人類精漿糖基化蛋白質(zhì)組學研究
【學位授予單位】:南京醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R698.2
【圖文】:
20圖 1:人類精漿 N 聯(lián)糖基化蛋白質(zhì)組學的特征,及與其他已知糖蛋白的對比。(A)五次生物學重復鑒定的 N 聯(lián)糖基化蛋白質(zhì)覆蓋率;(B)五次生物學重復鑒定的 N 聯(lián)糖基化位點覆蓋率;(C)用 MotifX. WebLogo 3 衍生的 N 聯(lián)糖基化相對頻率圖及共有序列;(D)精漿糖基化蛋白質(zhì)譜中蛋白質(zhì)上分布的 N 聯(lián)糖基化位點數(shù)目。Rolland 等總結(jié)了既往的蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫,總結(jié) 2545 種不同的人類精漿蛋白質(zhì)[40]。在這些蛋白質(zhì)中,我們的研究表明其中 263 個為糖基化蛋白質(zhì)(圖2A)。在我們的糖基化蛋白質(zhì)譜系,109 個糖基化蛋白質(zhì)是第一次被鑒定到,在以往的精漿蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)庫中沒有提及。糖基化位點的周圍序列(二端各6 個氨基酸)是糖基化修飾的調(diào)控序列,在 dbPTM 數(shù)據(jù)庫中,通常用這些調(diào)
我們的研究表明其中 263 個為糖基化蛋白質(zhì)(圖2A)。在我們的糖基化蛋白質(zhì)譜系,109 個糖基化蛋白質(zhì)是第一次被鑒定到,在以往的精漿蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)庫中沒有提及。糖基化位點的周圍序列(二端各6 個氨基酸)是糖基化修飾的調(diào)控序列,在 dbPTM 數(shù)據(jù)庫中,通常用這些調(diào)
釗湎嗷プ饔霉叵怠?6 個基因通過 147 個相互作用關聯(lián)(圖3A)。關聯(lián)最多的基因是 FN1(22 個相互關聯(lián)基因),其次是 TGFB1(19 個相互關聯(lián)基因),其他還有比如 CLU,SERPINA1,TIMP1 也都與其他糖基化蛋白質(zhì)有廣泛的相互作用關系。
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