中華按蚊miRNAs的全基因組鑒定和分類
發(fā)布時間:2021-09-16 20:31
小分子RNA(miRNA)是一類小的非編碼RNA,在細胞凋亡、分化和先天性免疫等生物學過程中發(fā)揮著重要作用。中華按蚊是中國和東南亞國家分布最廣的瘧疾傳播媒介,本研究采用生物信息學方法注釋了中華按蚊基因組的小分子RNA,測序和鑒定了7個樣本的小分子RNA。這7個樣本來自實驗室擬除蟲菊酯感性品系、3個野外擬除蟲菊酯抗性群體和3個野外擬除蟲菊酯感性群體;诨蚪M序列共鑒定出272個miRNA,總長為24 978 bp,占基因組的0.009%。從這7個樣本的測序和注釋中,共鑒定出62個已知的miRNA和432個新的miRNA。這些樣本間已知miRNA的數(shù)量沒有明顯的差異,說明這些已知的miRNA非常普通的,表達量最高。在實驗室和野外樣品之間以及除蟲菊酯抗性和感性樣品之間,新miRNA的數(shù)量沒有明顯的差異。本研究提供了中華按蚊miRNA的信息框架,然而,還需要進一步的研究來揭示這些樣品中miRNA種類之間的關系,以及這些miRNA在不同樣品中對擬除蟲菊酯抗性的調(diào)控機制。
【文章來源】:寄生蟲與醫(yī)學昆蟲學報. 2019,26(02)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 Materials and Methods
1.1 Genome sequence resource of Anopheles sinensis
1.2 Small RNA sequencing of field pyrethriod-resistant and -susceptible populations
1.3 Identification and classification of miRNAs
2 Results
2.1 Small non-coding RNAs in An. sinensis genome
2.2 Small RNA sequencing from the individual libraries in Anopheles sinensis
2.3 Known and novel miRNAs from seven individual libraries
3 Discussion
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中華按蚊的分子鑒定標準[J]. 楊飛龍,李旭東,閆振天,陳斌. 重慶師范大學學報(自然科學版). 2014(04)
本文編號:3397246
【文章來源】:寄生蟲與醫(yī)學昆蟲學報. 2019,26(02)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 Materials and Methods
1.1 Genome sequence resource of Anopheles sinensis
1.2 Small RNA sequencing of field pyrethriod-resistant and -susceptible populations
1.3 Identification and classification of miRNAs
2 Results
2.1 Small non-coding RNAs in An. sinensis genome
2.2 Small RNA sequencing from the individual libraries in Anopheles sinensis
2.3 Known and novel miRNAs from seven individual libraries
3 Discussion
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中華按蚊的分子鑒定標準[J]. 楊飛龍,李旭東,閆振天,陳斌. 重慶師范大學學報(自然科學版). 2014(04)
本文編號:3397246
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