新發(fā)血清4型禽腺病毒遺傳進(jìn)化分析及細(xì)胞受體的鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-08-18 06:34
2015年7月以來(lái),心包積液-包涵體肝炎綜合征(HPS)在我國(guó)大部分家禽密集養(yǎng)殖地區(qū)大規(guī)模爆發(fā)流行并迅速蔓延,給我國(guó)家禽養(yǎng)殖業(yè)帶來(lái)了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。針對(duì)新發(fā)疫情,本研究從HPS蛋雞肝臟組織中分離1株高致病性HLJFAd15毒株并鑒定其為FAdV-4。HLJFAd15全基因組分析發(fā)現(xiàn)HLJFAd15存在ORF19、ORF27的大片段天然缺失,與我國(guó)近期分離鑒定的高致病性毒株一致,被定義為新基因型FAdV-4。我們利用HLJFAd15毒株成功建立了新發(fā)FAdV-4的SPF雞攻毒感染模型,其口服接種和肌肉注射接種的致死率分別達(dá)到76.9%和100%,同時(shí)能夠很好的復(fù)制臨床心包積液和包涵體肝炎的癥狀。SPF雞動(dòng)物感染模型的成功建立對(duì)我國(guó)新發(fā)FAdV-4疫苗的研發(fā)和致病機(jī)制研究具有重要意義。鑒于目前為止尚沒(méi)有鴨源FAdV-4的全基因組序列,我們分離鑒定了 1株鴨源FAdV-4毒株HLJDAd15,并對(duì)該毒株進(jìn)行了全基因組序列測(cè)定,上傳GenBank第1株鴨源FAdV-4的全基因組序列,豐富了 FAdV-4基因組的多樣性,為FAdV-4診斷靶標(biāo)的選擇提供了參考。HLJDAd15致病性實(shí)驗(yàn)顯示我國(guó)新...
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2-1肝臟DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增結(jié)果??
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士后出站報(bào)告?第二章新發(fā)血清4型禽腺病毒遺傳進(jìn)化分析??M?1?+?-??2.〇〇〇^?MHa??i,〇,?g—??^PT?4^561?bo??5〇〇^?WmmSm?F??25〇^?immi??i」??圖2-1肝臟DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增結(jié)果??M:?DL2,000;?1:?HLJFAdl5;?+:陽(yáng)性對(duì)照;陰性對(duì)照??Fig.?2-1?PCR?results?of?DNA?sample?of?liver??M:?DL2,000;?1:?HLJFAdl5;?+:?positive?control;?negative?control??2.3.1.2HLJFAdl5?的?hexon?序歹丨J分析??HLJFAdl5毒株鑒定為FAdV-4之后,設(shè)計(jì)針對(duì)FAdV-4的hexon序列的特??異性引物,擴(kuò)增其全長(zhǎng)hexon序列并進(jìn)行序列分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)HLJFAdl5毒株與??我國(guó)流行JSJ13毒株高度同源(圖2-2)。??1QOr?764?(JN112373}?FAdv^??一t?HG?(GU734104)??-100J?A-2A(AF083975)?fAdv^??L??HBQ12?(KM096545)??43??340?(NC?021221}?FAdv-B??.!〇n??CELO?(U46933)?fa<jv-a??9T???HLJFAd15??cl?JSJ13(KM098544)??1〇〇?KC(EU177545)??—?PB-05(EU931691)?FAdv^??100?100?PK-01?(EU931693)??97????KR5?(HE6C?152)
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Ⅰ亞群禽腺病毒通用PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 肖躍強(qiáng),于雪,劉吉山,楊慧,苗立中,徐晴晴,何誠(chéng),沈志強(qiáng). 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(03)
[2]雞馬立克氏病強(qiáng)弱病毒株P(guān)CR鑒別檢測(cè)方法在診斷中的應(yīng)用評(píng)價(jià)[J]. 呂紅超,張艷萍,孫國(guó)榮,高玉龍,李志杰,鄭惠文,包珂巖,王笑梅,劉長(zhǎng)軍. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(07)
[3]Ⅰ群禽腺病毒SYBR GreenⅠ熒光PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 文艷玲,謝芝勛,王瑩,謝麗基. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2008(09)
[4]禽腺病毒江蘇分離株的細(xì)胞培養(yǎng)特性[J]. 周斌,鄭其升,劉華雷,曹瑞兵,陳溥言. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(02)
碩士論文
[1]禽腺病毒血清4型巢式PCR和環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)方法建立及應(yīng)用[D]. 鐘鳴.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
本文編號(hào):3349388
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圖2-1肝臟DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增結(jié)果??
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士后出站報(bào)告?第二章新發(fā)血清4型禽腺病毒遺傳進(jìn)化分析??M?1?+?-??2.〇〇〇^?MHa??i,〇,?g—??^PT?4^561?bo??5〇〇^?WmmSm?F??25〇^?immi??i」??圖2-1肝臟DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增結(jié)果??M:?DL2,000;?1:?HLJFAdl5;?+:陽(yáng)性對(duì)照;陰性對(duì)照??Fig.?2-1?PCR?results?of?DNA?sample?of?liver??M:?DL2,000;?1:?HLJFAdl5;?+:?positive?control;?negative?control??2.3.1.2HLJFAdl5?的?hexon?序歹丨J分析??HLJFAdl5毒株鑒定為FAdV-4之后,設(shè)計(jì)針對(duì)FAdV-4的hexon序列的特??異性引物,擴(kuò)增其全長(zhǎng)hexon序列并進(jìn)行序列分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)HLJFAdl5毒株與??我國(guó)流行JSJ13毒株高度同源(圖2-2)。??1QOr?764?(JN112373}?FAdv^??一t?HG?(GU734104)??-100J?A-2A(AF083975)?fAdv^??L??HBQ12?(KM096545)??43??340?(NC?021221}?FAdv-B??.!〇n??CELO?(U46933)?fa<jv-a??9T???HLJFAd15??cl?JSJ13(KM098544)??1〇〇?KC(EU177545)??—?PB-05(EU931691)?FAdv^??100?100?PK-01?(EU931693)??97????KR5?(HE6C?152)
.3?HLJFAdl5?的?hexon?序歹IJ分析??通過(guò)hexon全長(zhǎng)序列比對(duì),確定HUFAdl5毒株為FAdV-4,鑒于HLJFAdl5??毒株與JSJ13毒株高度同源,我們根據(jù)JSJ13毒株的序列(GenBank序列號(hào):??KM096544)設(shè)計(jì)了?36對(duì)引物,擴(kuò)增了?HUFAdl5毒株的全基因組序列,并上傳??至GenBank?(序列號(hào):KU991797)。通過(guò)全基因組序列分析發(fā)現(xiàn),HLJFAdl5毒??株的基因組在ORF42和ORF43之間存在1966bp的大片段天然缺失(圖2-3),??證實(shí)為我國(guó)新發(fā)的FAdV-4毒株。??29464?35413}???37378p^§:?40115??一—???、.:丨丨丨.:^:?I??????丨..?:..::.;??(HE608152)?處?ORf22?0??27?ORF28??.?酬A??畛??ONI?0W<2?ORT29??(GU188428)???JSJ13??(KM096544)?1?_??—???■■??HB1510??(KU587519)???一一?—??29482?35427?35428?38164???""??????I。?—?—?f88088?*???in?.JJUUU??HLJFAdl5?靈麵??(KU991797)?參?oww?c?m??u?納峰??X?L?|?G叫?I?|???0?2000?4000?6000?8000?10000??圖2-3?HUFAdl?5的1966?bp缺失序列分析??Fig
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Ⅰ亞群禽腺病毒通用PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 肖躍強(qiáng),于雪,劉吉山,楊慧,苗立中,徐晴晴,何誠(chéng),沈志強(qiáng). 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(03)
[2]雞馬立克氏病強(qiáng)弱病毒株P(guān)CR鑒別檢測(cè)方法在診斷中的應(yīng)用評(píng)價(jià)[J]. 呂紅超,張艷萍,孫國(guó)榮,高玉龍,李志杰,鄭惠文,包珂巖,王笑梅,劉長(zhǎng)軍. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(07)
[3]Ⅰ群禽腺病毒SYBR GreenⅠ熒光PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 文艷玲,謝芝勛,王瑩,謝麗基. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2008(09)
[4]禽腺病毒江蘇分離株的細(xì)胞培養(yǎng)特性[J]. 周斌,鄭其升,劉華雷,曹瑞兵,陳溥言. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(02)
碩士論文
[1]禽腺病毒血清4型巢式PCR和環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)方法建立及應(yīng)用[D]. 鐘鳴.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
本文編號(hào):3349388
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