生物標記物與種植體周圍炎的相關(guān)性研究
發(fā)布時間:2021-01-02 04:36
種植體周圍炎(peri-implantitis)是導(dǎo)致種植體失敗的重要原因之一,以往簡單的種植體周圍袋深度(PPD)、牙齦出血指數(shù)(GBI)、X線等臨床檢查只能夠診斷疾病發(fā)生后的嚴重程度,卻無法對疾病的整個活動過程進行預(yù)測和判斷。學(xué)者們認為罹患種植體周圍炎的患者體內(nèi)一些生物標記物(Biomarker)及其含量變化與該病的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),通過對這些生物標記物的監(jiān)控和檢測可以正確判斷并預(yù)測種植體周圍炎的活動性。目前單一種類的生物標記物指標對疾病的評估結(jié)果是片面的,結(jié)合多種類指標進行聯(lián)合檢測的標記物聯(lián)合檢測(marker packages)可以對疾病的發(fā)生發(fā)展給予正確而全面的預(yù)測、診斷和評估,所得到的結(jié)果準確率較高。本研究基于以上理念進行設(shè)計:將種植體齦溝液作為樣本,按marker packages選取與種植體周圍炎相關(guān)的四大類生物標記物:蛋白質(zhì)組學(xué)生物標記物(Proteomic biomarkers)、基因生物標記物(Genetic biomarkers)、微生物生物標記物(Microbial biomarkers)、其他生物標記物(Other biomarkers)中具有一定敏感度和...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
-control組和W-control組齦溝液樣本中菌屬之間的相對豐度圖
屬(2.100%),嗜血桿菌屬(1.841%)。由結(jié)果可以看出:齦下菌屬分布在漢族種植體周圍炎組和維吾爾族種植體周圍炎組存在差異,其中在兩組齦下所檢出的菌屬中,羅氏菌屬、纖毛菌屬、彎曲桿菌屬、不動桿菌屬、微球菌屬、莫拉氏菌屬在兩組優(yōu)勢菌群中的分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(見圖 2)。
3.2 結(jié)果3.2.1 OTU 分類從優(yōu)質(zhì)序列中得到兩組豐度最大的 OTU:用 Usearch 檢測并去除 clean tags中的嵌合體序列,最終得到較優(yōu)質(zhì)的序列(valid tags)733759 條(Control 343675條,Case 390084 條),然后應(yīng)用 Uparse 軟件以 97 %相似度對所有的優(yōu)質(zhì)序列使用進行 OTU 劃分,即 OTU 分類(Operational Taxonomic Unit),從各 OTU 中挑選豐度最大的序列作為代表序列,與 Silva-16S 數(shù)據(jù)庫進行比對,得到最終結(jié)果:共獲得 263 個 OTU,其中 Control 135 個,Case 128 個(見圖 1)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]種植體周圍齦溝液中C反應(yīng)蛋白濃度與種植體周圍炎的關(guān)系[J]. 謝謙,劉中華,賀凌飛,吳妹娟,潘宣. 廣東醫(yī)學(xué). 2015(14)
[2]高通量測序研究種植體周圍炎齦下微生物多樣性[J]. 李志杰,王少果,李躍烘,涂東祥,劉世云,聶紅兵,李志強,張菊梅. 四川大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2015(04)
[3]種植體周齦溝液中MMP-2和MMP-9檢測意義的探討[J]. 韋明霞,于娜. 中國冶金工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志. 2015(03)
[4]維生素D受體ApaI和FokI位點基因多態(tài)性和種植體周圍炎的相關(guān)性研究[J]. 劉瓊,黃建生,卿玲,謝宇,張宇婕. 現(xiàn)代口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2015(03)
[5]種植體周圍炎患者齦溝液中IL-18和MMP-13表達研究[J]. 李德超,周彥鵬,王澤. 中國實用口腔科雜志. 2014(04)
[6]種植體周圍齦溝液中硫離子含量的測定及其臨床意義[J]. 李明,逄愛慧,楊焰,吳麗娟,馬凈植. 華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2013(03)
[7]微球菌分類新進展[J]. 李金鐘. 國外醫(yī)學(xué).臨床生物化學(xué)與檢驗學(xué)分冊. 2004(01)
[8]中國十七個民族間的遺傳距離的初步研究[J]. 袁義達,杜若甫. 遺傳學(xué)報. 1983(05)
本文編號:2952664
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
-control組和W-control組齦溝液樣本中菌屬之間的相對豐度圖
屬(2.100%),嗜血桿菌屬(1.841%)。由結(jié)果可以看出:齦下菌屬分布在漢族種植體周圍炎組和維吾爾族種植體周圍炎組存在差異,其中在兩組齦下所檢出的菌屬中,羅氏菌屬、纖毛菌屬、彎曲桿菌屬、不動桿菌屬、微球菌屬、莫拉氏菌屬在兩組優(yōu)勢菌群中的分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(見圖 2)。
3.2 結(jié)果3.2.1 OTU 分類從優(yōu)質(zhì)序列中得到兩組豐度最大的 OTU:用 Usearch 檢測并去除 clean tags中的嵌合體序列,最終得到較優(yōu)質(zhì)的序列(valid tags)733759 條(Control 343675條,Case 390084 條),然后應(yīng)用 Uparse 軟件以 97 %相似度對所有的優(yōu)質(zhì)序列使用進行 OTU 劃分,即 OTU 分類(Operational Taxonomic Unit),從各 OTU 中挑選豐度最大的序列作為代表序列,與 Silva-16S 數(shù)據(jù)庫進行比對,得到最終結(jié)果:共獲得 263 個 OTU,其中 Control 135 個,Case 128 個(見圖 1)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]種植體周圍齦溝液中C反應(yīng)蛋白濃度與種植體周圍炎的關(guān)系[J]. 謝謙,劉中華,賀凌飛,吳妹娟,潘宣. 廣東醫(yī)學(xué). 2015(14)
[2]高通量測序研究種植體周圍炎齦下微生物多樣性[J]. 李志杰,王少果,李躍烘,涂東祥,劉世云,聶紅兵,李志強,張菊梅. 四川大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2015(04)
[3]種植體周齦溝液中MMP-2和MMP-9檢測意義的探討[J]. 韋明霞,于娜. 中國冶金工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志. 2015(03)
[4]維生素D受體ApaI和FokI位點基因多態(tài)性和種植體周圍炎的相關(guān)性研究[J]. 劉瓊,黃建生,卿玲,謝宇,張宇婕. 現(xiàn)代口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2015(03)
[5]種植體周圍炎患者齦溝液中IL-18和MMP-13表達研究[J]. 李德超,周彥鵬,王澤. 中國實用口腔科雜志. 2014(04)
[6]種植體周圍齦溝液中硫離子含量的測定及其臨床意義[J]. 李明,逄愛慧,楊焰,吳麗娟,馬凈植. 華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2013(03)
[7]微球菌分類新進展[J]. 李金鐘. 國外醫(yī)學(xué).臨床生物化學(xué)與檢驗學(xué)分冊. 2004(01)
[8]中國十七個民族間的遺傳距離的初步研究[J]. 袁義達,杜若甫. 遺傳學(xué)報. 1983(05)
本文編號:2952664
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