小非編碼RNA(small non-coding RNA,sncRNA)包括microRNA(miRNA)和PIWI蛋白互作RNA(PIWI-interacting RNA,piRNAs),其異常表達(dá)參與支氣管哮喘(簡(jiǎn)稱哮喘)氣道上皮炎癥過(guò)程。目前的研究多基于哮喘相關(guān)sncRNA的異常表達(dá)功能研究,少有對(duì)sncRNA表達(dá)變化原因的探究。我們前期的研究發(fā)現(xiàn),蛋白質(zhì)精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶1(protein arginine methyltransferase 1,PRMT1)作為哮喘標(biāo)志性分子,參與上皮細(xì)胞炎癥的發(fā)生和氣道下重塑。本文利用過(guò)表達(dá)人肺上皮細(xì)胞BEAS-2B中哮喘標(biāo)志性基因PRMT1,進(jìn)行sncRNA深度測(cè)序并與哮喘數(shù)據(jù)庫(kù)聯(lián)合分析,將差異表達(dá)的sncRNA與5個(gè)Gene Expression Omnibus(GEO)測(cè)序數(shù)據(jù)集進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)23種PRMT1調(diào)控的哮喘相關(guān)的sncRNA。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)驗(yàn)證,篩選出12種miRNA和2種piRNA。將這些sncRNA靶基因與哮喘病人生成的上皮細(xì)胞樣本mRNA測(cè)...

【文章頁(yè)數(shù)】：12 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 細(xì)胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染
    1.2 小RNA-Seq測(cè)序文庫(kù)的構(gòu)建
    1.3 小RNA測(cè)序結(jié)果及分析
    1.4 NCBI數(shù)據(jù)分析與比較
    1.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
    1.6 哮喘病人肺上皮細(xì)胞中的差異表達(dá)基因(DEG)
    1.7 miRNA和piRNA靶基因預(yù)測(cè)
    1.8 KEGG功能分析
    1.9 蛋白質(zhì)免疫印跡分析
    1.10 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 人肺上皮細(xì)胞系BEAS-2B過(guò)表達(dá)PRMT1
    2.2 BEAS-2B細(xì)胞sncRNA分析
    2.3 哮喘中sncRNA網(wǎng)絡(luò)的識(shí)別
    2.4 建立新的哮喘相關(guān)PRMT1-sncRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
    2.5 預(yù)測(cè)差異表達(dá)的miRNA和piRNA揭示53種主要的靶基因失調(diào)影響RTK-Ras/Rap1- MAPK信號(hào)通路
3 討論



本文編號(hào)：4049273