牛FOXA2基因組織表達規(guī)律及遺傳變異研究
發(fā)布時間:2021-11-13 06:50
牛分子標記輔助育種的前提是找到對生長性狀有顯著影響的基因或分子標記。翼螺旋轉(zhuǎn)錄因子FOXA2是調(diào)節(jié)組織發(fā)育、胰腺分泌、糖脂代謝及脂肪分化的重要轉(zhuǎn)錄因子。目前,尚未見該基因在牛上的研究報道。因此,本試驗利用熒光定量PCR首先在mRNA水平上考察了不同發(fā)育階段的秦川牛和不同營養(yǎng)水平肥育的中國荷斯坦牛FOXA2基因的組織表達規(guī)律,探索FOXA2基因?qū)εIL發(fā)育的影響,再利用DNA池測序和PCR-RFLP等方法在群體水平上研究了FOXA2基因在秦川牛、南陽牛、郟縣紅牛、德南牛和夏郟牛中的遺傳變異,并分析了該基因4個多態(tài)位點的遺傳多樣性及其與5個黃牛群體的生長性狀之間的關(guān)聯(lián)性,以期發(fā)現(xiàn)對黃牛生長發(fā)育影響顯著的分子標記,為今后黃牛分子標記輔助選擇、培育優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)的新品系提供科學依據(jù)。本研究獲得以下結(jié)果:(1)秦川牛FOXA2基因在不同發(fā)育階段的組織表達譜分析FOXA2基因在秦川牛3個發(fā)育階段(胎牛、新生犢牛、成年牛)9個組織中的相對定量結(jié)果顯示,F(xiàn)OXA2的表達受組織特異性和時間特異性的影響。FOXA2基因在同一時期各組織間差異表達,在三個時期的肝臟中其表達量均很高,在胎牛和犢牛的肺臟中表達豐度最高...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
組織總RNA瓊脂糖電泳圖
圖 2-1 組織總 RNA 瓊脂糖電泳圖Fig. 2-1 The electrophoresis result of total RNA in tissues注:M 代表 marker 2000,1,2,3 代表 RNA 泳道。Note: M represents marker 2000, 1,2,3 represents RNA lanes.2.2.2 cDNA 質(zhì)量及 qRT-PCR 引物特異性檢測結(jié)果以反轉(zhuǎn)錄所得 cDNA 為模板,以跨外顯子的引物擴增持家基因 GAPDH,經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果如圖 2-2a,僅出現(xiàn)一條 145 bp 的目的片段,與預(yù)期結(jié)果一致,說明 cDNA 沒有受到基因組 DNA 的污染;經(jīng) qRT-PCR 結(jié)果顯示的溶解曲線峰圖 2-2b顯示,目的基因 FOXA2 和內(nèi)參基因 GAPDH 的溶解曲線各均只出現(xiàn)了一個單峰,表明引物特異性好,可進行下一步試驗。
2.2.3 FOXA2 基因在秦川牛中的組織表達譜2.2.3.1 秦川牛 FOXA2 基因在胎牛時期的組織表達譜秦川牛胎牛時期的 8 個不同組織中 FOXA2 基因的相對表達量結(jié)果如圖 2-3 所示,在所檢測的組織中,肺臟的 FOXA2 基因表達豐度最高(P<0.01),且肝臟和肺臟兩個組織的 FOXA2 基因表達量均極顯著高于其他組織(P<0.01),胃和小腸中也表達,脾臟、腎臟和肌肉低量表達或不表達,提示 FOXA2 基因可能在秦川牛胚胎時期與肺臟和肝臟發(fā)育緊密相關(guān)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]南陽牛種質(zhì)資源個性描述[J]. 魏成斌,張彬,施巧婷,藺萍,徐照學. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2013(09)
[2]分子標記在動物育種中的應(yīng)用[J]. 劉雙虎,胡海燕. 養(yǎng)殖技術(shù)顧問. 2013(09)
[3]秦川牛選育與改良的評析與建議[J]. 王娟. 養(yǎng)殖技術(shù)顧問. 2013(09)
[4]飼糧能氮限飼與補償對蒙古羔羊肝臟重量、肝細胞增殖和增肥及生長激素受體、類胰島素生長因子基因表達量的影響[J]. 張冬梅,侯先志,楊金麗,高愛武,王海榮,考桂蘭. 動物營養(yǎng)學報. 2013(07)
[5]實時熒光定量PCR技術(shù)研究及其在醫(yī)學領(lǐng)域的應(yīng)用[J]. 鮑鑫,劉向國,劉茜. 醫(yī)學理論與實踐. 2013(12)
[6]多種因素對牛超數(shù)排卵效果影響的研究[J]. 王峰,黃春華,張東,王申元,劉彩云,劉羿羿,韓錦龍,韓利東,潘靜,張立. 中國農(nóng)學通報. 2013(17)
[7]牦牛乳脂合成關(guān)鍵酶基因全泌乳期的表達研究[J]. 李鈺璨,鄧霄禹,江明鋒. 中國畜牧獸醫(yī). 2013(04)
[8]谷飼、乳飼奶公牛犢直線育肥報告[J]. 王嘉博,孫芳,亓美玉,趙曉川,劉利. 中國牛業(yè)科學. 2013(02)
[9]紅安格斯牛改良郟縣紅牛的試驗效果[J]. 馬桂變. 中國牛業(yè)科學. 2013(01)
[10]中國西門塔爾牛DGAT1和DGAT2基因組織表達譜及其在脂肪組織中的表達與背膘厚的關(guān)聯(lián)分析[J]. 王國富,吳慧光,孫國權(quán),李俊雅,王景山,王玉泉,高樹新. 華北農(nóng)學報. 2012(05)
博士論文
[1]慢病毒介導(dǎo)的Foxa2和Hnf4a組成性表達對胚胎干細胞向肝細胞分化的影響[D]. 劉濤.第三軍醫(yī)大學 2009
[2]豬生產(chǎn)性狀QTL區(qū)域5個候選基因的分離、鑒定及功能初步研究[D]. 吳健.華中農(nóng)業(yè)大學 2007
[3]豬PRKAG3基因表達規(guī)律及其與肉質(zhì)關(guān)系的研究[D]. 李夢云.四川農(nóng)業(yè)大學 2006
[4]營養(yǎng)限制和補償生長對母羊和羔羊的生長軸激素及其受體基因表達水平的影響[D]. 齊景偉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2006
碩士論文
[1]HNF6對結(jié)腸癌腫瘤細胞生物學行為影響的初步研究[D]. 耿海濤.浙江大學 2012
[2]地塞米松調(diào)控胰島β細胞內(nèi)PDX-1、FoxO1表達的機制研究[D]. 駱鶯.南京醫(yī)科大學 2010
[3]北方地區(qū)種公牛遺傳多樣性評估及個體識別研究[D]. 王靜.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2008
[4]五個山羊品種微衛(wèi)星和DQA基因的遺傳多樣性研究[D]. 李俊營.西北農(nóng)林科技大學 2007
本文編號:3492543
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
組織總RNA瓊脂糖電泳圖
圖 2-1 組織總 RNA 瓊脂糖電泳圖Fig. 2-1 The electrophoresis result of total RNA in tissues注:M 代表 marker 2000,1,2,3 代表 RNA 泳道。Note: M represents marker 2000, 1,2,3 represents RNA lanes.2.2.2 cDNA 質(zhì)量及 qRT-PCR 引物特異性檢測結(jié)果以反轉(zhuǎn)錄所得 cDNA 為模板,以跨外顯子的引物擴增持家基因 GAPDH,經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果如圖 2-2a,僅出現(xiàn)一條 145 bp 的目的片段,與預(yù)期結(jié)果一致,說明 cDNA 沒有受到基因組 DNA 的污染;經(jīng) qRT-PCR 結(jié)果顯示的溶解曲線峰圖 2-2b顯示,目的基因 FOXA2 和內(nèi)參基因 GAPDH 的溶解曲線各均只出現(xiàn)了一個單峰,表明引物特異性好,可進行下一步試驗。
2.2.3 FOXA2 基因在秦川牛中的組織表達譜2.2.3.1 秦川牛 FOXA2 基因在胎牛時期的組織表達譜秦川牛胎牛時期的 8 個不同組織中 FOXA2 基因的相對表達量結(jié)果如圖 2-3 所示,在所檢測的組織中,肺臟的 FOXA2 基因表達豐度最高(P<0.01),且肝臟和肺臟兩個組織的 FOXA2 基因表達量均極顯著高于其他組織(P<0.01),胃和小腸中也表達,脾臟、腎臟和肌肉低量表達或不表達,提示 FOXA2 基因可能在秦川牛胚胎時期與肺臟和肝臟發(fā)育緊密相關(guān)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]南陽牛種質(zhì)資源個性描述[J]. 魏成斌,張彬,施巧婷,藺萍,徐照學. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2013(09)
[2]分子標記在動物育種中的應(yīng)用[J]. 劉雙虎,胡海燕. 養(yǎng)殖技術(shù)顧問. 2013(09)
[3]秦川牛選育與改良的評析與建議[J]. 王娟. 養(yǎng)殖技術(shù)顧問. 2013(09)
[4]飼糧能氮限飼與補償對蒙古羔羊肝臟重量、肝細胞增殖和增肥及生長激素受體、類胰島素生長因子基因表達量的影響[J]. 張冬梅,侯先志,楊金麗,高愛武,王海榮,考桂蘭. 動物營養(yǎng)學報. 2013(07)
[5]實時熒光定量PCR技術(shù)研究及其在醫(yī)學領(lǐng)域的應(yīng)用[J]. 鮑鑫,劉向國,劉茜. 醫(yī)學理論與實踐. 2013(12)
[6]多種因素對牛超數(shù)排卵效果影響的研究[J]. 王峰,黃春華,張東,王申元,劉彩云,劉羿羿,韓錦龍,韓利東,潘靜,張立. 中國農(nóng)學通報. 2013(17)
[7]牦牛乳脂合成關(guān)鍵酶基因全泌乳期的表達研究[J]. 李鈺璨,鄧霄禹,江明鋒. 中國畜牧獸醫(yī). 2013(04)
[8]谷飼、乳飼奶公牛犢直線育肥報告[J]. 王嘉博,孫芳,亓美玉,趙曉川,劉利. 中國牛業(yè)科學. 2013(02)
[9]紅安格斯牛改良郟縣紅牛的試驗效果[J]. 馬桂變. 中國牛業(yè)科學. 2013(01)
[10]中國西門塔爾牛DGAT1和DGAT2基因組織表達譜及其在脂肪組織中的表達與背膘厚的關(guān)聯(lián)分析[J]. 王國富,吳慧光,孫國權(quán),李俊雅,王景山,王玉泉,高樹新. 華北農(nóng)學報. 2012(05)
博士論文
[1]慢病毒介導(dǎo)的Foxa2和Hnf4a組成性表達對胚胎干細胞向肝細胞分化的影響[D]. 劉濤.第三軍醫(yī)大學 2009
[2]豬生產(chǎn)性狀QTL區(qū)域5個候選基因的分離、鑒定及功能初步研究[D]. 吳健.華中農(nóng)業(yè)大學 2007
[3]豬PRKAG3基因表達規(guī)律及其與肉質(zhì)關(guān)系的研究[D]. 李夢云.四川農(nóng)業(yè)大學 2006
[4]營養(yǎng)限制和補償生長對母羊和羔羊的生長軸激素及其受體基因表達水平的影響[D]. 齊景偉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2006
碩士論文
[1]HNF6對結(jié)腸癌腫瘤細胞生物學行為影響的初步研究[D]. 耿海濤.浙江大學 2012
[2]地塞米松調(diào)控胰島β細胞內(nèi)PDX-1、FoxO1表達的機制研究[D]. 駱鶯.南京醫(yī)科大學 2010
[3]北方地區(qū)種公牛遺傳多樣性評估及個體識別研究[D]. 王靜.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2008
[4]五個山羊品種微衛(wèi)星和DQA基因的遺傳多樣性研究[D]. 李俊營.西北農(nóng)林科技大學 2007
本文編號:3492543
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