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山西省雞源新城疫病毒基因特性分析

發(fā)布時(shí)間:2021-10-14 13:49
  為調(diào)查山西省雞源新城疫病毒(NDV)的流行現(xiàn)狀,本研究于2011-2012年從山西省部分地區(qū)的發(fā)病雞群分離、鑒定出5株NDV,參考GenBank中已發(fā)表的NDV F基因序列(FJ969394),設(shè)計(jì)了用于擴(kuò)增F基因的特異引物,應(yīng)用RT-PCR技術(shù)擴(kuò)增5株分離株的F基因片段。將擴(kuò)增、純化的目的片段DNA與PMD19simple-T載體連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞,運(yùn)用菌落PCR法鑒定,將鑒定為含有陽(yáng)性質(zhì)粒的重組菌進(jìn)行基因測(cè)序。利用DNAStar7.1軟件對(duì)5株NDV的分子生物學(xué)特性進(jìn)行了研究,包括繪制系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)、確定基因型,并與參考毒株的核苷酸及相應(yīng)氨基酸序列進(jìn)行比較。對(duì)分離株F基因序列的分析結(jié)果表明:其中的4株病毒在基因型分類上屬于基因II亞型,并與標(biāo)準(zhǔn)弱毒疫苗LaSota株高度同源,核苷酸序列同源性為99.2%-99.4%,氨基酸序列同源性為100%,且裂解位點(diǎn)氨基酸序列為:112G-R-Q-G-R-L117,符合弱毒株裂解位點(diǎn)特征。另1分離毒株在基因型分類上與JS/5/01/Go同屬基因Ⅶd亞型,兩者核苷酸序列同源性為95.6%,氨基酸序列同源性為97.5%,其裂解位點(diǎn)氨基酸序列為:1... 

【文章來(lái)源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省

【文章頁(yè)數(shù)】:28 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
符號(hào)說(shuō)明
前言
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 新城疫發(fā)病特點(diǎn)
    1.2 新城疫病原學(xué)
    1.3 NDV的分子生物學(xué)特性
    1.4 我國(guó)NDV分子生物學(xué)及其疫苗的研究進(jìn)展
        1.4.1 我國(guó)NDV分子生物學(xué)研究進(jìn)展
        1.4.2 新城疫疫苗研究現(xiàn)狀
    1.5 本研究的內(nèi)容、目的及意義
2 NDV的分離鑒定及F基因片段的擴(kuò)增
    2.1 NDV的分離鑒定
        2.1.1 材料與方法
        2.1.2 結(jié)果與分析
        2.1.3 討論
    2.2 NDV F基因可變區(qū)部分序列的擴(kuò)增與分析
        2.2.1 材料與方法
        2.2.2 結(jié)果與分析
        2.2.3 討論
    2.3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
Abstract
致謝



本文編號(hào):3436282

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