發(fā)布時(shí)間：2021-11-20 04:52

　　背景：鼠疫耶爾森氏菌是烈性傳染病鼠疫的病原體，曾給人類帶來(lái)了巨大的災(zāi)難。本文報(bào)道了對(duì)人不致病的鼠疫耶爾森氏菌布氏田鼠疫源地菌株91001全基因組序列，并進(jìn)行了比較基因組學(xué)分析和初步的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。 方法：采用全基因組鳥槍法測(cè)定91001菌株的全基因組序列，利用比較基因組方法對(duì)91001與另兩株鼠疫耶爾森氏菌（CO92和KIM）的全基因組進(jìn)行比較研究；同時(shí)針對(duì)一些有意義的基因在多株鼠疫耶爾森氏菌的中國(guó)分離株中進(jìn)行了驗(yàn)證；并在基因組研究的基礎(chǔ)上開展了初步的蛋白質(zhì)學(xué)研究。 結(jié)果：91001菌株的基因組包括一條染色體和四個(gè)質(zhì)粒。pPCP1質(zhì)粒長(zhǎng)度為9，609bp，與參考菌株基本一致；pCD1質(zhì)粒是編碼Ⅲ型分泌系統(tǒng)的質(zhì)粒，長(zhǎng)度為70，159bp，編碼情況與參考菌株基本相同，但重排導(dǎo)致了質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)與參考菌株存在差異；pMT1質(zhì)粒長(zhǎng)度為106，642bp，保留了較多的原始質(zhì)粒片段，毒力相關(guān)基因與參考菌株沒有差異；pCRY質(zhì)粒是本研究中新發(fā)現(xiàn)的質(zhì)粒，在國(guó)內(nèi)外研究中未曾報(bào)道，這一質(zhì)粒長(zhǎng)度為21，742bp，具有獨(dú)立復(fù)制能力，有一群編碼Ⅳ型分泌系統(tǒng)的基因。91001菌株的染色體長(zhǎng)度為4，59... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)人民解放軍軍事科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】：214 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

完成圖繪制階段填補(bǔ)contig之間缺口時(shí)，一個(gè)%孔PCR板的擴(kuò)增情況，中間泳道為DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)(補(bǔ)&oT141digestoNAMarker，寶生物公司出品);陽(yáng)性擴(kuò)增產(chǎn)物純化后以上下游引物分別測(cè)序，某些缺口擴(kuò)增陰性則需要參考別的信息進(jìn)行組合再擴(kuò)增

株染色體DNA的I-Ceul酶切PFGE電Ladde「，l泳道為未經(jīng)酶切的染色體DNAA，長(zhǎng)度為32kb的片段未能顯示。成91001的基因組包括一條長(zhǎng)度017042)，以及四個(gè)質(zhì)粒，分別為p7046)，pCDI(長(zhǎng)度為70，159bp，登42bp，登錄號(hào)為AEO17O45)和pC44)。的鼠疫耶爾森氏菌一般含有三個(gè)典;但某些菌株中還有其它非典型質(zhì)株菌的質(zhì)粒分析發(fā)現(xiàn)，20株含有MD左右[’0’];董興齊等人從云南分5.9kb的未知質(zhì)粒，并進(jìn)行了序個(gè)長(zhǎng)度為19kb的質(zhì)粒是pPcPI

質(zhì)交換還不是很頻繁，因此非典型質(zhì)粒在鼠疫耶爾森氏菌中見，但仍可觀察到逐漸增多的趨勢(shì)【’“2]。cPI質(zhì)粒pPcPI質(zhì)粒是鼠疫耶爾森氏菌中目前己知最小的毒，其編碼的Pla蛋白在鼠疫菌的致病過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用;但些菌株雖然缺失pPCPI質(zhì)粒，但對(duì)于小白鼠仍有很強(qiáng)的毒力[l0，述91001菌株的pPePI質(zhì)粒長(zhǎng)度為9609bp，NCBI核酸數(shù)據(jù)AEO17046;本研究中以15100序列的第一個(gè)堿基作為pPCPI。序列G+C含量為45.26%，在pPCPI質(zhì)粒中共預(yù)測(cè)了10個(gè)因編號(hào)以“pPCP”作為前綴，第一個(gè)基因標(biāo)記為“pPCPol”，遞增，詳細(xì)的基因信息見附表1;pPCPI質(zhì)粒的基因示意圖見圖株ppCpl質(zhì)粒與參考菌株CO92和KIM的相應(yīng)質(zhì)粒ALIOFo53945[62，73]同源性極高，僅有少量的單核普酸變異，三個(gè)序單比較情況見表9;表中可以看到有三個(gè)位點(diǎn)的突變是由于單起的，這種單堿基重復(fù)引起的突變可能是細(xì)菌適應(yīng)性進(jìn)化的一[’0，]。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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