本研究旨在克隆版納微型豬近交系(BMI)PSP-I基因并對其進行生物信息學分析。通過RT-PCR方法從15月齡BMI睪丸組織中克隆PSP-I基因,利用生物信息學方法分析其序列組成特征。結(jié)果表明:克隆的PSP-I基因mRNA序列長420 bp,其中CDS長241 bp,編碼79個氨基酸,推測編碼蛋白分子量為8.588 9 ku,理論等電點為8.64,酸性氨基酸(Asp+Glu)有8個,堿性氨基酸(Lys+Arg)有10個;PSP-I蛋白質(zhì)屬于穩(wěn)定蛋白,為疏水蛋白,無跨膜信號肽位點,存在1個N-糖基化位點和8個潛在磷酸化位點;無規(guī)則卷曲是PSP-I蛋白的主要結(jié)構(gòu)。

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將PSP-I基因進行擴增，特異性片段為420bp，經(jīng)電泳檢測，目的基因片段大小與預期片段大小一致（圖1）。2.2PSP-I基因序列分析

PSP-I蛋白質(zhì)不穩(wěn)定指數(shù)為34.99，屬于穩(wěn)定蛋白；脂溶指數(shù)為90.00，總的親水性平均系數(shù)（GrandAverageOfHydropathicity,GRAVY）為-0.241，具有疏水性。使用SignalP4.1對PSP-I蛋白進行預測，表明PSP-I蛋白沒有信號....

圖4PSP-I蛋白跨膜信號肽位點預測NetPhos2.0預測表明，PSP-I蛋白存在8個磷酸化位點，其中5個絲氨酸（Ser）磷酸化位點（A51、A52、A62、A67、A77）、0個蘇氨酸（Thr）磷酸化位點、3個酪氨酸（Tyr）活性位點（A7、A24、A69）（圖6）。

NetPhos2.0預測表明，PSP-I蛋白存在8個磷酸化位點，其中5個絲氨酸（Ser）磷酸化位點（A51、A52、A62、A67、A77）、0個蘇氨酸（Thr）磷酸化位點、3個酪氨酸（Tyr）活性位點（A7、A24、A69）（圖6）。用SOPMA方法預測的PSP-I蛋白的二級....

本文編號：4008890