赤水烏骨雞是貴州省優(yōu)良地方雞種,具有黑羽、烏骨兩個(gè)主要特征,但生產(chǎn)中發(fā)現(xiàn)其烏度在個(gè)體間的變異度較大,為了探討造成赤水烏骨雞烏度變異的分子機(jī)理,本研究以赤水烏骨雞為研究對(duì)象,泰和烏雞為對(duì)照,采用PCR直接測(cè)序技術(shù)篩選赤水烏骨雞MC1R、TYR和MITF基因啟動(dòng)子區(qū)和外顯子區(qū)SNPs位點(diǎn),并與不同組織中黑色素相關(guān)物質(zhì)含量進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析。同時(shí)利用熒光定量PCR技術(shù)分析了MC1R、TYR、MITF基因在不同品種不同組織中表達(dá)情況。研究主要結(jié)果如下:1.MC1R、TYR和MITF基因SNPs篩選對(duì)MC1R、TYR和MITF基因啟動(dòng)子區(qū)和外顯子區(qū)共設(shè)計(jì)了24對(duì)引物,經(jīng)PCR擴(kuò)增測(cè)序共發(fā)現(xiàn)赤水烏骨雞MC1R基因SNPs 16個(gè)（其中啟動(dòng)子區(qū)12個(gè),外顯子區(qū)4個(gè)）;泰和烏雞23個(gè)（其中啟動(dòng)子區(qū)15個(gè),外顯子區(qū)8個(gè)）;赤水烏骨雞TYR基因SNPs 7個(gè)（其中啟動(dòng)子區(qū)2個(gè),內(nèi)含子5個(gè)）;泰和烏雞6個(gè)（其中啟動(dòng)子區(qū)2個(gè),外顯子區(qū)2個(gè),內(nèi)含子2個(gè)）;赤水烏骨雞MITF基因SNPs位點(diǎn)18個(gè)（其中啟動(dòng)子區(qū)2個(gè),外顯子區(qū)1個(gè),內(nèi)含子15個(gè)）;泰和烏雞21個(gè)（其中啟動(dòng)子區(qū)2個(gè),外顯子區(qū)1個(gè),內(nèi)含子18個(gè)）。2.赤水... 

【文章來(lái)源】：貴州大學(xué)貴州省 211工程院校

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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MC1R基因啟動(dòng)子區(qū)預(yù)測(cè)

圖 2-3 MC1R 基因核心啟動(dòng)子區(qū)預(yù)測(cè)（Promoter 2.0）-3 MC1R gene core promoter region prediction（Promoter 2.0）物：MC1R 基因（GenBank：NM_001031462.1）通測(cè)軟件進(jìn)行預(yù)測(cè)，Promoter SCAN 和 Neural Netw測(cè)的區(qū)域相同，其引物為 MC1Ra，Promoter 2.0 軟C1Rb；TYR 基因（GenBank：XM_015279812.2）和_015292966.2）基因核心啟動(dòng)子區(qū)參照劉小輝（201物詳細(xì)信息見(jiàn)表 2-4：表 2-3 啟動(dòng)子在線預(yù)測(cè)軟件Tab. 2-3 Promoter online prediction software件 網(wǎng)站ter 2.0 http://www.cbs.dtu.dk/index.er SCAN http://www-bimas.cit.nih.gov/indromoter Prediction http://www.fruitfly.org/seq_tools/pr表 2-4 MC1R、TYR 及 MITF 基因核心啟動(dòng)子引物信息-4 MC1R, TYR and MITF gene core promoter primer informatio

貴州大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位論文T-PCR 反應(yīng)體系見(jiàn)表 2-10，RT-PCR 反應(yīng)程序見(jiàn)圖 2-4。表 2-10 MC1R、TYR、MITF 基因 RT-PCR 反應(yīng)體系Tab. 2-10 MC1R, TYR, MITF gene RT-PCR reaction system試劑 體積/μLSYBR SELECT MASTER MIX 5ddH2O /μL 2.5c DNA 模板/μL 1上、下游引物/μL 0.75Total 10


本文編號(hào)：3320969