本文關(guān)鍵詞：輕癥或重癥手足口病患兒HEV71分離鑒定及其VP1基因型分析

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【摘要】：背景：人腸道病毒71型(human enterovirus 71,HEV71)為腸道病毒A組單股正鏈RNA病毒,是手足口病(hand-foot-and-mouth disease, HFMD)主要病原體。HEV71殼粒由VP1-VP4四種病毒蛋白組成,其中VP1具有細(xì)胞受體結(jié)合位點(diǎn)、中和抗體表位及抗病毒藥物結(jié)合位點(diǎn),故VP1在病毒感染、抗病毒免疫應(yīng)答及藥物治療效果等方面有重要作用。若VP1功能相關(guān)重要位點(diǎn)發(fā)生突變,可使HEV71毒力和耐藥性發(fā)生改變,從而對(duì)HFMD患者病情嚴(yán)重程度產(chǎn)生較大影響。HEV71的VP1序列中有一個(gè)微小RNA病毒衣殼蛋白樣(picornavirus capsid protein domain-like, rhv_like)功能結(jié)構(gòu)域(domain),該結(jié)構(gòu)域含有9個(gè)藥物結(jié)合位點(diǎn)。根據(jù)VP1序列差異,HEV71可分為A、B0～5和C1～5基因型,不同地區(qū)流行的主要HEV71-VP1基因型可有差異。因此,了解不同地區(qū)優(yōu)勢(shì)流行的HEV71 VP1基因型及其rhv_like結(jié)構(gòu)域中藥物結(jié)合位點(diǎn)突變對(duì)于HFMD防控及治療均有較大意義。目的：從不同病情HFMD患兒中分離鑒定HEV71并分析其VP1基因型及rhv_like結(jié)構(gòu)域中藥物結(jié)合位點(diǎn)突變情況。方法：從2014年浙江省紹興地區(qū)4例輕癥和4例重癥HFMD患兒標(biāo)本中分離HEV71并用RT-PCR進(jìn)行鑒定。采用RT-PCR擴(kuò)增病毒分離株全長(zhǎng)VPl基因并測(cè)序。采用專(zhuān)業(yè)生物信息學(xué)軟件,對(duì)HEV71分離株進(jìn)行VP1基因分型、確定VP1基因rhv like結(jié)構(gòu)域中藥物結(jié)合位點(diǎn)突變情況并構(gòu)建HEV71分離株系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果：HEV和HEV71 RT-PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,8例HFMD患兒標(biāo)本中分離的病毒均為HEV71。與GenBank中HEV71參考標(biāo)準(zhǔn)株VP1基因各基因型序列比較,8例HFMD患兒標(biāo)本中分離的HEV71株VP1基因核苷酸及氨基酸序列均與C4a基因型相似性最高,分別為97.2%～98.8%和99.3%～99.7%。2株分離自2例重癥HFMD患兒HEV71株VP1基因hv_like結(jié)構(gòu)域中第179位藥物結(jié)合位點(diǎn)出現(xiàn)V179L突變。與國(guó)內(nèi)外不同地區(qū)HEV71分離株VP1基因比較,5株HEV71分離株與安徽和湖南分離株親緣關(guān)系較近,3株HEV71分離株與上海和山東分離株親緣關(guān)系較近。結(jié)論：本地區(qū)不同病情HFMD患兒分離的HEV71均為VP1-C4a基因型,重癥患兒HEV71分離株VP1基因rhv_like結(jié)構(gòu)域中第179位藥物結(jié)合位點(diǎn)突變可能與病情嚴(yán)重程度有關(guān)。
【關(guān)鍵詞】：手足口病 人腸道病毒71型 VP1基因 基因分型 微小RNA病毒衣殼蛋白樣功能結(jié)構(gòu)域 藥物結(jié)合位點(diǎn) 突變
【學(xué)位授予單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：R725.1
【目錄】：

• 致謝4-5
• 中文摘要5-7
• Abstract7-12
• 1 引言12-15
• 1.1 背景12-13
• 1.2 研究目的與意義13-15
• 2 HEV和HEV71的RT-PCR檢測(cè)15-19
• 2.1 材料15-16
• 2.2 方法16-17
• 2.3 結(jié)果17-19
• 3 HEV71的分離與鑒定19-23
• 3.1 材料19-20
• 3.2 方法20-21
• 3.3 結(jié)果21-23
• 4 HEV71-VP1基因的擴(kuò)增及序列測(cè)定23-30
• 4.1 材料23
• 4.2 方法23-24
• 4.3 結(jié)果24-30
• 5 HEV71-VP1基因型分析和突變分析30-37
• 5.1 材料30
• 5.2 方法30
• 5.3 結(jié)果30-37
• 6 討論37-39
• 參考文獻(xiàn)39-43
• 綜述43-64
• 參考文獻(xiàn)55-64
• 作者簡(jiǎn)歷及在學(xué)期間所取得的科研成果64

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 翁育偉;嚴(yán)延生;;腸道病毒71型研究進(jìn)展[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2014年01期

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本文編號(hào)：847436