三穗麻鴨PMEL-17、DRD4和5-HT1A基因表達(dá)及生物信息學(xué)研究
發(fā)布時間:2022-10-04 22:01
為研究三穗鴨100 kDa型跨膜糖蛋白受體基因(PMEL-17)、多巴胺受體基因(DRD4)和5-羥色胺1A型受體基因(5-HT1A)在三穗鴨各個組織中的表達(dá)情況,進一步探討三穗鴨啄羽行為的發(fā)生機制。本研究應(yīng)用分子遺傳學(xué)手段并應(yīng)用SPSS和Excel等生物信息學(xué)分析軟件對三穗鴨PMEL-17、DRD4和5-HT1A基因在三穗鴨心、肝、脾、肺、腎、腸、腦、胸、腿、眼、肌胃和腺胃12個組織的表達(dá)情況進行了生物學(xué)分析。選取60只三穗鴨進行啄羽行為和正常行為觀察,屠宰后選取3只(啄羽行為1只,正常行為2只)三穗鴨,并采集其各個組織,利用Trizol法對以上組織進行RNA提取,構(gòu)建三穗鴨的cDNA文庫,利用熒光定量PCR對上述三個基因在相關(guān)組織中的表達(dá)量進行檢測。最后,應(yīng)用RT-PCR并結(jié)合載體構(gòu)建的方法對三穗鴨PMEL-17基因的完整編碼區(qū)(CDS)進行克隆,對其結(jié)果進行生物信息學(xué)分析。得出以下結(jié)果:1.5-HT1A受體基因在啄羽行為組腦組織中表達(dá)量最高且表達(dá)差異極顯著顯著(P<0.01),其次是在腎組織中,其表達(dá)結(jié)果差異顯著(P<0.05)。剩余的10個組織,該基因的表達(dá)量相近并且5-HT1...
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 前言
2 中國養(yǎng)鴨現(xiàn)狀
3 三穗鴨簡介
4 DRD4、5-HT1A和PMEL-17受體基因研究進展
4.1 DRD4基因研究進展
4.2 5-HT1A基因研究進展
4.3 PMEL-17基因研究進展
5 生物信息學(xué)簡介
6 生物信息數(shù)據(jù)庫
7 生物信息學(xué)研究內(nèi)容
8 生物信息學(xué)應(yīng)用
9 本研究的目的與意義
第二章 三穗鴨DRD4、5-HT1A和PMEL-17基因表達(dá)分析
1 實驗材料與方法
1.1 實驗動物及飼養(yǎng)
1.2 樣品采集
1.3 主要儀器
1.4 主要試劑
2 試驗方法
2.1 總RNA提取
2.2 RT-PCR合成cDNA第一鏈
2.3 PCR引物設(shè)計和擴增條件優(yōu)化
3 結(jié)果和分析
3.1 RNA的純度與完整性
3.2 熒光定量PCR的靈敏性和可靠性
3.3 溶解曲線與假陽性
3.4 基因表達(dá)差異分析
4 討論
4.1 關(guān)于5-HT1A基因的組織表達(dá)
4.2 關(guān)于DRD4基因的組織表達(dá)
4.3 關(guān)于PMEL-17基因的組織表達(dá)
第三章 三穗鴨PMEL-17基因的生物信息學(xué)分析
1.實驗材料
1.1 實驗動物樣本
1.2 樣品采集
1.3 主要試劑
2 試驗方法
2.1 總RNA提取
2.2 RT-PCR合成cDNA第一鏈
2.3 實驗儀器
2.4 PCR引物設(shè)計和擴增條件優(yōu)化
2.5 PCR產(chǎn)物回收
2.6 基因克隆
2.7 基因克隆篩選
2.8 基因克隆測序
2.9 生物信息學(xué)分析
3.結(jié)果與分析
3.1 PCR擴增結(jié)果
3.2 PMEL-17基因生物信息學(xué)分析
4.討論
第四章 結(jié)論與展望
1.結(jié)論
2.展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄Ⅰ 作者簡介
一、基本情況
二、參與發(fā)表論文
三、參加的科研課題
附錄Ⅱ 論文第二、三章使用主要儀器
附錄Ⅲ 英文縮略表
附錄Ⅳ 圖樣
實驗圖片
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]論我國養(yǎng)鴨業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀及問題分析[J]. 吳光瑞,黃文炳. 農(nóng)技服務(wù). 2017(23)
[2]基于RNA-Seq篩選鴨腸炎病毒感染鴨脾差異表達(dá)免疫相關(guān)基因[J]. 吳良濤,鄭敏,華敏,萬潤,程振濤,周碧君,文明. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2017(02)
[3]生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫在醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 劉銀鳳,張雷. 中國病原生物學(xué)雜志. 2014(10)
[4]牛Phlda2基因的組織表達(dá)及生物信息學(xué)分析[J]. 趙姝君,王敬姣,王夢楠,吳茜紅,李冬杰,李世杰. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(03)
[5]Trizol法大鼠心肌總RNA提取方法探討[J]. 戴先成,柴智鋒,徐永城,王山青. 刑事技術(shù). 2014(03)
[6]三穗鴨品種特性概述及產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀與對策[J]. 顧永江,陶宇航,何明才,顧永芬. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2013(06)
[7]三穗鴨MSTN基因多態(tài)性與屠宰性狀相關(guān)性研究[J]. 易恒潔,李輝,楊勝林,趙忠海,彭邦星. 中國家禽. 2013(23)
[8]五羥色胺和多巴胺與攻擊行為的關(guān)聯(lián)研究進展[J]. 段云峰,吳曉麗,王濤,金鋒. 生命科學(xué). 2013(10)
[9]三穗鴨體型外貌觀察與生長發(fā)育分析[J]. 戴焰,楊海兵,易恒潔,李輝,張依裕,楊勝林,蒲德坤,吳宗豪,歐秀勇. 家畜生態(tài)學(xué)報. 2013(06)
[10]三穗鴨揮發(fā)性風(fēng)味成分研究[J]. 蘇偉,武昌會,母應(yīng)春,陳旭,朱秋勁. 食品研究與開發(fā). 2012(10)
碩士論文
[1]光照對蛋鴨晝夜行為節(jié)律的影響及遺傳效應(yīng)分析[D]. 陸曼.貴州大學(xué) 2017
[2]三穗麻鴨行為及DRD4、5-HT1A基因多態(tài)性研究[D]. 李瀟蒙.貴州大學(xué) 2016
本文編號:3685838
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 前言
2 中國養(yǎng)鴨現(xiàn)狀
3 三穗鴨簡介
4 DRD4、5-HT1A和PMEL-17受體基因研究進展
4.1 DRD4基因研究進展
4.2 5-HT1A基因研究進展
4.3 PMEL-17基因研究進展
5 生物信息學(xué)簡介
6 生物信息數(shù)據(jù)庫
7 生物信息學(xué)研究內(nèi)容
8 生物信息學(xué)應(yīng)用
9 本研究的目的與意義
第二章 三穗鴨DRD4、5-HT1A和PMEL-17基因表達(dá)分析
1 實驗材料與方法
1.1 實驗動物及飼養(yǎng)
1.2 樣品采集
1.3 主要儀器
1.4 主要試劑
2 試驗方法
2.1 總RNA提取
2.2 RT-PCR合成cDNA第一鏈
2.3 PCR引物設(shè)計和擴增條件優(yōu)化
3 結(jié)果和分析
3.1 RNA的純度與完整性
3.2 熒光定量PCR的靈敏性和可靠性
3.3 溶解曲線與假陽性
3.4 基因表達(dá)差異分析
4 討論
4.1 關(guān)于5-HT1A基因的組織表達(dá)
4.2 關(guān)于DRD4基因的組織表達(dá)
4.3 關(guān)于PMEL-17基因的組織表達(dá)
第三章 三穗鴨PMEL-17基因的生物信息學(xué)分析
1.實驗材料
1.1 實驗動物樣本
1.2 樣品采集
1.3 主要試劑
2 試驗方法
2.1 總RNA提取
2.2 RT-PCR合成cDNA第一鏈
2.3 實驗儀器
2.4 PCR引物設(shè)計和擴增條件優(yōu)化
2.5 PCR產(chǎn)物回收
2.6 基因克隆
2.7 基因克隆篩選
2.8 基因克隆測序
2.9 生物信息學(xué)分析
3.結(jié)果與分析
3.1 PCR擴增結(jié)果
3.2 PMEL-17基因生物信息學(xué)分析
4.討論
第四章 結(jié)論與展望
1.結(jié)論
2.展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄Ⅰ 作者簡介
一、基本情況
二、參與發(fā)表論文
三、參加的科研課題
附錄Ⅱ 論文第二、三章使用主要儀器
附錄Ⅲ 英文縮略表
附錄Ⅳ 圖樣
實驗圖片
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]論我國養(yǎng)鴨業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀及問題分析[J]. 吳光瑞,黃文炳. 農(nóng)技服務(wù). 2017(23)
[2]基于RNA-Seq篩選鴨腸炎病毒感染鴨脾差異表達(dá)免疫相關(guān)基因[J]. 吳良濤,鄭敏,華敏,萬潤,程振濤,周碧君,文明. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2017(02)
[3]生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫在醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 劉銀鳳,張雷. 中國病原生物學(xué)雜志. 2014(10)
[4]牛Phlda2基因的組織表達(dá)及生物信息學(xué)分析[J]. 趙姝君,王敬姣,王夢楠,吳茜紅,李冬杰,李世杰. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(03)
[5]Trizol法大鼠心肌總RNA提取方法探討[J]. 戴先成,柴智鋒,徐永城,王山青. 刑事技術(shù). 2014(03)
[6]三穗鴨品種特性概述及產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀與對策[J]. 顧永江,陶宇航,何明才,顧永芬. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2013(06)
[7]三穗鴨MSTN基因多態(tài)性與屠宰性狀相關(guān)性研究[J]. 易恒潔,李輝,楊勝林,趙忠海,彭邦星. 中國家禽. 2013(23)
[8]五羥色胺和多巴胺與攻擊行為的關(guān)聯(lián)研究進展[J]. 段云峰,吳曉麗,王濤,金鋒. 生命科學(xué). 2013(10)
[9]三穗鴨體型外貌觀察與生長發(fā)育分析[J]. 戴焰,楊海兵,易恒潔,李輝,張依裕,楊勝林,蒲德坤,吳宗豪,歐秀勇. 家畜生態(tài)學(xué)報. 2013(06)
[10]三穗鴨揮發(fā)性風(fēng)味成分研究[J]. 蘇偉,武昌會,母應(yīng)春,陳旭,朱秋勁. 食品研究與開發(fā). 2012(10)
碩士論文
[1]光照對蛋鴨晝夜行為節(jié)律的影響及遺傳效應(yīng)分析[D]. 陸曼.貴州大學(xué) 2017
[2]三穗麻鴨行為及DRD4、5-HT1A基因多態(tài)性研究[D]. 李瀟蒙.貴州大學(xué) 2016
本文編號:3685838
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