發(fā)布時間：2020-03-21 17:14

【摘要】：研究目的作為兩種常見于高齡人群的神經(jīng)系統(tǒng)疾病,缺血性腦卒中和帕金森病在臨床表現(xiàn)上存在大量重疊,均造成患者日常自理能力下降,危害患者生存質(zhì)量,對全球衛(wèi)生工作形成巨大負擔。而其各自的發(fā)病機制十分復雜,同時兩種疾病在臨床表現(xiàn)和病理生理等方面又體現(xiàn)出種種聯(lián)系。本研究從遺傳學角度出發(fā),通過GWAS研究方法尋找增加二者患病風險的共有易感位點,從而探究二者的潛在聯(lián)系,作為參考以求理解兩種疾病的關(guān)聯(lián),進而加深對缺血性腦卒中和帕金森病發(fā)生和發(fā)展過程的理解,并有助于為未來兩種疾病的早期識別和預防尋求新的思路。研究方法1、本課題通過選取檢索詞于數(shù)據(jù)庫檢索,分別對缺血性腦卒中和帕金森病的GWAS研究文獻進行篩選,收集與缺血性腦卒中和帕金森病相關(guān)的易感性SNP數(shù)據(jù)集。2、將收集到的缺血性腦卒中相關(guān)SNP數(shù)據(jù)和帕金森病相關(guān)SNP數(shù)據(jù)通過PLINK軟件和VEGAS在線分析平臺分別進行基于基因水平的關(guān)聯(lián)研究,得到缺血性腦卒中相關(guān)的基因集和帕金森病相關(guān)的基因集,并進行比較篩選出兩種疾病共有的易感基因。3、利用Web Gestalt在線分析工具分別挖掘并分析缺血性腦卒中相關(guān)的基因集和帕金森病相關(guān)的基因集所富集的生物學通路,并通過meta分析整合出與兩種疾病共同相關(guān)的生物學過程。研究結(jié)果1、通過對各個獨立的GWAS研究所得的SNP數(shù)據(jù)進行質(zhì)量控制以及meta分析,我們最終選取了9541572個缺血性腦卒中相關(guān)SNP和2525704個帕金森病相關(guān)SNP數(shù)據(jù)信息進一步分析。2、通過PLINK軟件分析9541572個缺血性腦卒中相關(guān)SNP共錨定出578個缺血性腦卒中相關(guān)基因;2525704個帕金森病相關(guān)SNP共錨定出627個帕金森病相關(guān)基因。通過VEGAS2在線操作平臺9541572個缺血性腦卒中相關(guān)SNP共錨定出1286個缺血性腦卒中相關(guān)基因;2525704個帕金森病相關(guān)SNP共錨定出1023個帕金森病相關(guān)基因。共識別出68個兩種疾病共有相關(guān)基因。3、應用Web Gestalt在線分析工具共篩選出233個與缺血性腦卒中顯著相關(guān)的生物通路和37個與帕金森病顯著相關(guān)的生物通路。通過meta分析方法最終篩選出4條缺血性腦卒中和帕金森病共有的顯著性相關(guān)KEGG通路。研究結(jié)論缺血性腦卒中是一種急性缺血性腦血管疾病,腦卒中的危險因素包括年齡、性別、種族、遺傳因素、高血壓、糖尿病、血脂異常、吸煙等等。帕金森病是第二常見于中老年人群的神經(jīng)系統(tǒng)變性疾病,與環(huán)境因素、遺傳因素以及神經(jīng)系統(tǒng)老化等多種因素交互作用相關(guān)。缺血性腦卒中和帕金森病,在臨床上存在普遍的共患病情況,提示其二者間潛在的相同發(fā)病過程和病理機制。本研究采用生物信息學的方法,從遺傳易感性變異和功能富集分析的角度,對缺血性腦卒中和帕金森病各自數(shù)量龐大的SNP數(shù)據(jù)集進行全面而系統(tǒng)的分析。為了研究IS和PD可能的共同發(fā)生機制,我們對兩種疾病的基于基因水平的關(guān)聯(lián)研究以及生物學通路富集分析進行比較研究,并對分析所得共同易感性基因和生物通路進行深入探索。缺血腦卒中和帕金森病各自的分子致病機制非常復雜。本研究結(jié)果顯示,所識別出的缺血性腦卒中和帕金森病共同的生物學通路承擔著多能性干細胞信號調(diào)節(jié)、細胞緊密連接、白細胞跨血管內(nèi)皮遷移和TGF-β信號轉(zhuǎn)導等方面的生物學功能,提示細胞信息轉(zhuǎn)導、免疫等生物學過程參與到缺血性腦卒中和帕金森病的發(fā)病機制中并起到相應作用,且可能與兩者重疊的臨床表現(xiàn)相關(guān)。本文首次為缺血性腦卒中和帕金森病間的潛在聯(lián)系從分子水平提供了遺傳學證據(jù),并為后續(xù)科學研究提供有價值的參考。
【學位授予單位】：天津醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：R743.3;R742.5

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本文編號：2593662