一株豬繁殖與呼吸綜合征病毒的分離鑒定及其基因組特性和致病性分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-15 03:47
豬繁殖與呼吸綜合征(PRRS)是可引起各個(gè)年齡階段豬發(fā)生感染的一種急性高度接觸性傳染病,其病原是豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)。PRRSV給養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的損失。PRRSV自1995年開始在中國出現(xiàn)以來,已持續(xù)流行了近25年,特別是2006年高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病毒(HP-PRRSV)的出現(xiàn),為中國養(yǎng)豬業(yè)帶來了近乎毀滅般的打擊。在與其漫長的斗爭中,各種手段層出不窮,雖在一定程度上控制了PRRSV的肆虐,但目前仍未找到能夠?qū)⑵鋸氐浊宄挠行Т胧┖头揽厥侄。究其原?從基因組角度講,突變及重組是PRRSV不斷進(jìn)化的核心動(dòng)力,PRRSV毒株的快速變異使其產(chǎn)生了譜系眾多的毒株,而不同譜系毒株間親緣關(guān)系較遠(yuǎn),難以實(shí)現(xiàn)合理的交叉保護(hù)。此外,2014年前后出現(xiàn)的NADC30-like型PRRSV具備易于與其他毒株發(fā)生重組的特點(diǎn),進(jìn)一步加劇了PRRSV的防控難度。本研究立足養(yǎng)豬生產(chǎn)實(shí)際,2017年底自山東省某養(yǎng)豬場中采集了疑似PRRSV感染的發(fā)病豬病料,對其進(jìn)行PCR檢測證實(shí)其感染了PRRSV,之后對病料中的病毒進(jìn)行分離,并通過觀測細(xì)胞病變效應(yīng)(CPE)、間接免疫熒光(IFA)等手段驗(yàn)證...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
文獻(xiàn)綜述
第一章 豬繁殖與呼吸綜合征病毒的研究進(jìn)展
1.1 PRRSV的基本概述
1.2 PRRSV的分子流行病學(xué)
1.2.1 PRRSV在國外的流行情況
1.2.2 PRRSV在中國的流行情況
1.2.3 HP-PRRSV在中國范圍內(nèi)的流行情況
1.2.4 NADC30-like毒株在中國的流行情況
1.2.5 重組PRRSV毒株在中國的流行情況
1.3 本研究的目的及意義
試驗(yàn)研究
第二章 臨床樣品中PRRSV新毒株的分離鑒定及進(jìn)化分析
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 引物序列
2.1.2 質(zhì)粒、細(xì)胞、抗體
2.1.3 試驗(yàn)試劑及耗材
2.1.4 主要儀器設(shè)備
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 臨床病料病原PCR檢測
2.2.2 進(jìn)化樹分析
2.2.3 病毒的分離
2.2.4 分離病毒的鑒定
2.2.5 分離病毒的嗜斑純化
2.2.6 分離病毒在Marc145細(xì)胞上的生長曲線測定
2.3 試驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 病料的RT-PCR檢測
2.3.2 病料中PRRSV毒株的GP5、NSP2進(jìn)化分析
2.3.3 分離毒株SD-YL1712在細(xì)胞上的CPE鑒定
2.3.4 分離毒株SD-YL1712在Marc145細(xì)胞上的IFA鑒定
2.3.5 分離毒株SD-YL1712的嗜斑純化
2.3.6 分離毒株SD-YL1712在Marc145細(xì)胞上的生長曲線測定
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第三章 PRRSV SD-YL1712株的基因組特性及致病性分析
3.1 試驗(yàn)材料
3.1.1 全基因組測序引物
3.1.2 參考PRRSV毒株序列信息
3.1.3 基因組分析用到的軟件
3.1.4 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 全基因組序列測定
3.2.2 SD-YL1712毒株全基因組特性分析
3.2.3 分離病毒的致病性分析
3.3 試驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 SD-YL1712毒株全基因組核酸及氨基酸分析
3.3.2 SD-YL1712分離株基因組進(jìn)化分析
3.3.3 SD-YL1712分離株基因組重組分析
3.3.4 SD-YL1712分離株致病性分析
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第四章 結(jié)論
附錄
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡介
本文編號(hào):3343790
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
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摘要
ABSTRACT
文獻(xiàn)綜述
第一章 豬繁殖與呼吸綜合征病毒的研究進(jìn)展
1.1 PRRSV的基本概述
1.2 PRRSV的分子流行病學(xué)
1.2.1 PRRSV在國外的流行情況
1.2.2 PRRSV在中國的流行情況
1.2.3 HP-PRRSV在中國范圍內(nèi)的流行情況
1.2.4 NADC30-like毒株在中國的流行情況
1.2.5 重組PRRSV毒株在中國的流行情況
1.3 本研究的目的及意義
試驗(yàn)研究
第二章 臨床樣品中PRRSV新毒株的分離鑒定及進(jìn)化分析
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 引物序列
2.1.2 質(zhì)粒、細(xì)胞、抗體
2.1.3 試驗(yàn)試劑及耗材
2.1.4 主要儀器設(shè)備
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 臨床病料病原PCR檢測
2.2.2 進(jìn)化樹分析
2.2.3 病毒的分離
2.2.4 分離病毒的鑒定
2.2.5 分離病毒的嗜斑純化
2.2.6 分離病毒在Marc145細(xì)胞上的生長曲線測定
2.3 試驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 病料的RT-PCR檢測
2.3.2 病料中PRRSV毒株的GP5、NSP2進(jìn)化分析
2.3.3 分離毒株SD-YL1712在細(xì)胞上的CPE鑒定
2.3.4 分離毒株SD-YL1712在Marc145細(xì)胞上的IFA鑒定
2.3.5 分離毒株SD-YL1712的嗜斑純化
2.3.6 分離毒株SD-YL1712在Marc145細(xì)胞上的生長曲線測定
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第三章 PRRSV SD-YL1712株的基因組特性及致病性分析
3.1 試驗(yàn)材料
3.1.1 全基因組測序引物
3.1.2 參考PRRSV毒株序列信息
3.1.3 基因組分析用到的軟件
3.1.4 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 全基因組序列測定
3.2.2 SD-YL1712毒株全基因組特性分析
3.2.3 分離病毒的致病性分析
3.3 試驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 SD-YL1712毒株全基因組核酸及氨基酸分析
3.3.2 SD-YL1712分離株基因組進(jìn)化分析
3.3.3 SD-YL1712分離株基因組重組分析
3.3.4 SD-YL1712分離株致病性分析
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第四章 結(jié)論
附錄
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致謝
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