快照】： 目前已知的人類腸道病毒(human enterovir-us)有119個型別,腸道病毒(enterovirus)型別眾多,引起人類的疾病也多種多樣[1]。VP1區(qū)域是進行人腸道病毒分型的主要依據(jù),依據(jù)VP1進行基因進化樹分型可以將腸道病毒分為A、B、C、D四組[2]。有研究顯示在腸道病毒A組內(nèi),用VP4基因進行遺

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本文編號：404437