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高級別漿液性卵巢癌侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān)lncRNA的篩選及鑒定

發(fā)布時間:2020-04-01 17:04
【摘要】:背景:卵巢癌是女性生殖系統(tǒng)中致死率最高的惡性腫瘤,由于其早期病變的隱匿性,大多數(shù)人被確診時已是晚期,癌灶的侵襲與轉(zhuǎn)移是導(dǎo)致卵巢癌患者預(yù)后不良的主要因素之一,目前尚無有效的早期篩查和診斷的手段。高級別漿液性卵巢癌(HGSOC)是卵巢癌最常見的組織類型。越來越多的證據(jù)表明長鏈非編碼RNA(lncRNA)在卵巢癌中表達(dá)并發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用,因此,探索HGSOC轉(zhuǎn)移的機制并尋找新的分子標(biāo)志物和治療靶點用于阻斷癌細(xì)胞盆腹腔轉(zhuǎn)移并提高該特定人群中的五年生存率是至關(guān)重要的。方法:通過lncRNA基因芯片研究3例HGSOC患者的卵巢癌原發(fā)灶和配對大網(wǎng)膜轉(zhuǎn)移灶中的差異lncRNA表達(dá)譜,并采用共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖基于芯片報告基礎(chǔ)上分析HGSOC中于與CTD-2020K17.1表達(dá)存在相關(guān)性的基因。采用Real-timePCR技術(shù)檢測38例配對卵巢癌原發(fā)灶和大網(wǎng)膜轉(zhuǎn)移灶的HGSOC組織中CTD-2020K17.1的表達(dá),并通過這些數(shù)據(jù)分析CTD-2020K17.1表達(dá)與HGSOC患者臨床病理特征的相關(guān)性。結(jié)果:通過基因芯片分析我們發(fā)現(xiàn)了一個全新的lncRNACTD-2020K17.1。CTD-2020K17.1在卵巢癌大網(wǎng)膜轉(zhuǎn)移灶中表達(dá)顯著高于原發(fā)灶(P0.05)。通過共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖分析,我們發(fā)現(xiàn)CTD-2020K17.1與CARD11在HGSOC中的表達(dá)具有相關(guān)性。此外,CTD-2020K17.1在卵巢癌原發(fā)灶和大網(wǎng)膜轉(zhuǎn)移灶的相對表達(dá)與患者的CA125水平相關(guān)(P0.05)。結(jié)論:CTD-2020K17.1在卵巢癌大網(wǎng)膜轉(zhuǎn)移灶中顯著上調(diào)并且與CARD11的表達(dá)相關(guān),或參與了CARD11的調(diào)控。此外,CTD-2020K17.1在HGSOC中與CA-125的表達(dá)水平顯著相關(guān)。CTD-2020K17.1或促進高級別漿液性卵巢癌的侵襲與轉(zhuǎn)移。
【圖文】:

差異表達(dá),芯片,倍數(shù),聚類分析


3 結(jié) 果3.1lncRNA在 HGSOC中的差異表達(dá)譜首先,我們采用 ArraystarHumanLncRNAs芯片檢測了來自 3例來自 HGSOC患者的配對卵巢癌原發(fā)灶組織和大網(wǎng)膜轉(zhuǎn)移灶組織的 lncRNA差異表達(dá)譜分布(圖3.1A)。通過芯片篩選共獲得 18617個差異性表達(dá)的 lncRNA,其中 OMTs相對于POCTs表達(dá)上調(diào)的 lncRNA37個(fold-change>2;p<0.05),,表達(dá)下調(diào)的 lncRNA22個(fold-change,>2;p<0.05)(圖 3.1B)。經(jīng)篩選,我們發(fā)現(xiàn)了一個從未被報導(dǎo)過的lncRNACTD-2020K17.1,其表達(dá)上調(diào)最為顯著,且被收錄于 Gencodedatabase數(shù)據(jù)庫中。

網(wǎng)絡(luò)圖,共表達(dá),網(wǎng)絡(luò)圖


6表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖(co-expressionnetworkofcoding-non-codinggenes計算在 HGSOC中差異表達(dá)的 lncRNA和 mRNA之間的 Pearson相圖所示(圖 3.2),共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖列舉了 15個與 lncRNACTD-2020潛在的靶基因,通過 pubmed數(shù)據(jù)庫檢索發(fā)現(xiàn),其中一個基因 CA襲轉(zhuǎn)移緊密相關(guān),然而 CARD11與目的 lncRNA二者間具體的相互的分子機制有待進一步深入的探究。
【學(xué)位授予單位】:中國醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R737.31

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本文編號:2610726

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