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卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥和敏感組織中的miRNA差異表達(dá)譜檢測及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-06-05 20:13

  本文關(guān)鍵詞:卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥和敏感組織中的miRNA差異表達(dá)譜檢測及生物信息學(xué)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的:尋找卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥及敏感組織中micro RNA的差異表達(dá),并利用生物信息學(xué)技術(shù)對差異表達(dá)的micro RNAs進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為研究上皮性卵巢癌化療耐藥產(chǎn)生的分子機(jī)制及逆轉(zhuǎn)其化療耐藥提供理論基礎(chǔ)和依據(jù)。方法:首先,應(yīng)用micro RNA表達(dá)譜基因芯片尋找卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥及敏感組織中差異表達(dá)的micro RNAs;其次,選取部分差異表達(dá)的micro RNAs應(yīng)用RT-PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)在擴(kuò)大的組織樣本中進(jìn)行驗(yàn)證;最后,運(yùn)用生物信息學(xué)軟件對符合要求的micro RNAs進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)分析。結(jié)果:1、在micro RNA表達(dá)譜基因芯片中篩選出與卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥相關(guān)的表達(dá)上調(diào)miR-27a-3p、miR-141-3p、miR-200b-3p,表達(dá)下調(diào)miR-93-3p、miR-497-5p、miR-675-3p。2、表達(dá)差異miR-27a-3p,miR-93-3p,miR-141-3p,miR-200b-3p,miR-497-5p,miR-675-3p在擴(kuò)大樣本組織中的RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果與micro RNA微陣列芯片結(jié)果相一致。3、上調(diào)micro RNA(miR-27a-3p、miR-141-3p、miR-200b-3p)通過靶基因預(yù)測軟件預(yù)測到GRB2、NLK、APC、ABL2、ZEB2、RNF2等307個(gè)靶基因,下調(diào)micro RNA(miR-93-3p、miR-497-5p、miR-675-3p)通過靶基因預(yù)測軟件預(yù)測到ALS2、KLF8、CCND2、IGF1R、ZFX、CALU等53個(gè)靶基因。4、上調(diào)micro RNAs預(yù)測的靶基因GO(BP模塊)分析結(jié)果顯示:正調(diào)控含核酸堿基化合物代謝過程、正調(diào)控高分子代謝過程及細(xì)胞死亡可能與化療耐藥及藥物代謝存在相關(guān)性。上調(diào)micro RNAs預(yù)測的靶基因KEGG Pathway分析結(jié)果顯示:MAPK信號通路、ErbB信號通路及TGF-β信號通路可能參與了化療耐藥產(chǎn)生的機(jī)制。5、SP1、TGFB2、PAK2基因蛋白均參與了與耐藥相關(guān)的生物過程和信號通路。結(jié)論:1、miRNA芯片微陣列分析及生物信息學(xué)分析技術(shù)可為人類研究上皮性卵巢癌多藥耐藥機(jī)制提供新的途徑,micro RNAs與上皮性卵巢癌化療多藥耐藥間的相關(guān)性將為逆轉(zhuǎn)其多藥耐藥提供一種全新的思路和策略。2、miRNA-27-3p及其靶基因SP1,miRNA-141-3p及其靶基因TGFB2,miRNA-200b-3p及其靶基因PAK2可能在上皮性卵巢癌化療耐藥的發(fā)生機(jī)制中扮演重要角色。
【關(guān)鍵詞】:miRNA表達(dá)譜基因芯片 卵巢漿液性癌 化療耐藥及敏感 生物信息學(xué)技術(shù)
【學(xué)位授予單位】:山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R737.31
【目錄】:
  • 中文摘要5-7
  • 英文摘要7-9
  • 縮略簡稱9-10
  • 前言10-11
  • 1 材料與方法11-18
  • 1.1 實(shí)驗(yàn)材料11
  • 1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備11-12
  • 1.3 實(shí)驗(yàn)試劑12
  • 1.4 實(shí)驗(yàn)方法12-18
  • 1.4.1 microRNA表達(dá)譜基因芯片檢測12-14
  • 1.4.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證芯片差異表達(dá)譜14-17
  • 1.4.3 micro RNA差異表達(dá)譜的靶基因預(yù)測17
  • 1.4.4 DAVID軟件平臺對靶基因行生物信息學(xué)分析17-18
  • 2 結(jié)果18-26
  • 3 討論26-29
  • 4 結(jié)論29-30
  • 參考文獻(xiàn)30-33
  • 文獻(xiàn)綜述33-42
  • 參考文獻(xiàn)38-42
  • 在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果42-43
  • 附錄43-45
  • 致謝45-46
  • 個(gè)人簡歷46

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本文編號:424547

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