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3株人鼻病毒地方株的分離鑒定與VP4基因序列分析

發(fā)布時間:2024-03-09 00:19
  人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是小兒呼吸道感染的重要病原體,具有多種基因型,定期對HRV進行病毒分離與基因序列分型,對了解病毒的變異情況具有重要價值。為了探討HRV在安徽省蚌埠市上呼吸道感染患者咽拭子樣本中的分離情況,并進行分離株HRV的衣殼蛋白(VP)4基因序列分析,本研究選擇安徽省蚌埠醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院診斷為上呼吸道感染患者的64例咽拭子標本,采用定量聚合酶鏈式反應(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)檢測HRV感染情況。將檢測陽性標本感染H1-HeLa細胞進行病毒分離,對成功分離的HRV地方株進行HRV VP4基因的逆轉錄-聚合酶鏈反應(Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)擴增,并采用MEGA軟件進行序列分析。結果顯示:qPCR檢出HRV陽性6例,從中分離到3株HRV地方株;蛐蛄蟹治鲲@示3株HRV地方株分別為HRV A型、HRV B型、HRV C型病毒株(NCBI識別序列號分別為MK820682、MK848595、MN146019...

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

圖1人鼻病毒(HRV)的細胞病變效應情況

圖1人鼻病毒(HRV)的細胞病變效應情況

當前人鼻病毒(Humanrhinovirus,HRV)已鑒定發(fā)現(xiàn)200多個血清型,是感染人類的病毒中血清型最多的病毒之一[9]。HRV最初是從原代猴腎細胞中分離出來的,傳統(tǒng)上主要是通過人胚腎細胞系與部分HeLa細胞分離培養(yǎng)HRV。H1-HeLa細胞為HRV敏感型細胞,可用于HR....


圖2人鼻病毒(HRV)地方株的VP4基因擴增

圖2人鼻病毒(HRV)地方株的VP4基因擴增

圖1人鼻病毒(HRV)的細胞病變效應情況HRV基因可編碼11個蛋白,其中4種結構蛋白VPl、VP2、VP3、VP4構成殼粒,形成殼體包裹RNA。VP4不暴露在殼粒表面,VPl、VP2、VP3的部分序列展示在殼粒表面[15,16]。VP4是HRV比較保守的區(qū)域,VP4幾個關鍵位點....


圖3人鼻病毒(HRV)A型MK820682病毒株的進化樹

圖3人鼻病毒(HRV)A型MK820682病毒株的進化樹

HRV基因可編碼11個蛋白,其中4種結構蛋白VPl、VP2、VP3、VP4構成殼粒,形成殼體包裹RNA。VP4不暴露在殼粒表面,VPl、VP2、VP3的部分序列展示在殼粒表面[15,16]。VP4是HRV比較保守的區(qū)域,VP4幾個關鍵位點堿基、氨基酸的變化則會影響病毒的生物學特征....


圖4人鼻病毒(HRV)B型MK848595病毒株的進化樹

圖4人鼻病毒(HRV)B型MK848595病毒株的進化樹

圖3人鼻病毒(HRV)A型MK820682病毒株的進化樹圖5人鼻病毒(HRV)C型MN146019病毒株的進化樹



本文編號:3922614

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