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固有免疫信號(hào)分子hsa-miR-181a調(diào)節(jié)腦卒中作用的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-06 11:34

  本文選題:miRNAs + 固有免疫; 參考:《現(xiàn)代免疫學(xué)》2015年03期


【摘要】:對(duì)固有免疫信號(hào)分子hsa-miR-181a進(jìn)行生物信息學(xué)分析,以期探討其調(diào)節(jié)腦卒中的生物學(xué)途徑和信號(hào)通路,為hsamiR-181a的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證及功能研究提供理論指導(dǎo)。利用TargetScan 6.0、miRWalk、miRanda、PicTar、Genecards數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)所得的hsa-miR-181a與腦卒中所相關(guān)的靶基因,通過BINGO及DAVID對(duì)腦卒中相關(guān)靶基因集合進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)和信號(hào)通路分析。hsa-miR-181a可與固有免疫基因TLR4相互作用,并同時(shí)作用于與腦卒中相關(guān)的其它靶基因,通過調(diào)節(jié)細(xì)胞途徑,影響代謝過程等生物學(xué)途徑,神經(jīng)營養(yǎng)因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等KEGG信號(hào)通路發(fā)揮作用。固有免疫信號(hào)分子hsa-miR-181a可通過調(diào)節(jié)細(xì)胞途徑,影響代謝過程等生物學(xué)途徑,神經(jīng)營養(yǎng)因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等信號(hào)通路調(diào)節(jié)腦卒中,為進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)和功能驗(yàn)證提供生物信息學(xué)指導(dǎo)。
[Abstract]:The bioinformatics analysis of the inherent immune signaling molecule hsa-miR-181a was carried out in order to explore the biological and signal pathways regulating stroke and provide theoretical guidance for the experimental verification and functional study of hsamiR-181a. The target genes of hsa-miR-181a associated with stroke were predicted by using TargetScan 6.0 / miRWalkmmiRWalkmiRRR-Genecards database. Stroke related target genes were collected by BINGO and DAVID) and signal pathway analysis was used to analyze the interaction between hsa-miR-181a and the innate immune gene TLR4, and to analyze the interaction of hsa-miR-181a with the innate immune gene TLR4 by BINGO and DAVID. At the same time, it acts on other target genes related to stroke, through regulating cell pathway, affecting metabolism and other biological pathways, and KEGG signaling pathway such as neurotrophic factor signal transduction. The intrinsic immune signaling molecule hsa-miR-181a can regulate stroke by regulating cellular pathway, affecting metabolic process, neurotrophic factor signal transduction and other signaling pathways, which provides bioinformatics guidance for further experiments and functional verification.
【作者單位】: 南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院藥學(xué)部;南昌大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院心血管疾病研究中心;
【分類號(hào)】:R392

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1986379


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