基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的意大利蝗微衛(wèi)星位點分析與分子標(biāo)記開發(fā)
發(fā)布時間:2023-11-27 20:06
【目的】意大利蝗Calliptamus italicus (L.)是新疆荒漠半荒漠草原重要害蟲。本研究利用已獲得的意大利蝗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),鑒定其微衛(wèi)星位點!痉椒ā渴褂肕ISA篩選SSR位點,利用Primer Premier 5設(shè)計引物,通過PCR擴增對引物進(jìn)行驗證。【結(jié)果】在意大利蝗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中,共檢測出156500個SSR位點,分布在126369條unigene中。其中,單核苷酸重復(fù)為60.88%,二核苷酸重復(fù)為23.58%,三核苷酸重復(fù)和四核苷酸重復(fù)分別為12.99%和2.04%。單核苷酸重復(fù)主要為A/T(44.38%),二核苷酸重復(fù)主要為AC/GT(12.99%)和AG/CT(8.05%);诤Y選的SSR位點設(shè)計引物,隨機挑選24對引物,對10個不同地理種群意大利蝗成蟲DNA樣品進(jìn)行PCR擴增,共有6對引物擴增成功。【結(jié)論】本研究利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)發(fā)掘意大利蝗SSR位點,為意大利蝗分子標(biāo)記、種群遺傳及功能基因等研究奠定基礎(chǔ)。
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 意大利蝗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來源
1.2 供試蟲源及DNA提取
1.3 SSR鑒定
1.4 SSR引物設(shè)計及驗證
2 結(jié)果與分析
2.1 意大利蝗轉(zhuǎn)錄組中SSR位點的分布特征
2.2 意大利蝗成蟲SSR引物設(shè)計與PCR擴增
3 討論與結(jié)論
本文編號:3868488
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 意大利蝗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來源
1.2 供試蟲源及DNA提取
1.3 SSR鑒定
1.4 SSR引物設(shè)計及驗證
2 結(jié)果與分析
2.1 意大利蝗轉(zhuǎn)錄組中SSR位點的分布特征
2.2 意大利蝗成蟲SSR引物設(shè)計與PCR擴增
3 討論與結(jié)論
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