為了解類(lèi)NADC30豬繁殖與呼吸綜合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的基因組變化情況與分子流行病學(xué)特征,對(duì)本實(shí)驗(yàn)室已鑒定為類(lèi)NADC30陽(yáng)性樣品進(jìn)行全基因組測(cè)序,共得到5個(gè)類(lèi)NADC30 PRRSV全基因組,并依次命名為180049-1,180770-16,180546-27,180450-1,180253-5。對(duì)5株類(lèi)NADC30毒株的NSP2蛋白進(jìn)行氨基酸序列比對(duì)結(jié)果表明:與VR2332株對(duì)比,5株毒株在NSP2蛋白322～432,483,504～522位均存在111+1+19個(gè)氨基酸的不連續(xù)缺失,與已報(bào)道類(lèi)NADC30毒株的缺失特征相同。其中,180546-27毒株在NSP2蛋白除具有與NADC30相同的氨基酸缺失以外,在毒株NSP2蛋白中位置18～23,805～806含有額外的6+2個(gè)氨基酸缺失。核苷酸同源性分析結(jié)果表明:180049-1,180770-16,180546-27,180450-1,180253-5全基因與CH-1a(譜系8)的核苷酸同源性分別為93.3%,84.8%,86...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 病料及處理
    1.2 主要試劑
    1.3 主要設(shè)備
    1.4 樣品的全基因組獲取
    1.5 同源性和遺傳進(jìn)化分析
    1.6 重組分析
2 結(jié)果
    2.1 5株類(lèi)NADC30毒株的核苷酸同源性分析
    2.2 5株毒株ORF5 基因序列的遺傳演化分析
    2.3 5株毒株NSP2基因缺失特征
    2.4 5株毒株全基因組重組分析
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