粘質(zhì)沙雷氏菌在太空飛行后變化的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-15 09:18
目的:細(xì)菌會(huì)隨著人類(lèi)或航天器部件進(jìn)入太空,有研究表明細(xì)菌在空間環(huán)境作用下毒力增強(qiáng),然而,關(guān)于這一效應(yīng)的普遍性及機(jī)制尚未完全闡明。粘質(zhì)沙雷氏菌是一種常見(jiàn)的臨床條件致病菌,曾在空間站多次檢出。本研究利用神舟八號(hào)飛船搭載的機(jī)會(huì),采用表型研究相關(guān)實(shí)驗(yàn),并利用比較基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及蛋白質(zhì)組學(xué)的生物信息學(xué)方法探索粘質(zhì)沙雷氏菌經(jīng)歷了空間飛行環(huán)境作用后的變化,并初步探討其機(jī)制。方法:(1)粘質(zhì)沙雷氏菌通過(guò)神舟八號(hào)飛船搭載獲得空間飛行實(shí)驗(yàn)組,地面設(shè)同步溫度對(duì)照組,實(shí)驗(yàn)組及對(duì)照組均經(jīng)過(guò)16SrDNA進(jìn)一步驗(yàn)證。(2)通過(guò)革蘭氏染色、紙片法耐藥實(shí)驗(yàn)、溶血實(shí)驗(yàn)、生長(zhǎng)曲線測(cè)定,Biolog法對(duì)空間飛行粘質(zhì)沙雷氏菌株和地面對(duì)照菌株進(jìn)行形態(tài)、耐藥性、溶血性、生長(zhǎng)速率、生化代謝譜的觀察比較,明確空間飛行株的生物學(xué)特性,并獲得粘質(zhì)沙雷氏菌變異株LCT-SM166、LCT-SM262、地面對(duì)照株為L(zhǎng)CT-SM213。(3)采用高通量Illumina測(cè)序技術(shù)對(duì)樣品LCT-SM166、LCT-SM262、LCT-SM213進(jìn)行Paired-End測(cè)序。對(duì)產(chǎn)出的數(shù)據(jù)進(jìn)行De novo組裝,并進(jìn)行基因預(yù)測(cè)及注釋分析。對(duì)空間變...
【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
搭載裝置
圖 2 搭載樣品包.菌株的培養(yǎng)和保存.1.培養(yǎng)基配制:配制 LB 固體培養(yǎng)基 6L,調(diào)節(jié) PH 7.0~7.2,121℃高壓蒸汽滅菌 20min。滅后,從滅菌鍋中取出培養(yǎng)基,冷卻至 50~60℃,開(kāi)始在生物安全柜中倒平板約 20ml 培養(yǎng)基 個(gè)平板,總共倒 300 個(gè)平板用于稀釋涂布。在生物安全柜置 1d,備用。*LB 配方:胰蛋白胨 10g,酵母粉 5g,氯化鈉 10g,瓊脂 17g。.2.稀釋涂布:對(duì)原樣品進(jìn)行從 10-1到 10-6梯度稀釋,選擇 10-2、10-4,10-6進(jìn)行涂布,每釋度п個(gè)重復(fù),分別取 100ul 各稀釋度菌懸液涂布于 LB 平板р,于 37℃培中倒置培養(yǎng)。培養(yǎng)至 20h 后,取出平板,選出菌落分布比較合適的平板,每品選擇 2~5 個(gè)平板,每個(gè)平板選擇п同形態(tài)的菌落(相同形態(tài)的菌落選擇 3
面:好號(hào)的平板按順序擺放,同時(shí)將平板р單菌落的編號(hào) 式п份的竹簽挑取對(duì)應(yīng)編號(hào)的單菌落在斜面р進(jìn)行劃線,每個(gè)單菌,化完斜面后將其放置在 37℃培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng) 18~24h,每 支進(jìn)行 16s rDNA 擴(kuò)增測(cè)序,另外兩支放在 4℃冰箱保藏。 16s rDNA 鑒定實(shí)驗(yàn)流程增 16S rDNA:DNA 是 16S rRNA 序列的基因,長(zhǎng)約 1.5kb。將已分純的單菌直16S rDNA,部分通過(guò)菌液 PCR 較難擴(kuò)增的單菌經(jīng)擴(kuò)大培養(yǎng)后提擴(kuò)增所用引物序列如н: AGAGTTTGATCATGGCTCAG TAGGGTTACCTTGTTACGACTT的高保真 LA Taq 酶擴(kuò)增得到高質(zhì)量 PCR 產(chǎn)物。如圖 3:
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]空間生命科學(xué)研究與展望[J]. 郭英華,劉長(zhǎng)庭. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2011(04)
[2]模擬微重力對(duì)肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞窖蛋白-1和內(nèi)皮型一氧化氮合酶表達(dá)的影響[J]. 康春燕,袁明,鄒琳,章燁,李天志,王俊鋒,劉長(zhǎng)庭. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2010(11)
[3]模擬微重力對(duì)人肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡的影響[J]. 康春燕,劉長(zhǎng)庭,鄒琳,袁明,章燁,李天志,王洋,王德龍,劉巖. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2010(11)
本文編號(hào):2918041
【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
搭載裝置
圖 2 搭載樣品包.菌株的培養(yǎng)和保存.1.培養(yǎng)基配制:配制 LB 固體培養(yǎng)基 6L,調(diào)節(jié) PH 7.0~7.2,121℃高壓蒸汽滅菌 20min。滅后,從滅菌鍋中取出培養(yǎng)基,冷卻至 50~60℃,開(kāi)始在生物安全柜中倒平板約 20ml 培養(yǎng)基 個(gè)平板,總共倒 300 個(gè)平板用于稀釋涂布。在生物安全柜置 1d,備用。*LB 配方:胰蛋白胨 10g,酵母粉 5g,氯化鈉 10g,瓊脂 17g。.2.稀釋涂布:對(duì)原樣品進(jìn)行從 10-1到 10-6梯度稀釋,選擇 10-2、10-4,10-6進(jìn)行涂布,每釋度п個(gè)重復(fù),分別取 100ul 各稀釋度菌懸液涂布于 LB 平板р,于 37℃培中倒置培養(yǎng)。培養(yǎng)至 20h 后,取出平板,選出菌落分布比較合適的平板,每品選擇 2~5 個(gè)平板,每個(gè)平板選擇п同形態(tài)的菌落(相同形態(tài)的菌落選擇 3
面:好號(hào)的平板按順序擺放,同時(shí)將平板р單菌落的編號(hào) 式п份的竹簽挑取對(duì)應(yīng)編號(hào)的單菌落在斜面р進(jìn)行劃線,每個(gè)單菌,化完斜面后將其放置在 37℃培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng) 18~24h,每 支進(jìn)行 16s rDNA 擴(kuò)增測(cè)序,另外兩支放在 4℃冰箱保藏。 16s rDNA 鑒定實(shí)驗(yàn)流程增 16S rDNA:DNA 是 16S rRNA 序列的基因,長(zhǎng)約 1.5kb。將已分純的單菌直16S rDNA,部分通過(guò)菌液 PCR 較難擴(kuò)增的單菌經(jīng)擴(kuò)大培養(yǎng)后提擴(kuò)增所用引物序列如н: AGAGTTTGATCATGGCTCAG TAGGGTTACCTTGTTACGACTT的高保真 LA Taq 酶擴(kuò)增得到高質(zhì)量 PCR 產(chǎn)物。如圖 3:
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]空間生命科學(xué)研究與展望[J]. 郭英華,劉長(zhǎng)庭. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2011(04)
[2]模擬微重力對(duì)肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞窖蛋白-1和內(nèi)皮型一氧化氮合酶表達(dá)的影響[J]. 康春燕,袁明,鄒琳,章燁,李天志,王俊鋒,劉長(zhǎng)庭. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2010(11)
[3]模擬微重力對(duì)人肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡的影響[J]. 康春燕,劉長(zhǎng)庭,鄒琳,袁明,章燁,李天志,王洋,王德龍,劉巖. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2010(11)
本文編號(hào):2918041
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