目的:基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)miR-221調(diào)控前列腺癌差異基因進(jìn)行分析,以期找到miR-221調(diào)控前列腺癌的重要靶點(diǎn)基因。方法:在GEO數(shù)據(jù)庫(kù)里,獲得miR-221調(diào)控前列腺癌差異基因表達(dá)的芯片GSE45627,用在線分析工具GEO2R進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,按照P <0. 01和差異倍數(shù)≥2進(jìn)行篩選,將篩選得到的基因輸入DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行基因和通路的富集分析,然后進(jìn)行蛋白質(zhì)互做分析。結(jié)果:共鑒定108個(gè)DEG�；虮倔w富集結(jié)果表明,DEG編碼的功能分子主要位于細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核,分子功能主要涉及"雙鏈RNA結(jié)合""螺旋酶活性""雙鏈DNA結(jié)合""蛋白結(jié)合""單鏈RNA結(jié)合",與生物學(xué)過程有關(guān),包括"調(diào)節(jié)Ⅰ型干擾素信號(hào)通路""病毒的防御反應(yīng)""調(diào)控病毒遺傳物質(zhì)的復(fù)制""先天免疫反應(yīng)"。KEGG信號(hào)通路分析主要涉及甲型H1N1流感信號(hào)通路、麻疹信號(hào)通路、丙型肝炎信號(hào)通路、RIG-I樣受體信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路等。結(jié)論:生物信息分析的結(jié)果可以發(fā)現(xiàn)miR-221調(diào)控前列腺癌中有用的靶點(diǎn)和信號(hào)通路,但這些需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 基因芯片數(shù)據(jù)
    1.2 識(shí)別DEG
    1.3 差異基因功能和通路富集分析
    1.4 PPI網(wǎng)絡(luò)的建立和模塊的分析
2 結(jié)果
    2.1 篩選基因結(jié)果
    2.2基因功能富集分析
    2.3 KEGG信號(hào)通路分析
    2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)和模塊分析
3 討論



本文編號(hào)：4007620