兩株粘質沙雷菌噬菌體生物學特性和基因組分析
發(fā)布時間:2022-07-29 12:13
粘質沙雷菌(Serratia marcescens)是一種桿狀的革蘭氏陰性細菌,是條件致病菌的一種,主要引起醫(yī)源性感染。當機體免疫功能下降時,能引起多種感染性疾病,如肺炎、腦膜炎和敗血癥等。近年來,由于抗生素的大量使用,耐藥性粘質沙雷菌的分離率越來越高,耐藥菌株引起的爆發(fā)流行的案例報道也越來越多,導致了臨床治療粘質沙雷菌感染的難度越來越大。因此,許多學者開始尋找能夠替代抗生素的殺菌物質。噬菌體作為專門裂解細菌的病毒,具有嚴格的宿主特異性,在殺死宿主菌的同時,不會殺死其它正常菌群,是良好的抗生素替代品之一。本研究以多重耐藥的粘質沙雷菌為宿主菌,從廢水樣品中分離出了兩株烈性噬菌體,分別命名為vBSmaA2050H1和vBSmaM2050HW,分析和研究了它們的形態(tài)學、生物學、分子遺傳學和基因組學特征,為多重耐藥粘質沙雷菌的防治提供了新的思路。通過雙層平板的噬菌斑顯示,噬菌體vBSmaA2050H1的噬菌斑小而透明,直徑為1.23±0.29 mm;噬菌體vB
【文章頁數】:93 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
1 粘質沙雷菌概述
2 噬菌體概述
3 粘質沙雷菌噬菌體的研究現狀和進展
4 本研究的內容和意義
第一章 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體的分離
1.1 實驗材料
1.1.1 菌種及樣品
1.1.2 主要試劑與溶液配制
1.1.3 主要儀器
1.2 實驗方法
1.2.1 臨床粘質沙雷菌的分離和耐藥性分析
1.2.2 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體的分離
1.2.3 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體原種的制備
1.2.4 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體的效價測定
1.3 實驗結果
1.3.1 粘質沙雷菌噬菌體宿主的確定
1.3.2 粘質沙雷菌噬菌體的分離
1.3.3 粘質沙雷菌噬菌體原種的制備
1.3.4 粘質沙雷菌噬菌體的噬菌斑特性和效價測定
1.4 討論與分析
第二章 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體的生物學特性
2.1 實驗材料與儀器
2.1.1 菌種與噬菌體
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器
2.2 實驗方法
2.2.1 噬菌體顆粒的提取和純化
2.2.2 透射電鏡下觀察兩株噬菌體的形態(tài)
2.2.3 噬菌體一步生長曲線的測量和爆發(fā)量的估算
2.2.4 粘質沙雷菌噬菌體宿主譜的研究
2.3 實驗結果
2.3.1 粘質沙雷菌噬菌體的顯微形態(tài)特征
2.3.2 粘質沙雷菌噬菌體的一步生長曲線
2.3.3 粘質沙雷菌噬菌體宿主譜測定結果
2.4 討論與分析
第三章 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體受體的探究
3.1 實驗材料
3.1.1 試驗材料
3.1.2 主要儀器
3.2 實驗方法
3.2.1 細菌膜蛋白受體驗證實驗
3.2.2 細菌胞外多糖受體驗證實驗
3.2.3 熱酚水法提取粘質沙雷菌wk2050 的細菌胞外多糖
3.2.4 細菌胞外多糖在體外抑制噬菌體吸附實驗
3.3 實驗結果
3.3.1 細菌膜蛋白受體驗證實驗結果
3.3.2 胞外多糖受體驗證實驗結果
3.3.3 胞外多糖在體外抑制噬菌體吸附的量化實驗結果
3.4 討論與分析
第四章 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體基因組分析
4.1 實驗材料
4.1.1 主要試劑
4.1.2 主要儀器
4.2 實驗方法
4.2.1 苯酚-氯仿法提取和純化噬菌體全基因組
4.2.2 噬菌體全基因組測序
4.2.3 噬菌體基因組預測編碼ORFs的功能注釋
4.2.4 比較基因組學
4.3 實驗結果
4.3.1 噬菌體全基因組的提取和純化
4.3.2 噬菌體全基因組測序
4.3.3 噬菌體基因組預測編碼ORFs的功能注釋和分析
4.3.4 比較基因組學
4.4 討論與分析
第五章 結論和展望
5.1 結論
5.1.1 噬菌體的分離
5.1.2 噬菌體生物學性狀
5.1.3 噬菌體受體初步探究
5.1.4 噬菌體全基因組分析
5.2 展望
參考文獻
附錄A 附表
作者在學期間取得的學術成果
附件
主要簡歷
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]噬菌體治療泛耐藥鮑氏不動桿菌重癥感染小鼠的研究[J]. 閆李俠,黃至澄,任應鵬,李恪梅,陳保文,王國治. 中國人獸共患病學報. 2017(10)
[2]沙雷菌裂解性噬菌體PS2生物學特性及其全基因組測序[J]. 張改,李振江,靳靜,王書偉,陳松建,李亞輝,黃德海,王小亭,王山梅,王中全. 中國人獸共患病學報. 2017(09)
[3]食源性金黃色葡萄球菌粘附素基因的檢測及蛋白酶K和DNase Ⅰ對菌株被膜形成的影響[J]. 馬伊薩蘭,余博旸,陳娟,劉驥,唐俊妮. 食品工業(yè)科技. 2016(17)
[4]銅綠假單胞菌噬菌體D204的生物學特性和基因組學研究[J]. 徐彬,高晶,郭曉奎,秦金紅. 上海交通大學學報(醫(yī)學版). 2016(01)
[5]糞腸球菌裂解性噬菌體φEn-ZZ8生物學特性的初步分析[J]. 張哲,李菁華,逯茵茵,韓放,李詩恒,孫延波. 微生物與感染. 2015(04)
[6]粘質沙雷菌毒性噬菌體PS4的生物學特性及其在小鼠血清中的殺菌作用研究[J]. 靳靜,張改,李振江,王書偉,陳松建,黃德海,李亞輝,王小亭,王中全. 中國病原生物學雜志. 2015(02)
[7]一起導管相關黏質沙雷菌血流感染暴發(fā)[J]. 潘軍,許青霞,肖偉強,常彥敏,趙霞. 中國感染控制雜志. 2014(10)
[8]2010—2012年粘質沙雷菌耐藥性變遷[J]. 虞軍雷,應華永,徐瑞龍. 現代實用醫(yī)學. 2014(06)
[9]粘質沙雷菌裂解性噬菌體ФSM9-3Y的分離和鑒定[J]. 徐花,余靜丹,王丹,溫劍平,孫延波. 微生物學免疫學進展. 2013(02)
[10]噬菌體RAP44感染鴨疫里默氏菌的電鏡觀察[J]. 程龍飛,陳紅梅,施少華,傅光華,陳文列,林如輝,萬春和,黃瑜. 中國預防獸醫(yī)學報. 2013(02)
碩士論文
[1]禽源大腸桿菌烈性噬菌體的分離鑒定及功能基因組學分析[D]. 李彥哲.南京農業(yè)大學 2013
[2]蝙蝠蛾擬青霉多糖的結構及活性研究[D]. 曾世明.東北師范大學 2011
[3]大腸桿菌K88噬菌體的分離、分類初步鑒定和生物學特性的測定[D]. 代保英.揚州大學 2009
本文編號:3666446
【文章頁數】:93 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
1 粘質沙雷菌概述
2 噬菌體概述
3 粘質沙雷菌噬菌體的研究現狀和進展
4 本研究的內容和意義
第一章 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體的分離
1.1 實驗材料
1.1.1 菌種及樣品
1.1.2 主要試劑與溶液配制
1.1.3 主要儀器
1.2 實驗方法
1.2.1 臨床粘質沙雷菌的分離和耐藥性分析
1.2.2 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體的分離
1.2.3 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體原種的制備
1.2.4 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體的效價測定
1.3 實驗結果
1.3.1 粘質沙雷菌噬菌體宿主的確定
1.3.2 粘質沙雷菌噬菌體的分離
1.3.3 粘質沙雷菌噬菌體原種的制備
1.3.4 粘質沙雷菌噬菌體的噬菌斑特性和效價測定
1.4 討論與分析
第二章 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體的生物學特性
2.1 實驗材料與儀器
2.1.1 菌種與噬菌體
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器
2.2 實驗方法
2.2.1 噬菌體顆粒的提取和純化
2.2.2 透射電鏡下觀察兩株噬菌體的形態(tài)
2.2.3 噬菌體一步生長曲線的測量和爆發(fā)量的估算
2.2.4 粘質沙雷菌噬菌體宿主譜的研究
2.3 實驗結果
2.3.1 粘質沙雷菌噬菌體的顯微形態(tài)特征
2.3.2 粘質沙雷菌噬菌體的一步生長曲線
2.3.3 粘質沙雷菌噬菌體宿主譜測定結果
2.4 討論與分析
第三章 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體受體的探究
3.1 實驗材料
3.1.1 試驗材料
3.1.2 主要儀器
3.2 實驗方法
3.2.1 細菌膜蛋白受體驗證實驗
3.2.2 細菌胞外多糖受體驗證實驗
3.2.3 熱酚水法提取粘質沙雷菌wk2050 的細菌胞外多糖
3.2.4 細菌胞外多糖在體外抑制噬菌體吸附實驗
3.3 實驗結果
3.3.1 細菌膜蛋白受體驗證實驗結果
3.3.2 胞外多糖受體驗證實驗結果
3.3.3 胞外多糖在體外抑制噬菌體吸附的量化實驗結果
3.4 討論與分析
第四章 多重耐藥粘質沙雷菌噬菌體基因組分析
4.1 實驗材料
4.1.1 主要試劑
4.1.2 主要儀器
4.2 實驗方法
4.2.1 苯酚-氯仿法提取和純化噬菌體全基因組
4.2.2 噬菌體全基因組測序
4.2.3 噬菌體基因組預測編碼ORFs的功能注釋
4.2.4 比較基因組學
4.3 實驗結果
4.3.1 噬菌體全基因組的提取和純化
4.3.2 噬菌體全基因組測序
4.3.3 噬菌體基因組預測編碼ORFs的功能注釋和分析
4.3.4 比較基因組學
4.4 討論與分析
第五章 結論和展望
5.1 結論
5.1.1 噬菌體的分離
5.1.2 噬菌體生物學性狀
5.1.3 噬菌體受體初步探究
5.1.4 噬菌體全基因組分析
5.2 展望
參考文獻
附錄A 附表
作者在學期間取得的學術成果
附件
主要簡歷
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]噬菌體治療泛耐藥鮑氏不動桿菌重癥感染小鼠的研究[J]. 閆李俠,黃至澄,任應鵬,李恪梅,陳保文,王國治. 中國人獸共患病學報. 2017(10)
[2]沙雷菌裂解性噬菌體PS2生物學特性及其全基因組測序[J]. 張改,李振江,靳靜,王書偉,陳松建,李亞輝,黃德海,王小亭,王山梅,王中全. 中國人獸共患病學報. 2017(09)
[3]食源性金黃色葡萄球菌粘附素基因的檢測及蛋白酶K和DNase Ⅰ對菌株被膜形成的影響[J]. 馬伊薩蘭,余博旸,陳娟,劉驥,唐俊妮. 食品工業(yè)科技. 2016(17)
[4]銅綠假單胞菌噬菌體D204的生物學特性和基因組學研究[J]. 徐彬,高晶,郭曉奎,秦金紅. 上海交通大學學報(醫(yī)學版). 2016(01)
[5]糞腸球菌裂解性噬菌體φEn-ZZ8生物學特性的初步分析[J]. 張哲,李菁華,逯茵茵,韓放,李詩恒,孫延波. 微生物與感染. 2015(04)
[6]粘質沙雷菌毒性噬菌體PS4的生物學特性及其在小鼠血清中的殺菌作用研究[J]. 靳靜,張改,李振江,王書偉,陳松建,黃德海,李亞輝,王小亭,王中全. 中國病原生物學雜志. 2015(02)
[7]一起導管相關黏質沙雷菌血流感染暴發(fā)[J]. 潘軍,許青霞,肖偉強,常彥敏,趙霞. 中國感染控制雜志. 2014(10)
[8]2010—2012年粘質沙雷菌耐藥性變遷[J]. 虞軍雷,應華永,徐瑞龍. 現代實用醫(yī)學. 2014(06)
[9]粘質沙雷菌裂解性噬菌體ФSM9-3Y的分離和鑒定[J]. 徐花,余靜丹,王丹,溫劍平,孫延波. 微生物學免疫學進展. 2013(02)
[10]噬菌體RAP44感染鴨疫里默氏菌的電鏡觀察[J]. 程龍飛,陳紅梅,施少華,傅光華,陳文列,林如輝,萬春和,黃瑜. 中國預防獸醫(yī)學報. 2013(02)
碩士論文
[1]禽源大腸桿菌烈性噬菌體的分離鑒定及功能基因組學分析[D]. 李彥哲.南京農業(yè)大學 2013
[2]蝙蝠蛾擬青霉多糖的結構及活性研究[D]. 曾世明.東北師范大學 2011
[3]大腸桿菌K88噬菌體的分離、分類初步鑒定和生物學特性的測定[D]. 代保英.揚州大學 2009
本文編號:3666446
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