本文選題：百日咳 + 抗原漂移��； 參考：《河北醫(yī)科大學(xué)》2009年碩士論文

【摘要】： 目的:百日咳是由百日咳鮑特菌感染所引起的一種急性呼吸道傳染病,人群普遍易感,尤其以嬰幼兒多見。我國全細(xì)胞百日咳疫苗(whole-cell pertussis vaccine,WPV )的使用有近50年的歷史,而相關(guān)百日咳鮑特菌分子流行病學(xué)的研究資料較少,本實驗對近50年我國收集的百日咳鮑特菌進(jìn)行了分子水平研究,探討我國分離百日咳鮑特菌的分子流行病學(xué)特點,以便更好的監(jiān)控和預(yù)防百日咳。 方法:對我國1953-2005年間分離的96株百日咳鮑特菌,進(jìn)行了百日咳鮑特菌的血清型和脈沖場凝膠電泳(PFGE)分析以及其主要毒力因子的基因序列測序,包括百日咳毒素S1亞基(ptxS1)、百日咳粘附素(prn)、氣管定居因子(tcfA)、凝集素2(fim2)和凝集素3(fim3);同時與我國的疫苗生產(chǎn)菌株(CS,P3S10和18530)和世界衛(wèi)生組織(WHO)參考菌株18323株進(jìn)行比較。 結(jié)合菌株分離時間,分析不同年代流行菌株的基因是否存在抗原漂移現(xiàn)象,血清型分布特點和PFGE型別與基因型的關(guān)聯(lián)。分析百日咳疫苗使用前后流行菌株的基因型和血清型的差異。 結(jié)果:血清型分析顯示96株臨床菌株中共有fim2,fim3,fim23三個血清型,fim2和fim23血清型菌株主要分布在90年代以前,在90年代后出現(xiàn)了fim3型。 基因序列分析結(jié)果顯示五個抗原基因均存在多態(tài)性現(xiàn)象,prn基因包括6個基因型(prn1, prn2, prn3, prn7, prn10和prn11),ptxS1基因包括4個基因型(ptxS1A, ptxS1B, ptxS1D和ptxS1E),tcfA基因包括4個基因型(tcfA1, tcfA2, tcfA5和tcfA9),fim2基因包括2個基因型(fim2-1和fim2-2)和fim3基因包括3個基因型(fim3A, fim3B和fim3A*)。 臨床菌株中的prn基因型中prn1基因型最為常見,占81.3%,含prn2和prn3基因型菌株最初分別在2000和2003年分離獲得。含ptxS1A基因型的菌株最初在1963年被分離,并且以后逐漸取代了在50年代的流行ptxS1B和ptxS1D基因型的菌株,到90年代以后所占比例已達(dá)到100%。 研究結(jié)果顯示5個基因組合(prn/pxS1/tcfA/fim2/fim3),即1/A/2/1/A, 1/B/2/1/A, 7/D/2/2/A, 2/A/2/1/B和3/A/2/1/A占所有基因組合的93.5%,這五個基因組合的菌株分別所占比例為60.4%、18.8%、8.3%、3.1%和2.1%。其中被稱為舊型的基因組合1/B/2/1/A和7/D/2/2/A的菌株是50年代最流行的基因組合形式,與疫苗生產(chǎn)菌株基因組合一樣。到了60年代以后,1/A/2/1/A基因組合的菌株數(shù)量增多,含有這種基因組合的細(xì)菌逐漸成為主要的流行菌株,2000年后出現(xiàn)了和3/A/2/1/A基因型的菌株和2/A/2/1/B基因型的菌株,后者是目前國外研究中比較流行百日咳菌株的基因組合形式。 通過PFGE分析顯示26個PFGE譜型被鑒定,不同的年代流行著不同PFGE譜型的菌株,BPCH2和BPCH3譜型是50年代比較流行菌株主要的譜型所占比例為52%,我國的疫苗生產(chǎn)菌株(CS和P3S10)為BPCH2譜型,疫苗生產(chǎn)菌株18530為BPCH25譜型,在1963-2003年收集的菌株中有49株為BPCH1譜型,占所有研究菌株數(shù)量的51%,而此譜型的菌株主要都是prn1/pxS1A基因型的菌株,BPCH6譜型(擁有和BPCH1譜型相同的基因組合形式)的菌株分離于1999年,并且在1999-2003年間所收集的菌株中所占比例達(dá)30.8%,聚類分析顯示PFGE譜型中ptxS1基因型從ptxA1B向ptxS1A基因型的過渡表現(xiàn)在聚類圖中。 PFGE譜型與抗原基因組合prn/pxS1/tcfA/fim2/fim3相關(guān)聯(lián),6個最常見的PFGE譜型中,除了BPCH1譜型中93.9%的菌株為基因組合形式1/A/2/1/A,其它的譜型100%對應(yīng)各自不同的基因組合。 在1953-1979年間和1980-2005年間,血清型有變化(P=0.0001);菌株ptxS1基因型也有變遷(P=0.001)。結(jié)論:我國百日咳鮑特菌處于不斷的進(jìn)化中,血清型和主要抗原基因(ptxS1)發(fā)生了漂移,在不同的時期流行著以不同的抗原基因型和PFGE譜型為主的菌株;目前流行百日咳菌株與疫苗生產(chǎn)菌株(CS、18530和P3S10)存在基因水平的差異。
[Abstract]:Objective: pertussis is an acute respiratory infection caused by the infection of Bordetella pertussis. The population is generally susceptible, especially in infants. The use of whole-cell pertussis vaccine (WPV) in our country has a history of nearly 50 years, and the molecular epidemiology of pertussis bauter is less. The molecular level of bautusis pertussis collected in China in the last 50 years was studied. The molecular epidemiological characteristics of isolated Bordetella pertussis in China were discussed in order to better monitor and prevent pertussis.
Methods: 96 strains of Bordetella pertussis isolated in China in the past 1953-2005 years were analyzed by serotype and pulsed field gel electrophoresis (PFGE) and the sequence of its main virulence factors, including pertussis toxin S1 subunit (ptxS1), pertussis adhesion (PRN), trachea settlement factor (tcfA), agglutinin 2 (fim2) and agglutination. Element 3 (fim3) was compared with 18323 strains of vaccine strains (CS, P3S10 and 18530) and WHO (WHO) in China.
According to the isolation time of the strains, it was analyzed whether the genes of the epidemic strains in different ages had the phenomenon of antigen drift, the characteristics of serotype distribution and the association between the PFGE type and genotype. The difference of genotypes and serotypes of the epidemic strains before and after the use of pertussis vaccine was analyzed.
Results: the serotype analysis showed that 96 clinical strains were fim2, fim3, fim23 three serotypes, fim2 and fim23 serotype strains were mainly distributed before 90s, and fim3 type appeared after 90s.
The gene sequence analysis showed that the five antigen genes were polymorphic, and the PRN gene consisted of 6 genotypes (prn1, prn2, prn3, prn7, prn10 and prn11). The ptxS1 gene included 4 genotypes (ptxS1A, ptxS1B, ptxS1D and ptxS1E), and 4 genes including 2 genotypes. 1 and fim2-2) and fim3 genes include 3 genotypes (fim3A, fim3B and fim3A*).
In the PRN genotypes of clinical strains, the prn1 genotype is the most common, accounting for 81.3%. The strains containing prn2 and prn3 genotype were first isolated in 2000 and 2003 respectively. The strains containing the ptxS1A genotype were first isolated in 1963, and then gradually replaced the strains of the prevalent ptxS1B and ptxS1D genotypes in 50s. The example has reached 100%.
The results showed that 5 gene combinations (prn/pxS1/tcfA/fim2/fim3), that is, 1/A/2/1/A, 1/B/2/1/A, 7/D/2/2/A, 2/A/2/1/B and 3/A/2/1/A accounted for 93.5% of all gene combinations, and the proportion of the five gene combinations was 60.4%, 18.8%, 8.3%, 3.1% and 2.1%., which was called the old type of 1/B/2/1/A and 7/D/2/2/A was 50. The most popular form of gene combination in the years was the same as the gene combination of vaccine producing strains. After 60s, the number of 1/A/2/1/A gene combinations increased. Bacteria containing this combination became the main epidemic strains. After 2000, the strains and the 3/A/2/1/A genotypes and 2/A/2/1/B genotypes appeared. The latter was the latter. At present, the genetic composition of pertussis strains is relatively popular in overseas studies.
PFGE analysis showed that 26 PFGE spectrum types were identified, and different PFGE strains were prevalent in different ages. BPCH2 and BPCH3 were the most popular strains in 50s, the proportion of the major strains was 52%. The vaccine producing strains (CS and P3S10) in our country were BPCH2 spectrum, vaccine producing strain 18530 was BPCH25 spectrum, and the bacteria collected in 1963-2003 years were collected. 49 of the strains were BPCH1, accounting for 51% of all the research strains, and the strains were mainly prn1/pxS1A genotypes. The strains of BPCH6 spectrum (with the same genetic combination of BPCH1) were isolated in 1999, and the proportion of the strains collected in 1999-2003 years was 30.8%. Cluster analysis showed that PFGE The transition of ptxS1 genotype from ptxA1B to ptxS1A genotype is shown in the cluster map.
The PFGE spectrum is associated with the antigen gene combination of prn/pxS1/tcfA/fim2/fim3. Among the 6 most common PFGE profiles, 93.9% of the strains in the BPCH1 spectrum are 1/A/2/1/A in the form of gene combination, and the other spectral types 100% correspond to their respective gene combinations.
In 1953-1979 and 1980-2005 years, the serotypes were changed (P=0.0001) and the strain ptxS1 genotypes were also changed (P=0.001). Conclusion: in our country, bauter pertussis is in continuous evolution, the serotype and the main antigen gene (ptxS1) are drifting, and the strains with different antigen genotypes and PFGE profiles are prevalent in different time periods. The prevalence of pertussis strains is different from that of vaccine producing strains (CS, 18530 and P3S10).
【學(xué)位授予單位】：河北醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2009
【分類號】：R181.3

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本文編號：1921952