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秦川牛SIX1和SIX4基因SNPs檢測及其與體尺和肉質性狀的關聯(lián)分析

發(fā)布時間:2023-04-23 15:47
  SIX1和SIX4基因是一類進化上比較保守的轉錄因子,它們屬于SIX家族。SIX1和SIX4是肌肉發(fā)生、分化時重要的關鍵轉錄因子在動物胚胎及骨骼肌發(fā)育期間,SIX1和SIX4基因協(xié)同作用,它們可直接或通過生肌決定因子家族調控肌肉發(fā)育相關基因。 因此,本研究以487頭秦川牛為實驗材料,通過DNA測序、PCR-RFLP和PCR-SSCP等技術手段分析研究了在肌肉發(fā)育中起關鍵作用的SIX1和SIX4基因在487頭秦川牛群體中的遺傳變異情況,統(tǒng)計了各個基因型的頻率和遺傳多樣性,并研究了這些遺傳變異與秦川牛體尺和肉質數(shù)據(jù)的關聯(lián)性。通過研究這些遺傳變異的遺傳效應,希望發(fā)現(xiàn)顯著影響秦川牛經濟性狀的DNA標記,為分子育種提高秦川牛的生產和肉質性能提供理論基礎。 本研究取得了如下結果: 1. SIX1和SIX4基因的遺傳變異分析 根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫顯示SIX1基因(GeneID:511371)包含有3個外顯子。在對SIX1基因設計了4對引物,經PCR擴增、DNA測序后,發(fā)現(xiàn)SIX1基因的3個外顯子區(qū)域并不存在SNP。 根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫顯示SIX4基因(GeneID:526104)包含有3個外顯子。在對...

【文章頁數(shù)】:50 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
文獻綜述
    第一章 研究背景
        1.1 秦川牛情況簡介
        1.2 分子標記技術簡介
            1.2.1 限制性片斷長度多態(tài)性(RFLP)
            1.2.2 單鏈構象多態(tài)性(SSCP)
            1.2.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
            1.2.4 隨機擴增多態(tài)性 DNA (RAPD)
            1.2.5 微衛(wèi)星 DNA 標記
        1.3 SIX1 和 SIX4 基因概況
            1.3.1 肌肉細胞分化、生長調控的功能基因及其調控機理
            1.3.2 SIX 同源框基因家族的研究概況
        1.4 本研究的目的和意義
實驗研究
    第二章 秦川牛 SIX1 和 SIX4 基因的遺傳多態(tài)性及其與體尺和肉質性狀的關聯(lián)分析
        2.1 試驗材料
            2.1.1 試驗 DNA 樣品
            2.1.2 生產性狀資料
            2.1.3 主要儀器設備及試劑
        2.2 試驗方法
            2.2.1 基因組 DNA 的提取
            2.2.2 PCR 擴增體系
            2.2.3 PCR-RFLP 分析
            2.2.4 PCR-SSCP 分析
            2.2.5 統(tǒng)計分析
        2.3 結果與分析
            2.3.1 秦川牛血液基因組 DNA 樣品的檢測
            2.3.2 SIX1 和 SIX4 基因 PCR 電泳檢測結果
            2.3.3 SIX1 和 SIX4 基因 PCR 擴增后的測序結果
            2.3.4 SIX4 基因的擴增產物 RFLP 分析
            2.3.5 SIX4 基因擴增產物的 SSCP 分析
            2.3.6 秦川牛 SIX1 和 SIX4 多態(tài)位點的遺傳學分析
            2.3.7 秦川牛 SIX4 基因多態(tài)位點間的單倍型分析
            2.3.8 SIX4 基因多態(tài)性與秦川牛體尺和肉質性狀的關聯(lián)分析
        2.4 討論
            2.4.1 秦川牛 SIX1 和 SIX4 基因遺傳突變位點的分析
        2.5 結論與創(chuàng)新點
            結論
            創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
作者簡介



本文編號:3800001

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