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anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡相關(guān)基因的差異表達(dá)及其鑒定

發(fā)布時(shí)間:2017-04-16 14:17

  本文關(guān)鍵詞:anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡相關(guān)基因的差異表達(dá)及其鑒定,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:背景:anisomycin作為一種蛋白合成抑制劑可以誘導(dǎo)多種細(xì)胞發(fā)生凋亡,此前本課題組已發(fā)現(xiàn)anisomycin能抑制人類急性T淋巴細(xì)胞性白血病(Jurkat T)細(xì)胞增殖、阻滯細(xì)胞周期和誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,JNK信號(hào)通路的活化與anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡有關(guān),miRNA let-7c可能參與JNK信號(hào)通路的活化介導(dǎo)JurkatT細(xì)胞凋亡,顯示其應(yīng)用于T淋巴細(xì)胞性白血病臨床治療的潛在可能性。因此,探明anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡的機(jī)制具有重要的科學(xué)意義。目前已發(fā)現(xiàn)哺乳動(dòng)物細(xì)胞存在諸多與細(xì)胞凋亡相關(guān)的基因,在anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡過程中究竟有哪些細(xì)胞凋亡相關(guān)基因參與?它們是否與JNK/miRNAlet-7c關(guān)聯(lián)?本研究利用qPCR基因芯片技術(shù)首次比較系統(tǒng)地分析了anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡相關(guān)基因的的差異性表達(dá)譜,以期進(jìn)一步闡明anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡的機(jī)制,為其臨床應(yīng)用奠定一定基礎(chǔ)。 目的:通過qPCR基因芯片技術(shù)篩選anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡相關(guān)基因的差異表達(dá)譜,確證差異表達(dá)基因E2F2是否與anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡有關(guān),E2F2分子與介導(dǎo)anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡的miRNA let-7c之間是否存在關(guān)聯(lián)。 方法:鏡下觀察不同濃度anisomycin處理組Jurkat T細(xì)胞形成集落的大小和數(shù)量;熒光顯微鏡下觀察不同濃度anisomycin處理后Jurkat T細(xì)胞核染色質(zhì)形態(tài)的變化;流式細(xì)胞術(shù)分析不同濃度anisomycin作用下Jurkat T細(xì)胞的凋亡率;qPCR基因芯片從88種細(xì)胞凋亡相關(guān)基因中篩選anisomycin作用后差異表達(dá)顯著的13個(gè)基因;RT-PCR和qPCR在mRNA水平驗(yàn)證篩選出顯著差異表達(dá)的基因,從中選出感興趣的E2F2以確定其作用。轉(zhuǎn)染miRNA let-7c模擬物和miRNAlet-7c抑制劑至Jurkat T細(xì)胞中,流式細(xì)胞術(shù)檢測細(xì)胞凋亡率,qPCR和WesternBlot分別在基因和蛋白水平檢測miRNA let-7c和E2F2的含量變化以證實(shí)miRNAlet-7c和E2F2與Jurkat T細(xì)胞凋亡是否有關(guān);轉(zhuǎn)染E2F2siRNA至Jurkat T細(xì)胞中,流式細(xì)胞術(shù)檢測細(xì)胞凋亡率,qPCR和Western Blot分別在基因水平和蛋白水平檢測let-7c和E2F2的含量變化以進(jìn)一步確證E2F2與miRNA let-7c介導(dǎo)anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡是否關(guān)聯(lián)。* 結(jié)果:隨著anisomycin濃度的升高,Jurkat T細(xì)胞集落變小和數(shù)量減少;JurkatT細(xì)胞核皺縮,凋亡小體形成,凋亡細(xì)胞百分比與anisomycin的濃度成依賴性遞增。qPCR基因芯片分析顯示,anisomycin處理Jurkat T細(xì)胞1h后,AIFM2、CAS5、CD226、CD27、CIDEA、DAPK2、EGFR、ERBB3、FADD、FASLG、IFNA2、IFNB1、IGF1、IGF1R、IKBKG、IL10、IL1A、IL1B、IL6R、IL7、MAP3K1、MAP3K10、 MAP3K14、 NTRK1、 PDCD1、 PPP3CC、 STAT1、 STAT5B和TNFRSF10A共29個(gè)基因表達(dá)上調(diào),AKT2、AKT3、CAS4、CD24、E2F2、EndoG、IKBKB、IL4、MAP3K5、PIK3R2、TNF和TNFRSF10B共12個(gè)基因表達(dá)下調(diào),,其中,CD226、FADD和IL1B上調(diào)高達(dá)20~45倍,AKT2、CD24、E2F2、EndoG、IL4和PIK3R2基因下調(diào)10~20倍。anisomycin處理Jurkat T細(xì)胞6h后,APAF1、API5、CAS7、CAS9、CD226、CD27、E2F2、ERBB3、IFNB1、IGF1R、IL2、RIPK1、STAT1、TNFRSF10A和XIAP15個(gè)基因表達(dá)上調(diào),DAPK3、FASLG、IKBKG、IL6R和IRAK15個(gè)基因表達(dá)下調(diào),其中,CAS7、CAS9、CD226、IL2和TNFRSF10A5個(gè)基因上調(diào)達(dá)10~20倍,而FASLG和IL6R下調(diào)均達(dá)15倍左右。篩選出差異倍數(shù)10倍以上的13個(gè)基因,即CD226、CD24、E2F2、FASLG、TNFRSF10A、CAS7、CAS9、PIK3R2、IKBKB、AKT2、AKT3、FADD和EndoG,qPCR顯示E2F2、PIK3R2、IKBKB、CD24、CAS9、CD226和TNFRSF10A7基因的qPCR結(jié)果與芯片的結(jié)果一致。miRNA let-7c可以促進(jìn)Jurkat T細(xì)胞的凋亡,qPCR和Western Blot顯示miRNAlet-7c增加E2F2的水平;敲低E2F2基因可以抑制細(xì)胞凋亡,并一定程度促進(jìn)let-7c的基因表達(dá)。 結(jié)論:anisomycin能誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞明顯凋亡,可能與E2F2、PIK3R2、CD24、IKBKB、CAS9、CD226和TNFRSF10A有關(guān);E2F2在anisomycin誘導(dǎo)Jukat T細(xì)胞凋亡過程中與miRNA let-7c相關(guān)聯(lián)。這些結(jié)果有助于進(jìn)一步闡明anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡的機(jī)制。
【關(guān)鍵詞】:anisomycin 基因芯片 篩選 E2F2 miRNA let-7c 凋亡 Jurkat T
【學(xué)位授予單位】:暨南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R329.2
【目錄】:
  • 摘要3-5
  • Abstract5-11
  • 前言11-29
  • 1 腫瘤的發(fā)生機(jī)制11-13
  • 1.1 細(xì)胞周期檢驗(yàn)點(diǎn)與腫瘤發(fā)生的關(guān)系11-12
  • 1.2 細(xì)胞凋亡與腫瘤發(fā)生的關(guān)系12-13
  • 1.3 自噬與腫瘤發(fā)生的關(guān)系13
  • 2 細(xì)胞凋亡機(jī)制13-17
  • 2.1 細(xì)胞表面凋亡受體 Fas 介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡14-15
  • 2.2 線粒體途徑介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡15-16
  • 2.3 細(xì)胞凋亡相關(guān)因子16-17
  • 3 anisomycin 的抗腫瘤作用17-18
  • 4 qPCR 基因芯片技術(shù)18-19
  • 5 細(xì)胞凋亡相關(guān)基因19-27
  • 5.1 CD22619-20
  • 5.2 CD2420
  • 5.3 E2F220-21
  • 5.4 TNFRSF10A21-22
  • 5.5 Endonuclease G22
  • 5.6 AKT 家族22-23
  • 5.7 Caspase 家族23-24
  • 5.8 FADD24-25
  • 5.9 FASLG25-26
  • 5.10 IKBKB26
  • 5.11 PIK3R226-27
  • 6 研究思路與目的27-29
  • 材料與方法29-50
  • 1 細(xì)胞株29
  • 2 試劑29-31
  • 3 主要儀器31-32
  • 4 主要溶液的配制32-35
  • 5 細(xì)胞培養(yǎng)35
  • 6 集落的觀察35
  • 7 Hoechst 染色35-36
  • 8 Annexin V / PI 雙染色36
  • 9 PCR Array36-42
  • 9.1 提取細(xì)胞總 RNA36-37
  • 9.2 RNA 樣品的完整性、濃度和純度的檢測37
  • 9.3 逆轉(zhuǎn)錄37-38
  • 9.4 PCR Array 實(shí)時(shí)定量 PCR 檢測38-39
  • 9.5 RT-PCR39-42
  • 9.5.1 細(xì)胞總 RNA 的提取39
  • 9.5.2 RT39-40
  • 9.5.3 PCR40-42
  • 9.6 實(shí)時(shí)定量 PCR42
  • 10 Western Blot42-44
  • 10.1 細(xì)胞胞漿蛋白的提取42-43
  • 10.2 電泳43
  • 10.3 轉(zhuǎn)膜43
  • 10.4 封閉、抗體結(jié)合與顯色43-44
  • 11 miRNA let-7c 的應(yīng)用44-47
  • 11.1 細(xì)胞處理及轉(zhuǎn)染44-45
  • 11.2 Annexin V/PI 雙染色45
  • 11.3 qPCR45
  • 11.4 Western Blot45-46
  • 11.5 ELISA46-47
  • 12 E2F2 siRNA 的應(yīng)用47-49
  • 12.1 細(xì)胞處理及轉(zhuǎn)染47
  • 12.2 Annexin V/PI 雙染色47-48
  • 12.3 qPCR48
  • 12.4 Western Blot48-49
  • 12.4.1 細(xì)胞內(nèi)核蛋白的提取48-49
  • 12.5 ELISA49
  • 13 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析49-50
  • 結(jié)果50-72
  • 1 anisomycin 抑制 Jurat T 細(xì)胞集落形成的影響50
  • 2 anisomycin 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞核邊集的影響50-51
  • 3 anisomycin 誘導(dǎo) Jurkat T 細(xì)胞凋亡51-52
  • 4 anisomycin 誘導(dǎo) Jurkat T 細(xì)胞凋亡相關(guān)基因差異表達(dá)的篩選52-57
  • 5 anisomycin 誘導(dǎo) Jurkat T 細(xì)胞凋亡基因差異表達(dá)的鑒定57-62
  • 6 miRNA let-7c 在 anisomycin 誘導(dǎo) Jurkat T 細(xì)胞凋亡中的作用62
  • 7 miRNA let-7c 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞內(nèi) E2F2 的影響62-66
  • 7.1 miRNA let-7c 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞 E2F2 mRNA 水平的影響62-65
  • 7.2 miRNA let-7c 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞 E2F2 蛋白水平的影響65-66
  • 8 miRNA let-7c 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞分泌細(xì)胞因子的影響66-67
  • 9 E2F2 siRNA 在 anisomycin 誘導(dǎo) Jurkat T 細(xì)胞凋亡中的作用67-69
  • 9.1 E2F2 siRNA 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞 E2F2 蛋白水平的影響67
  • 9.2 E2F2 siRNA 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞凋亡的影響67-69
  • 10 E2F2 siRNA 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞內(nèi) miRNA let-7c 的影響69-71
  • 10.1 Jurkat T 細(xì)胞中 miRNA let-7c 在基因水平的半定量變化69
  • 10.2 E2F2 siRNA 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞 miRNA let-7c mRNA 的定量影響69-71
  • 11 anisomycin 對(duì) Jurkat T 細(xì)胞分泌細(xì)胞因子的影響71-72
  • 討論72-78
  • 1 凋亡相關(guān)基因差異表達(dá)譜的分析72-74
  • 2 miRNA let-7c 在 anisomycin 誘導(dǎo) Jurkat T 細(xì)胞凋亡中的作用74-75
  • 3 E2F2 在 anisomycin 誘導(dǎo) Jurkat T 細(xì)胞凋亡中的作用75-76
  • 4 miRNA let-7c 與 E2F2 之間存在的可能關(guān)系76-78
  • 小結(jié)78-79
  • 參考文獻(xiàn)79-86
  • 發(fā)表論文86-87
  • 致謝87-88
  • 英文縮略詞表88

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 Daniele Baiz;Barbara Dapas;Rossella Farra;Bruna Scaggiante;Gabriele Pozzato;Fabrizio Zanconati;Nicola Fiotti;Lara Consoloni;Sara Chiaretti;Gabriele Grassi;;Bortezomib effect on E2F and cyclin family members in human hepatocellular carcinoma cell lines[J];World Journal of Gastroenterology;2014年03期


  本文關(guān)鍵詞:anisomycin誘導(dǎo)Jurkat T細(xì)胞凋亡相關(guān)基因的差異表達(dá)及其鑒定,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):311000

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