人呼吸道合胞病毒蘭州株全基因組序列測(cè)定及分析
發(fā)布時(shí)間:2024-04-21 23:51
目的為了解人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytium virus,HRSV)蘭州株(HRSV LZ01/09)的遺傳特征及分子進(jìn)化規(guī)律,進(jìn)一步豐富RSV基因組數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)HRSV LZ01/09的全基因組序列進(jìn)行測(cè)定及分析。方法通過(guò)RT-PCR法對(duì)HRSV LZ01/09全基因組片段進(jìn)行擴(kuò)增及序列測(cè)定,利用分子生物學(xué)軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行拼接,并與GenBank登錄的RSV實(shí)驗(yàn)參比株和各基因型代表株進(jìn)行分子進(jìn)化分析。結(jié)果 HRSV LZ01/09全基因組全長(zhǎng)為15 204 bp,基因組的結(jié)構(gòu)為NS1-NS2-N-P-M-SH-G-F-M2-1-M2-2-L,與報(bào)道的RSV實(shí)驗(yàn)參比株相同;全基因組序列比對(duì)分析表明,HRSV LZ01/09蘭州株基因組序列與RSV RSS2株的同源性最高,為96. 7%,與其他RSV-A亞型毒株同源性次之,為94. 9%~95. 2%,與RSV-B亞型9320株同源性最低,為80. 9%;依據(jù)RSV-G基因的第2個(gè)可變區(qū)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析,HRSV LZ01/09蘭州株基因組與NA1病毒分離株屬于同一個(gè)分支。結(jié)論 HRSV LZ01...
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 毒株、載體及細(xì)胞
1.2 主要試劑及儀器
1.3 引物設(shè)計(jì)及合成
1.4 目的基因的擴(kuò)增
1.5 克隆質(zhì)粒的構(gòu)建
1.6 序列分析及病毒全基因組和G基因的高變區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
1.7 核苷酸和氨基酸變異位點(diǎn)的分布
2 結(jié)果
2.1 HRSV LZ01/09株基因組的分段擴(kuò)增、測(cè)序及拼接
2.2 HRSV LZ01/09株基因組的結(jié)構(gòu)特征
2.3 HRSV LZ01/09株基因組全序列系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
2.4 HRSV LZ01/09株基因組全序列同源性分析
2.5 核苷酸和氨基酸變異位點(diǎn)的分布
2.6 HRSV LZ01/09株基因型分析
3 討論
本文編號(hào):3961629
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 毒株、載體及細(xì)胞
1.2 主要試劑及儀器
1.3 引物設(shè)計(jì)及合成
1.4 目的基因的擴(kuò)增
1.5 克隆質(zhì)粒的構(gòu)建
1.6 序列分析及病毒全基因組和G基因的高變區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
1.7 核苷酸和氨基酸變異位點(diǎn)的分布
2 結(jié)果
2.1 HRSV LZ01/09株基因組的分段擴(kuò)增、測(cè)序及拼接
2.2 HRSV LZ01/09株基因組的結(jié)構(gòu)特征
2.3 HRSV LZ01/09株基因組全序列系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
2.4 HRSV LZ01/09株基因組全序列同源性分析
2.5 核苷酸和氨基酸變異位點(diǎn)的分布
2.6 HRSV LZ01/09株基因型分析
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