2013年濟(jì)南市麻疹病毒的基因型及流行狀況分析
本文關(guān)鍵詞:2013年濟(jì)南市麻疹病毒的基因型及流行狀況分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:[研究背景] 麻疹是由麻疹病毒引起的一種以發(fā)熱、呼吸道卡他癥狀和全身斑丘疹為特征的急性呼吸道傳染病,病后有持久免疫力。是我國(guó)法定的丙類(lèi)傳染病。 60年代初我國(guó)麻疹減毒活疫苗問(wèn)世,隨著擴(kuò)大免疫規(guī)劃的開(kāi)展,麻疹流行基本上得到控制。但近些年來(lái),由于麻疹病毒的基因變異,又導(dǎo)致麻疹發(fā)病率的回升,并且年齡分布也有所改變。隨著改革開(kāi)放、經(jīng)濟(jì)發(fā)展加快,同時(shí)人口流動(dòng)增加,部分兒童麻疹疫苗漏種或免疫失敗,加上初免后隨著年齡增長(zhǎng)而免疫力逐漸降低等原因,致使麻疹小規(guī)模流行時(shí)有發(fā)生。 麻疹病毒是單股負(fù)鏈RNA病毒,目前發(fā)現(xiàn)8個(gè)基因組(A-H)23個(gè)基因型(A,B1-3,Cl-2, D1-10, E,F,Gl-3, H1-2),具有六個(gè)結(jié)構(gòu)基因編碼六個(gè)主要結(jié)構(gòu)蛋白。其中N基因C末端456bp序列為變異度最大的基因片段,是WHO規(guī)定鑒定基因性別所需的最少序列。 1993年~2012年我國(guó)共分的2756株麻疹病毒分離株,發(fā)現(xiàn)6個(gè)基因型,其中H1為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)流行株,即我國(guó)的本土株。徐文波等按2%基因變異劃分基因亞型,將中國(guó)的優(yōu)勢(shì)流行株H1基因型毒株劃分為3個(gè)亞型:H1a、H1b、H1c。其中Hla亞型病毒是中國(guó)流行的主要亞型病毒,H1b占第2位,Hlc亞型病毒的流行已由1993~1994年的強(qiáng)勢(shì)轉(zhuǎn)為1995~2012年的弱勢(shì)。 現(xiàn)階段,有關(guān)麻疹病毒的基因變異、現(xiàn)行疫苗的預(yù)防作用及成人麻疹等問(wèn)題成為國(guó)內(nèi)外研究的熱點(diǎn),WHO要求將消滅麻疹作為無(wú)脊髓灰質(zhì)炎地區(qū)的下一個(gè)目標(biāo),對(duì)麻疹病毒的監(jiān)測(cè)和研究變得更加緊迫。因此,濟(jì)南市麻疹病毒的監(jiān)測(cè)工作需要繼續(xù)加強(qiáng)開(kāi)展。2013年之前濟(jì)南市對(duì)麻疹病毒的研究局限于血清學(xué)監(jiān)測(cè)和免疫水平監(jiān)測(cè)方面,對(duì)麻疹本土流行株的基因分型以及對(duì)抗原漂移的闡述工作開(kāi)展較少,現(xiàn)有必要從分子流行病學(xué)方面深入研究其對(duì)麻疹病毒的傳播和流行的影響,闡明我市麻疹野毒株的抗原變異特點(diǎn)。本篇論文從基因變異、病毒流行、抗體水平這三點(diǎn)著手研究,為加速我國(guó)麻疹防控提供強(qiáng)有力的科學(xué)依據(jù)。 [研究目的] 1.了解2013年濟(jì)南市麻疹病毒野毒株的基因型及基因變異特點(diǎn)。 2.描述2013年濟(jì)南市麻疹病毒的“三間分布”特征,分析麻疹病毒的流行趨勢(shì)。 3.了解麻疹病毒在健康人群中的抗體水平,為麻疹的防控提供科學(xué)依據(jù)。 [研究方法] 一.麻疹野毒株基因變異特征研究方法 1.采集2013年濟(jì)南市疑似麻疹患者的咽拭子和尿液標(biāo)本,用熒光PCR方法進(jìn)行鑒定,對(duì)麻疹病毒陽(yáng)性的樣本使用Vero-Slam細(xì)胞分離病毒。 2.提取病毒培養(yǎng)液中的RNA,用一步RT-PCR方法擴(kuò)增麻疹病毒編碼核蛋白(nucleoprotein)的N基因C末端456bp核苷酸片段,擴(kuò)增產(chǎn)物直接測(cè)序后使用DNAstar軟件將測(cè)序結(jié)果與國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株比對(duì)并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。 3.使用MEGA軟件將測(cè)序結(jié)果與同時(shí)期國(guó)內(nèi)、國(guó)外的野毒株序列結(jié)果構(gòu)建麻疹野毒株的遺傳進(jìn)化樹(shù),分析親緣關(guān)系。 二.麻疹病毒流行趨勢(shì)的研究方法 1.依照《全國(guó)麻疹監(jiān)測(cè)方案》2009年版的指示,及時(shí)對(duì)麻疹病例的信息上報(bào)中國(guó)疾病預(yù)防控制中心疾病監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)并進(jìn)行結(jié)果錄入。 2.將來(lái)自于中國(guó)疾病預(yù)防控制中心疾病監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)的傳染病報(bào)告信息管理系統(tǒng)的麻疹病例的信息進(jìn)行歸納整理。 3.使用Excel對(duì)疫情資料進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,使用Epi-Info軟件繪制病例的地理分布,使用SPSS軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。了解濟(jì)南市2013年麻疹病例在時(shí)間、地區(qū)、人群的“三間分布”,掌握麻疹病毒在濟(jì)南市的疫情流行情況及變化趨勢(shì)。 4.對(duì)麻疹病例的免疫史進(jìn)行總結(jié)分析。 5.對(duì)麻疹病例的臨床癥狀數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。 三.麻疹病毒在健康人群中抗體水平的分析方法 1.使用酶聯(lián)免疫方法對(duì)健康人群血清中的麻疹抗體(IgG)水平進(jìn)行檢測(cè),探討不同地區(qū)、不同人群的麻疹減毒活疫苗對(duì)流行病毒株的保護(hù)效果。 2.使用酶聯(lián)免疫方法對(duì)適齡兒童免疫前后血清中的麻疹抗體(IgG)水平進(jìn)行檢測(cè),分析免疫成功率。 3.使用SPSS軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。 [研究結(jié)果] 一.麻疹野毒株基因變異特征研究結(jié)果 1.采集2013年濟(jì)南地區(qū)的麻疹疑似病例標(biāo)本,共151份,其中咽拭子91份,尿標(biāo)本60份,經(jīng)熒光PCR檢測(cè)得到陽(yáng)性咽拭子樣本30份,陽(yáng)性率為33.33%,陽(yáng)性尿標(biāo)本4份,陽(yáng)性率為6.67%。30份麻疹病毒陽(yáng)性咽拭子中分離到19株麻疹病毒,4份尿標(biāo)本中分離到2株麻疹病毒。21份陽(yáng)性毒株中咽拭子標(biāo)本和尿標(biāo)本均來(lái)自不同病例,無(wú)重合。 2.21株麻疹野毒株經(jīng)對(duì)N基因C末端456bp的RT-PCR進(jìn)行同源性分析證實(shí)均為H1a基因型,其中未發(fā)現(xiàn)疫苗相關(guān)株(A基因型),表明H1a亞型為2013年濟(jì)南市優(yōu)勢(shì)流行株。以麻疹病毒H1a標(biāo)準(zhǔn)株(china93-2)的相應(yīng)核苷酸以及核苷酸序列推導(dǎo)的氨基酸序列為標(biāo)準(zhǔn),21個(gè)標(biāo)本的456個(gè)核苷酸中有9處基因突變屬于同義突變。遺傳距離為0-0.017。 3.從遺傳進(jìn)化樹(shù)可得21株麻疹病毒基因和國(guó)內(nèi)、國(guó)外分離得到的H1a毒株在同一分支中,說(shuō)明全球流行情況保持一致,其中存在兩個(gè)小的分支提示可能存在兩個(gè)不同的小基因變異鏈同時(shí)流行。 二.麻疹病毒流行狀況的研究結(jié)果 1.2013年濟(jì)南市發(fā)病率為4.46/10萬(wàn)(299/6704036),呈現(xiàn)明顯的春季流行,槐蔭區(qū)、天橋區(qū)、歷城區(qū)為前三位的發(fā)病地區(qū)。 2.麻疹病毒主要侵犯1歲以下的兒童,其中,0~7月齡占64%(105/164)。其次為20歲以上的成人。不同年齡組間的男女性別差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 3.發(fā)病病例中有免疫接種記錄的人群為10例,占總發(fā)病數(shù)的3.3%,其他均為不詳。其中0~1歲的為6例,1~5歲的為3例,20歲以上的1例。 4.臨床癥狀分布除發(fā)熱、出疹之外前四位為咳嗽、卡它癥狀、結(jié)膜炎和柯氏斑,可供臨床參考。 三.麻疹病毒在健康人群中抗體水平的研究結(jié)果 1.采集的295份健康人群血清中,IgG陽(yáng)性率為90.51%(267/295),GMC為1901.25(IU/ml)。陽(yáng)性率和GMC水平與國(guó)內(nèi)其他地區(qū)一些報(bào)告基本一致。三個(gè)地區(qū)中,不同地區(qū)的抗體陽(yáng)性率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,商河縣的陽(yáng)性率和GMC最高。不同性別間麻疹抗體陽(yáng)性率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。各年齡組中麻疹抗體陽(yáng)性率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,2歲~4歲組陽(yáng)性率和GMC最高,GMC水平隨著年齡的增長(zhǎng)大致呈下降的趨勢(shì)。 2.對(duì)45例8月齡以下嬰兒麻疹免疫前后的抗體水平進(jìn)行監(jiān)測(cè),顯示免疫前抗體陽(yáng)性率33.33%,免疫后IgG抗體陽(yáng)性率為100%,GMC水平也從801.15IU/ml提高到2862.32IU/ml。 [結(jié)論] 1.21株麻疹野毒株為H1a基因型。 2.對(duì)比Hla參考株,21株麻疹野毒株456bp核苷酸片段中,有義突變7處,遺傳距離為1-0.017,提示有遺傳變異正在發(fā)生。 3.遺傳進(jìn)化樹(shù)中,H1a分支中提示有兩個(gè)小分支正在流行,需引起重視。 4.應(yīng)考慮對(duì)重點(diǎn)區(qū)(縣)加大麻疹的防控、監(jiān)督力度。 5.應(yīng)考慮對(duì)20歲以上的大年齡組人群補(bǔ)種麻疹疫苗,其中育齡婦女人群是重點(diǎn)補(bǔ)種對(duì)象。 6.及時(shí)對(duì)適齡兒童進(jìn)行免疫接種對(duì)阻斷麻疹的傳播有非常顯著的效果。
【關(guān)鍵詞】:麻疹病毒 基因型 流行病學(xué) 抗體水平監(jiān)測(cè)
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類(lèi)號(hào)】:R373;R181.3
【目錄】:
- 中文摘要6-10
- ABSTRACT10-16
- 符號(hào)說(shuō)明16-17
- 前言17-21
- 第一部分 2013年濟(jì)南市麻疹病毒的基因型分析21-39
- 研究目的21
- 材料與方法21-25
- 結(jié)果25-37
- 討論37-38
- 結(jié)論38-39
- 第二部分 2013年濟(jì)南市麻疹病毒的監(jiān)測(cè)資料分析39-49
- 研究目的39
- 材料與方法39-42
- 結(jié)果42-47
- 討論47-48
- 結(jié)論48-49
- 第三部分 2013年健康人群中麻疹抗體水平的監(jiān)測(cè)49-55
- 研究目的49
- 材料與方法49-51
- 結(jié)果51-53
- 討論53-54
- 結(jié)論54-55
- 參考文獻(xiàn)55-60
- 致謝60-61
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄61-62
- 學(xué)位論文評(píng)閱及答辯情況表62
【參考文獻(xiàn)】
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本文關(guān)鍵詞:2013年濟(jì)南市麻疹病毒的基因型及流行狀況分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號(hào):370124
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