鴨甲肝病毒（Duck hepatitis A virus,DHAV）及鴨星狀病毒（Duck astrovirus）導致的鴨病毒性肝炎（Duck viral hepatitis,DVH）,主要感染1～3周齡雛鴨,具有高度致死、傳播迅速的特點。其中DHAV型鴨肝炎呈世界范圍分布,給養(yǎng)鴨業(yè)帶來極大的損失。為深入了解DHAV-3基因組變異情況,本研究對分離自山東青州的DHAV-3分離株QZ1401進行了全基因組序列測定及分析,對其部分毒力開展了研究。本研究主要內(nèi)容包括以下兩方面:1、DHAV-3山東青州分離株QZ1401的全基因組測序及結(jié)果分析本研究通過對DHAV-3青州分離株QZ1401進行分段RT-PCR擴增、測序及拼接,最終得到其全基因組序列,分析其全基因組結(jié)構(gòu),結(jié)果表明:QZ1401株的基因組結(jié)構(gòu)為5’UTR-L-VP0-VP3-VP1-2A1-2A2-2B-2C-3A-3B-3C-3D-3’UTR;QZ1401株與其他GeneBank中登錄的DHAV-3毒株存在很高的同源性,全基因組核苷酸同源性為92.7%⁹9.4%,編碼區(qū)的氨基酸序列的同源性為96.5%

【文章頁數(shù)】：48 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
ABSTRACT
1 前言
    1.1 鴨甲肝病毒的概述
        1.1.1 鴨甲肝病毒的分類地位
        1.1.2 DHAV研究的發(fā)展史
    1.2 DHAV的生物學特性
        1.2.1 DHAV的結(jié)構(gòu)特征及抵抗力
        1.2.2 D H AV的致病性
        1.2.3 D H AV的培養(yǎng)特性
    1.3 DHAV-1 分子生物學研究進展
        1.3.1 DHAV-3 基因組結(jié)構(gòu)
        1.3.2 DHAV-3 功能蛋白作用及其特性
    1.4 DHAV的流行病學
    1.5 DHAV的預防與治療
        1.5.1 DHAV的預防
        1.5.2 治療
    1.6 本研究目的意義
2 材料與方法
    2.1 材料
        2.1.1 菌 （ 毒 ）
        2.1.2 試驗動物
        2.1.3 酶和相關(guān)試劑
        2.1.4 主要儀器
        2.1.5 實驗所用的溶液及其配制
        2.1.6 全基因組擴增引物的設(shè)計與合成
    2.2 方法
        2.2.1 QZ1401株DHAV-3 的分離培養(yǎng)以及全基因組測序
        2.2.2 QZ1401株DHAV-3 的毒力測定
3 結(jié)果與分析
    3.1 QZ1401株DHAV-3 全基因組測序的結(jié)果分析
        3.1.1 目的片段擴增結(jié)果
        3.1.2 QZ1401株DHAV-3 全基因組結(jié)構(gòu)測序結(jié)果拼接與同源
        3.1.3 氨基酸進化樹的構(gòu)建與分析
        3.1.4 VP1高變區(qū)氨基酸序列分析
    3.2 毒力檢測的結(jié)果
        3.2.1 鴨胚半數(shù)致死量
        3.2.2 雛鴨半數(shù)致死量
4 討論
    4.1 QZ1401株全基因組測序及分析
    4.2 毒力測定
5 結(jié)論
參考文獻
致謝



本文編號：4046409