單純皰疹病毒I型UL43基因體外表達(dá)及功能初步研究
發(fā)布時(shí)間:2017-05-16 20:27
本文關(guān)鍵詞:單純皰疹病毒I型UL43基因體外表達(dá)及功能初步研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的: 體外構(gòu)建HSV-1UL43真核表達(dá)載體,利用生物信息學(xué)分析結(jié)果,在體外對(duì)其表達(dá)的蛋白質(zhì)的功能進(jìn)行初步研究,為探究UL43編碼蛋白質(zhì)與藥物作用的靶點(diǎn)打下基礎(chǔ)。 方法: 1.利用生物信息學(xué)DNAStar軟件,Protpara軟件soPMA程序ESyPred3D程序http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/;http://mendel.imp.ac.at/sat/DAS/DAS.html等網(wǎng)站或程序?qū)SV-1UL43遺傳進(jìn)化樹和UL43p結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析。 2.利用基因工程原理方法,構(gòu)建HSV-1UL43用于體外表達(dá)的T克隆載體和真核表達(dá)載體。 3.構(gòu)建HSV-1膜融合過(guò)程中必要的四種基本糖蛋白(gB,gD,gH-gL)T克隆載體以及真核表達(dá)載體。利用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染效應(yīng)細(xì)胞,細(xì)胞免疫酶聯(lián)分析,體外分析UL43p在細(xì)胞到細(xì)胞膜融合過(guò)程中的作用。 結(jié)果: 1. HSV-1UL43基因存在于α和γ類皰疹病毒中,并與猴類同源性較高,與同為人類皰疹病毒的HHV-3及HHV-8同源性較低。但結(jié)構(gòu)顯示Prv UL43同源性與HSV-1較高。 2. HSV-1UL43p中磷酸化位點(diǎn)較為豐富。UL43p跨膜結(jié)構(gòu)綜合預(yù)測(cè)為8跨膜,與PrvUL43p相類似。 3.體外構(gòu)建的克隆載體和真核表達(dá)載體經(jīng)測(cè)序后,其序列與實(shí)際情況相符。HSV-1UL43p分子量為34kDa。 4.細(xì)胞免疫酶聯(lián)反應(yīng)顯示UL43p有抑制膜融合的作用,其效果呈劑量依賴性。 結(jié)論:作為單純皰疹病毒編碼的跨膜蛋白,HSV-1UL43p與HSV-1UL20p等非糖蛋白類似,在細(xì)胞到細(xì)胞膜融合過(guò)程中發(fā)揮著“剎車員”的作用:具有抑制膜融合的效果。
【關(guān)鍵詞】:單純皰疹病毒1型 跨膜蛋白 細(xì)胞到細(xì)胞膜融合 抑制現(xiàn)象
【學(xué)位授予單位】:暨南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R373
【目錄】:
- 中文摘要3-4
- ABSTRACT4-6
- 目錄6-9
- 主要英文縮略詞表9-10
- 第一章 前言10-27
- 1.1 皰疹病毒感染性10-11
- 1.2 HSV-1UL43 基因11-15
- 1.3 生物信息學(xué)15-16
- 1.4 生物信息學(xué)的研究方向16-18
- 1.4.1 序列比對(duì)16-17
- 1.4.2 蛋白質(zhì)的分析17-18
- 1.4.3 蛋白質(zhì)功能性預(yù)測(cè)18
- 1.5 病毒侵入的方式18-21
- 1.6 皰疹病毒融合機(jī)制21-22
- 1.7 病毒誘導(dǎo)的膜融合和自我抑制現(xiàn)象22-24
- 1.8 無(wú)病毒細(xì)胞融合模型24-25
- 1.9 本研究目的、意義和內(nèi)容25-27
- 第二章 HSV-1UL43 基因遺傳信息學(xué)分析27-36
- 2.1 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>27
- 2.2 主要生物分析軟件和網(wǎng)站27
- 2.3 實(shí)驗(yàn)方法27-28
- 2.3.1 HSV-1 UL43 基因以及其同源基因核苷酸序列遺傳進(jìn)化樹分析27
- 2.3.2 HSV-1 UL43 基因以及其同源基因核苷酸序列多重比對(duì)27
- 2.3.3 HSV-1 和 Prv UL43p 基本特性分析27
- 2.3.4 HSV-1 UL43p 立體構(gòu)象分析27-28
- 2.3.5 HSV-1 UL43p 和 Prv UL43p 疏水性分析28
- 2.3.6 HSV-1 UL43p 和 Prv UL43p 跨膜結(jié)構(gòu)分析28
- 2.3.7 HSV-1 UL43p 和 Prv UL43p 磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)28
- 2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果28-34
- 2.4.1 遺傳進(jìn)化樹分析28-29
- 2.4.2 核苷酸及氨基酸同源比對(duì)29-30
- 2.4.3 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析30-31
- 2.4.4 二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)31
- 2.4.5 蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)31-32
- 2.4.6 蛋白質(zhì)疏水性分析32
- 2.4.7 蛋白質(zhì)跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和分析32-33
- 2.4.8 蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)33-34
- 2.5 本章小結(jié)34-36
- 第三章 HSV-1UL43 基因載體構(gòu)建以及體外表達(dá)36-45
- 3.1 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>36
- 3.2 主要實(shí)驗(yàn)材料及試劑36-38
- 3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料36
- 3.2.2 主要試劑配制方法36-38
- 3.2.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器38
- 3.3 實(shí)驗(yàn)方法38-42
- 3.3.1 病毒的擴(kuò)增38
- 3.3.2 UL43 基因的克隆和測(cè)序38-39
- 3.3.3 PCR 產(chǎn)物的純化和回收:39
- 3.3.4 目的片段與克隆載體體外重組39-40
- 3.3.5 感受態(tài)細(xì)胞的制備40
- 3.3.6 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化40
- 3.3.7 克隆載體的鑒定40
- 3.3.8 質(zhì)粒的鑒定與提取40-41
- 3.3.9 構(gòu)建 HSV-1UL43 真核表達(dá)載體及鑒定表達(dá)后目的蛋白41-42
- 3.4 結(jié)果42-44
- 3.4.1 HSV-1UL43 基因的克隆和測(cè)序42-43
- 3.4.2 PCR 鑒定重組質(zhì)粒43-44
- 3.4.3 HSV-1UL43 基因的表達(dá)44
- 3.5 本章小結(jié)44-45
- 第四章 HSV-1 UL43p 功能初步研究45-60
- 4.1 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>45
- 4.2 主要實(shí)驗(yàn)材料及試劑45-46
- 4.2.1 瞬時(shí)轉(zhuǎn)染試劑與材料45
- 4.2.2 CELISA 試劑與材料45-46
- 4.2.3 細(xì)胞融合分析試劑與材料46
- 4.3 實(shí)驗(yàn)方法46-53
- 4.3.1 HSV-1 糖蛋白 gB, gD, gH, gL 克隆載體構(gòu)建46-49
- 4.3.2 HSV-1 糖蛋白 gB, gD, gH, gL 真核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建49-50
- 4.3.3 Westemblot 鑒定分析50
- 4.3.4 脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染 COS 細(xì)胞:50
- 4.3.5 瞬時(shí)轉(zhuǎn)染方法50
- 4.3.6 細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞表面表達(dá)總方法50-51
- 4.3.7 細(xì)胞融合分析方法51-52
- 4.3.8 注意事項(xiàng)52-53
- 4.4 結(jié)果53-59
- 4.4.1 HSV-1gB,gD,gH,gL 基因擴(kuò)增及測(cè)序53-54
- 4.4.2 特異性抗體鑒定蛋白質(zhì)的表達(dá)54-55
- 4.4.3 COS 細(xì)胞中 HSV-1 糖蛋白的表達(dá)55-56
- 4.4.4 無(wú)病毒細(xì)胞融合模型效果56-57
- 4.4.5 UL43p 在膜融合過(guò)程中的作用57-59
- 4.5 本章小結(jié)59-60
- 第五章 討論60-65
- 第六章 結(jié)論和展望65-67
- 6.1 全文總結(jié)65
- 6.2 展望65-67
- 參考文獻(xiàn)67-77
- 攻讀碩士學(xué)位期間論文發(fā)表情況77-78
- 致謝78
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 張春霆;生物信息學(xué)的現(xiàn)狀與展望[J];中國(guó)青年科技;2001年01期
本文關(guān)鍵詞:單純皰疹病毒I型UL43基因體外表達(dá)及功能初步研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):371866
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