發(fā)布時間：2020-10-16 14:31

【摘要】：【背景】隨著抗生素的廣泛使用甚至濫用,細菌耐藥性問題日益顯著,利用噬菌體治療耐藥致病菌的方法重新開始被人們關(guān)注�！灸康摹繉σ恢炅倚苑窝卓死撞删wvB_KpnP_IME279進行生物學(xué)特性研究及生物信息學(xué)分析�！痉椒ā恳砸恢甓嘀啬退幍姆窝卓死撞鸀樗拗骶�,從醫(yī)院污水中分離噬菌體,應(yīng)用雙層平板法檢測噬菌體效價、最佳感染復(fù)數(shù)(Optimal MOI)、一步生長曲線以及裂解譜,純化后通過透射電鏡觀察噬菌體形態(tài);應(yīng)用蛋白酶K/SDS法提取噬菌體全基因組,使用Illumina MiSeq測序平臺進行噬菌體全基因組測序,測序后對噬菌體全基因組序列進行組裝、注釋、進化和比較基因組學(xué)分析�！窘Y(jié)果】分離到一株新的肺炎克雷伯菌噬菌體,命名為vB_KpnP_IME279;其最佳感染復(fù)數(shù)為0.1,一步生長曲線顯示潛伏期為20 min,平均裂解量140 PFU/cell,電鏡觀察顯示該噬菌體屬于短尾噬菌體科(Podoviridae)�；蚪M測序表明,噬菌體基因組全長為42 518 bp,(G+C)mol%含量為59.3%。BLASTn比對結(jié)果表明,該噬菌體與目前已知噬菌體的相似性較低,基因組僅70%區(qū)域與已知噬菌體有同源性。構(gòu)建噬菌體主要衣殼蛋白的基因進化樹,分析了噬菌體IME279與其他短尾科噬菌體的進化關(guān)系,結(jié)果表明該噬菌體是短尾科噬菌體的一名新成員�！窘Y(jié)論】分離鑒定了一株新的肺炎克雷伯菌噬菌體,進行了生物學(xué)特性、全基因組測序和生物信息學(xué)分析,為研究肺炎克雷伯菌噬菌體與宿主之間的相互作用關(guān)系以及治療多重耐藥細菌感染奠定了基礎(chǔ)。
【圖文】：

結(jié)果如圖2所示，當(dāng)MOI為0.1時，噬菌體感染宿主后釋放的子代噬菌體的數(shù)量最多，即噬菌體vB＿KpnP＿IME279的最佳感染復(fù)數(shù)為0.1。圖2 最佳感染復(fù)數(shù)的測定結(jié)果

最佳感染復(fù)數(shù)的測定結(jié)果

通過對共計20株肺炎克雷伯菌的雙層板點板實驗表明，該噬菌體對其中10株有裂解能力，結(jié)果如表2所示。2.6 噬菌體vB＿KpnP＿IME279全基因組分析概述
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本文編號：2843382